Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: NW_019167826.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_1, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  36299135

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   

This is table  46  of  402  ( 48166 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8992282--8992341
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1
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1.00
8992265--8992331
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2.5
26
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2
2
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1.13
8992237--8992341
26
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1
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1.11
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1
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2.8
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22
1
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73
1.06
9004515--9004562
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0
2
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10
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10
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1.80
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2.1
14
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0
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16
0
0
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0.65
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4.1
19
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5.0
13
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96
14
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0
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0
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2
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0
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50
2
0
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0
2
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1.02
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4.0
24
75
13
85
27
2
2
68
1.12
9014348--9014417
20
3.5
20
81
16
74
27
0
2
70
1.02
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20
3.5
19
83
16
80
26
0
1
71
0.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9019239--9019272
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1.9
18
88
5
52
70
0
5
23
1.09
9020144--9020217
22
3.4
22
71
0
67
27
9
27
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1.87
9020292--9020343
21
2.4
21
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9
70
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15
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1.9
14
100
0
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29
14
22
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2.1
104
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256
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16
17
35
1.92
9021168--9021196
14
2.1
14
100
0
58
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17
20
27
1.95
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131
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3
446
21
18
10
50
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1.9
35
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0
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0
0
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11
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17
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2.0
13
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15
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0
0
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1.9
17
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11
50
45
6
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1.9
158
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10
18
35
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11.1
40
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10
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10
17
35
1.85
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2.7
20
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11
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17
1
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0.80
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77
11
50
0
18
2
80
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20
3.2
20
75
12
60
3
12
1
83
0.84
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17
1.9
18
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5
52
5
23
0
70
1.09
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10
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10
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59
5
14
2
78
1.03
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3.6
7
100
0
50
0
0
12
88
0.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3
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0
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0
0
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0.90
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50
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2
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0
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70
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1.54
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2.5
15
86
0
58
52
7
13
26
1.67
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23
2.5
23
91
0
96
56
12
7
24
1.61
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27
2.1
28
81
9
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3
1
44
1.28
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2.8
31
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10
99
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3
0
50
1.18
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1.9
33
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101
47
3
0
49
1.18
9074562--9074622
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1.9
30
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77
47
3
0
49
1.18
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14.0
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10
9
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9075059--9075935
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4.7
188
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10
9
34
1.70
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3.2
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9
6
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1.59
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2.5
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11
164
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3
16
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1.65
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2.6
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3
16
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0
4
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2.6
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7
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1.49
9088734--9088954
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13
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27
6
6
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0
78
29
0
2
68
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59
4.7
59
89
4
406
39
13
5
41
1.68
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9092952--9093233
119
2.4
118
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3
433
39
13
5
41
1.68
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2
0
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21
2.3
21
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12
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80
2
0
18
0.82
9094158--9094250
23
4.0
24
78
9
86
60
1
3
35
1.20
9094167--9094250
3
25.3
3
70
17
51
60
1
3
34
1.21
9094202--9094268
7
9.3
7
80
15
57
68
0
1
29
0.98
9094158--9094260
27
3.7
27
77
12
93
62
0
2
33
1.17
9094167--9094250
7
12.7
6
71
16
51
60
1
3
34
1.21
9094158--9094267
54
2.0
54
81
6
125
63
0
2
32
1.15
9094448--9094650
41
4.9
41
85
5
228
36
19
17
25
1.94
9095694--9095742
15
3.3
15
82
2
64
6
10
0
83
0.80
9095681--9095742
30
2.1
29
82
11
72
8
12
0
79
0.94
9102955--9102995
15
2.8
15
88
3
57
51
4
21
21
1.67
9104739--9104790
20
2.6
20
79
11
54
19
28
25
26
1.98
9105255--9105308
25
2.2
24
83
6
63
35
5
18
40
1.74
9105317--9105387
31
2.3
31
85
0
97
26
23
23
25
2.00
9105440--9105485
20
2.3
20
92
3
76
26
28
21
23
1.99
9105819--9105871
21
2.7
19
83
11
70
13
1
3
81
0.92
9105821--9105862
13
3.3
13
83
3
50
11
2
4
80
0.95
9105818--9105884
33
2.0
33
82
5
82
16
1
7
74
1.11
9105944--9106231
59
4.8
59
86
11
392
44
7
13
34
1.73
9105950--9106231
124
2.4
115
87
10
383
44
7
14
34
1.73
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9110105--9110163
27
2.1
28
84
3
75
52
3
11
32
1.54
9120590--9120620
8
3.9
8
95
0
53
64
0
0
35
0.94
9120590--9120637
16
2.9
16
87
3
60
64
0
0
35
0.94
9120588--9120642
8
6.8
8
84
12
51
65
0
0
34
0.93
9120595--9120643
8
5.7
9
83
11
59
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0
0
32
0.91
9120593--9120643
17
3.1
17
88
2
68
66
0
0
33
0.92
9120708--9120747
19
2.1
19
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0
53
50
32
15
2
1.57
9123006--9123061
28
2.0
28
89
0
85
33
5
32
28
1.80
9123302--9123344
17
2.6
16
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7
59
72
0
2
25
0.97
9123643--9123688
19
2.4
18
85
7
56
41
17
15
26
1.88
9125573--9126174
157
3.8
157
93
2
973
37
18
15
29
1.91
9125573--9126174
312
1.9
310
92
3
1003
37
18
15
29
1.91
9126179--9126252
11
5.8
12
72
18
53
83
5
4
6
0.89
9126223--9126253
1
31.0
1
100
0
62
100
0
0
0
0.00
9126586--9126631
20
2.3
20
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0
56
17
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1.96
9126649--9126690
20
2.1
20
95
0
75
7
26
30
35
1.83
9127568--9127659
1
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1
75
0
76
6
0
6
86
0.69
9127560--9127659
19
5.1
20
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11
109
7
0
7
86
0.72
9127570--9127660
22
4.0
22
79
13
96
6
0
7
85
0.73
9127668--9128437
40
19.0
40
92
5
1237
38
21
18
21
1.93
9127668--9128437
82
9.5
80
92
4
1237
38
21
18
21
1.93
9127668--9128437
324
2.4
322
94
3
1321
38
21
18
21
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9129625--9129691
10
6.9
10
75
20
54
7
16
0
76
1.01
9129625--9129672
22
2.2
22
92
0
78
4
16
0
79
0.89
9129635--9129687
27
2.0
27
85
7
72
5
15
0
79
0.91
9133256--9133877
160
3.9
159
94
1
1045
38
17
14
28
1.90
9133256--9133877
316
2.0
313
92
2
1046
38
17
14
28
1.90
9133909--9133941
15
2.1
16
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5
59
90
0
0
9
0.44
9133824--9134423
304
2.0
302
98
0
1173
33
20
29
16
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9134580--9134625
20
2.3
20
84
0
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2.4
20
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0
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6
27
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1.82
9134649--9134693
20
2.2
20
84
0
54
13
24
33
28
1.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402