Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: NW_019167826.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_1, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  36299135

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   

This is table  249  of  402  ( 48166 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24615128--24615170
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11
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28
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2.0
26
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30
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1.98
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2.0
26
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24
22
22
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1
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0
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5
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13
0.86
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28
22
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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26
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1.97
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2.0
26
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1.99
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26
2.0
26
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28
28
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1.97
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26
2.0
26
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7
90
26
24
20
28
1.99
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31
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3
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1.00
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0
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17
14
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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25
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1.31
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1
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1.28
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1
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1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Size
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Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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50
1.09
24698536--24698604
21
3.2
21
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63
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2
1
47
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8
11.2
8
76
19
66
52
2
2
42
1.25
24698702--24698772
26
2.6
26
82
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70
54
1
1
42
1.17
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32
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31
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14
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1
1
43
1.14
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3
1
50
1.28
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15
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15
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0
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0
0
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1.00
24699161--24699221
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0
0
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1.00
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18
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2
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47
1.14
24699717--24699755
18
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18
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2
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41
1.45
24700339--24700390
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16
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1.19
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17
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6
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1.9
23
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51
0
2
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1.13
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15
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2
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1.26
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2.1
19
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0
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22
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0
0
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2.0
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0
0
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1.00
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21
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2
0
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24703319--24703411
40
2.3
39
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109
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2
0
54
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24703335--24703414
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3.9
20
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43
2
0
53
1.14
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21
3.0
20
74
19
58
53
1
1
42
1.19
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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0
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40
1
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14
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14
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0
0
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1.00
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0
0
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1.00
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0
0
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0
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0
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180
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1.68
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0
1
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19
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0
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20
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50
0
0
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25
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1.27
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19
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0
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1.14
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2.3
21
82
10
53
55
2
0
42
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24713194--24713232
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20
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0
0
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178
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39
8
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1.69
24714386--24714442
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17
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5
0
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2.0
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1
0
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1
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2
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11
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42
0
6
51
1.26

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402