Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: NW_019167826.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_1, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  36299135

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   

This is table  36  of  402  ( 48166 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7390429--7390475
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19
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2.3
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20
21
11
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0
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0
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1
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1.55
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2.5
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142
52
25
1
21
1.56
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15
7.8
16
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48
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2
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1.63
7414815--7414873
20
2.9
21
71
14
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50
1
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1.43
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3.2
21
70
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55
4
4
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1.40
7415630--7416314
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3.2
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10
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6
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5
10
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21
3.0
21
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13
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4
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0
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0
0
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36
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0
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38
12
22
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7421273--7421470
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71
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4
245
22
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1.85
7421340--7421453
36
3.2
36
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27
38
10
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1.88
7421666--7421860
66
2.9
66
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13
186
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41
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22
1.82
7422056--7422202
78
1.9
78
81
2
179
29
35
10
25
1.89
7422252--7422492
75
3.3
73
73
19
180
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1.87
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2.4
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22
2.0
22
90
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11
13
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1.80
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22
2.0
22
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0
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11
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1.80
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22
2.0
22
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0
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31
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13
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1.9
18
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0
0
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2.2
16
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5
63
77
0
0
22
0.78
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2
0
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39
19
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31
1.84
7438803--7438986
99
1.8
99
85
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255
39
18
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1.83
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12
3.2
12
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0
15
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2.1
25
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95
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1.51
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25
2.2
25
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1.59
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2
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0
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16
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29
0
0
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0.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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13
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0
0
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10
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56
29
0
2
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1.02
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0
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2.0
22
100
0
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9
9
13
68
1.40
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3.0
152
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6
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1.63
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143
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7
9
44
1.63
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3.1
18
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10
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29
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31
1.51
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2.2
52
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12
133
53
8
4
33
1.52
7462251--7462362
24
4.6
24
80
16
122
53
8
4
33
1.52
7462251--7462382
24
5.4
24
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119
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4
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1.53
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40
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1.89
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0
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11
0
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18
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0
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53
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2
34
1.47
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2.0
43
82
11
104
55
10
2
31
1.47
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7475018--7475189
48
3.7
48
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9
153
53
9
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1.50
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24
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24
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1.46
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24
4.3
23
81
2
87
55
10
3
29
1.52
7475159--7475272
47
2.4
47
79
2
120
56
11
3
28
1.51
7475344--7475427
19
4.4
19
70
5
62
78
4
4
11
1.06
7478692--7478721
15
2.1
14
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51
60
3
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34
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34
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39
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36
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68
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23
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0
20
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22
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0
14
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1.11
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10
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0
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10
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10
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1.68
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320
2.0
321
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39
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1.80
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59
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58
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408
35
12
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1.67
7484402--7484675
58
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58
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5
401
35
12
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46
1.67
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12
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11
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0
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0
5
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25
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26
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0
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0
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16
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4
0
38
1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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56
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2
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16
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15
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60
2
2
33
1.25
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9
6.2
9
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12
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1
8
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0
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0
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0
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15
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7491887--7491964
20
4.1
19
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0
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15
0.90
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9
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0
5
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1.9
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20
2.3
20
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12
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4
0
12
84
0.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7494862--7494928
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2.3
30
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2
0
10
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5
0
10
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41
20.0
42
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17
22
1.95
7494936--7495754
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10.0
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22
17
22
1.95
7494936--7495754
370
2.2
364
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4
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36
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5
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0
78
0.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402