Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: NW_019167826.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_1, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  36299135

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   

This is table  19  of  402  ( 48166 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.9
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83
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292
26
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2.2
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126
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329
26
10
16
46
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0.98
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17
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41
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16
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1.9
21
89
0
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35
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3.5
11
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3.0
20
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1.97
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2.3
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22
25
23
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2.4
19
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0
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24
28
22
24
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1
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28
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13
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10
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12
1
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13
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1
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27
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0
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24
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0
61
0.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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11
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18
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0
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24
2.3
23
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15
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15
5
1
1.04
4550532--4550561
8
3.8
8
95
0
51
80
0
3
16
0.85
4551091--4551124
12
2.9
11
87
12
50
26
0
2
70
1.01
4551582--4551666
30
2.9
29
88
8
120
65
3
1
29
1.16
4553108--4553183
16
4.6
17
75
22
65
19
6
2
71
1.21
4557732--4557877
26
5.5
26
71
20
106
32
5
0
60
1.24
4557722--4557872
14
11.7
13
66
18
59
33
5
0
60
1.24
4557807--4557870
22
3.0
23
86
6
73
31
4
0
64
1.14
4557732--4557875
54
2.7
54
86
6
195
33
4
0
61
1.22
4558125--4558175
23
2.1
24
82
13
61
19
0
17
62
1.32
4558746--4558816
15
4.4
16
84
11
101
15
1
1
81
0.83
4558746--4558823
5
15.2
5
77
17
72
15
1
1
82
0.81
4558748--4558823
6
13.5
6
75
16
74
14
1
1
82
0.79
4558842--4559121
60
4.8
58
81
9
318
40
7
14
37
1.74
4558842--4559121
118
2.4
115
85
6
366
40
7
14
37
1.74
4558842--4559121
58
4.8
58
83
6
341
40
7
14
37
1.74
4562858--4562918
12
5.2
11
78
18
61
75
1
1
21
0.98
4562853--4562918
17
3.8
17
81
16
73
74
3
1
21
1.04
4571574--4571639
24
2.6
26
81
16
93
18
1
13
66
1.32
4572917--4573051
68
2.0
67
82
1
162
18
10
25
45
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
4575197--4575246
24
2.1
24
85
3
66
26
32
10
32
1.89
4576115--4576156
17
2.5
17
88
0
66
11
0
16
71
1.14
4576176--4576200
13
1.9
13
100
0
50
24
0
16
60
1.36
4579878--4579934
24
2.4
24
96
0
105
56
0
10
33
1.34
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15
2.2
16
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5
52
38
0
0
61
0.96
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7
5.7
7
90
3
53
15
2
0
81
0.80
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17
2.6
19
76
16
53
23
0
2
73
0.94
4583476--4583559
30
2.9
29
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8
118
66
3
1
28
1.15
4585001--4585067
16
4.0
17
75
25
63
20
7
2
68
1.28
4586088--4586122
4
8.2
4
87
12
52
25
0
0
74
0.82
4589635--4589697
3
18.3
3
76
23
54
31
6
0
61
1.21
4589609--4589675
33
2.0
33
88
5
100
31
4
1
62
1.24
4589644--4589713
22
3.2
22
97
0
131
32
7
0
60
1.24
4589560--4589706
55
2.6
57
82
10
162
34
6
1
58
1.31
4590544--4590579
7
5.3
7
93
6
65
27
0
0
72
0.85
4590548--4590670
10
12.8
10
72
20
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24
1
4
69
1.14
4590603--4590679
6
12.5
6
75
13
68
16
2
2
77
0.99
4590601--4590689
10
8.9
9
73
19
54
16
2
3
77
1.01
4590703--4590857
56
2.7
56
80
10
163
47
5
12
33
1.66
4592265--4592311
21
2.2
21
100
0
94
44
14
19
21
1.86
4601376--4601430
25
2.2
25
86
0
74
80
0
9
10
0.92
4602467--4602690
83
2.7
82
86
4
290
25
16
20
36
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
4602450--4602733
124
2.3
128
81
9
336
25
16
20
37
1.93
4602437--4602733
41
7.1
41
83
6
280
25
16
20
37
1.93
4602926--4602979
10
5.2
11
77
6
51
20
1
0
77
0.86
4603016--4603104
24
3.8
24
79
5
110
30
6
1
61
1.29
4602956--4603120
48
3.4
49
76
17
148
29
5
1
63
1.27
4603413--4603459
20
2.3
20
79
17
53
31
6
14
46
1.70
4603933--4603996
3
21.0
3
87
9
94
32
1
1
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1.13
4604018--4604086
19
3.4
20
77
14
70
13
2
2
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0.92
4604041--4604086
11
3.8
12
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13
60
8
2
4
84
0.83
4604041--4604086
13
3.8
13
81
18
55
8
2
4
84
0.83

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402