Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: NW_019167826.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_1, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  36299135

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   

This is table  29  of  402  ( 48166 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6431204--6431406
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0
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10
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2
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3
66
1.30
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0
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1.00
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2.0
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215
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18
2.0
18
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0
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72
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1.27
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1.9
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2.1
16
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1.61
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2.2
27
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2.3
39
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14
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46
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6462726--6462790
20
3.3
20
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12
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44
10
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1.64
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20
3.6
19
77
11
61
44
10
8
37
1.69
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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12
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1.63
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27
2.7
26
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18
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76
6
2
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1.10
6463588--6463656
20
3.5
20
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23
0
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1.32
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20
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66
2
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10
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19
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1.25
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18
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18
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100
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1
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5
0
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1.25
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5
0
60
1.25
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21
2.8
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6
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1.28
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17
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18
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14
70
31
4
0
63
1.15
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1.9
90
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10
217
30
5
1
62
1.26
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42
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110
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7
1
67
1.24
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2.2
17
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56
27
0
2
69
1.02
6466011--6466180
60
2.9
56
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10
223
43
5
11
38
1.66
6466140--6466226
43
2.0
43
95
4
158
47
2
16
34
1.59
6466035--6466183
60
2.5
59
95
2
264
42
5
14
37
1.68
6466080--6466283
101
2.0
103
87
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301
42
3
15
38
1.65
6466035--6466208
60
3.0
57
84
9
219
43
5
12
39
1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6466183--6466355
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2.9
58
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16
151
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15
37
1.74
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161
1.9
159
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11
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14
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1.70
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21
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2
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1.83
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2
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0
50
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0
0
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118
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12
28
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102
22
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30
44
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15
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59
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0
4
6
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2.0
23
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4
0
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0
58
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0
0
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1
2370
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18
9
36
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3.9
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176
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14
12
28
1.82
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190
43
14
12
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1.81
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11
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74
0
5
18
1.07
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3.2
29
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16
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77
0
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16
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0
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2.1
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59
4
0
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23
1.9
22
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63
4
0
31
1.14
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10
4.9
10
78
16
57
44
10
34
10
1.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6511827--6511870
20
2.1
21
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38
9
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1.73
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25
2.3
24
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71
12
3
6
77
1.09
6511916--6511966
24
2.1
23
85
7
66
13
3
5
76
1.11
6512461--6512507
3
15.7
3
95
0
85
65
2
0
31
1.04
6513664--6513903
64
3.8
64
71
9
186
35
14
15
34
1.89
6513658--6513903
127
2.0
126
88
1
368
36
14
15
33
1.88
6513990--6514061
35
2.1
35
86
0
99
31
8
23
36
1.85
6517211--6517288
12
6.3
12
76
5
84
44
29
6
19
1.75
6517202--6517286
25
3.4
24
85
4
107
44
27
7
21
1.77
6517202--6517274
13
5.7
13
75
8
69
45
27
6
20
1.76
6517850--6518122
62
4.4
62
72
10
198
39
10
12
36
1.78
6518023--6518203
65
2.9
62
74
7
166
38
10
16
34
1.83
6518150--6519133
502
2.0
502
85
4
1333
40
12
11
35
1.80
6518605--6518729
62
2.0
62
84
3
162
44
12
12
31
1.78
6525239--6525554
162
2.0
162
87
3
458
32
9
14
42
1.79
6525592--6525634
18
2.4
19
84
11
63
44
13
6
34
1.72
6538394--6538443
19
2.7
18
81
3
55
26
4
2
68
1.18
6539722--6539784
10
6.2
10
77
3
72
38
11
41
9
1.73
6539718--6539787
31
2.3
31
89
0
104
35
10
44
10
1.72
6539722--6539780
21
2.9
21
75
5
59
38
11
38
10
1.76
6539826--6539912
8
11.0
8
78
11
83
12
2
3
81
0.91
6539826--6539912
15
5.5
15
80
14
104
12
2
3
81
0.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6540406--6540436
3
10.3
3
92
0
53
64
0
3
32
1.09
6541639--6541849
63
3.3
61
72
13
176
36
15
14
34
1.87
6541600--6541840
127
1.9
127
86
0
349
40
14
13
31
1.85
6541589--6541869
127
2.2
126
82
3
348
40
13
12
33
1.83
6545151--6545253
12
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12
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5
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1.74
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25
3.2
25
85
0
104
46
22
5
25
1.72
6545107--6545228
62
2.0
62
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3
138
47
24
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21
1.74
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28
2.6
28
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0
126
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1.63
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31
2.0
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12
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160
2.2
160
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4
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34
10
13
40
1.80
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20
2.0
20
100
0
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24
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16
20
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21
3.8
21
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0
106
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16
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21
1.88
6554701--6554784
42
2.0
42
95
0
150
45
19
16
19
1.86
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21
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0
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43
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1.87
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14
3.1
14
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6
54
54
6
0
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12
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28
0
4
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1.12
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25
1.9
26
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4
73
42
4
0
53
1.20
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52
2.5
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11
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40
5
12
40
1.66
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51
2.5
51
83
8
158
40
6
12
41
1.67
6565656--6565769
51
2.2
52
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4
160
40
7
12
40
1.70
6566287--6566329
18
2.5
17
82
14
52
11
2
4
81
0.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6566281--6566329
23
2.1
23
84
0
62
10
4
4
81
0.95
6566340--6566382
22
2.0
22
86
9
61
18
11
0
69
1.17
6570527--6570573
16
2.9
16
78
15
51
80
4
10
4
0.98
6571627--6571895
86
3.1
85
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1
324
33
20
11
34
1.88
6572902--6572963
19
3.3
18
76
15
63
14
6
0
79
0.93
6572924--6573016
6
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6
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2
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1.15
6572922--6572963
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13
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0
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0.90
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1
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1.00
6572941--6573005
22
2.9
24
72
21
68
20
7
3
69
1.27

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402