Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: NW_019167826.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_1, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  36299135

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   

This is table  9  of  402  ( 48166 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1578244--1578273
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0
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201
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2.0
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26
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26
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0
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0
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16
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3.5
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11
54
82
2
13
2
0.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1
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1689900--1689955
23
2.5
23
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26
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61
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2.2
24
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2.0
27
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18
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16
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2.1
19
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53
25
0
0
74
0.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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11
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0
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1.20
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2.4
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0
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2.1
34
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12
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1
1
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2.0
24
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30
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0
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0
0
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0
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37
0
0
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2
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0
67
0
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1802857--1802883
13
2.1
13
100
0
54
62
7
14
14
1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1803523--1803549
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2
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0
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0
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0
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0
50
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55
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5
32
1.50
1819603--1819639
18
2.1
18
94
0
65
29
0
0
70
0.88
1819634--1819770
61
2.3
60
83
3
168
53
1
0
44
1.14
1819692--1819750
22
2.6
24
76
13
70
50
0
0
49
1.00
1820607--1820681
13
6.2
12
69
21
50
61
0
1
37
1.05
1823537--1823601
23
2.8
23
84
11
71
26
1
4
67
1.18
1823561--1823603
11
3.8
11
77
17
52
25
2
2
69
1.12
1824516--1824558
22
2.0
22
100
0
86
41
9
18
30
1.82
1835186--1835251
30
2.2
31
83
8
82
50
6
0
43
1.27
1839867--1839908
14
2.9
15
89
6
61
30
0
4
64
1.14
1840172--1840228
31
1.9
31
85
7
82
54
3
1
40
1.28
1841350--1841398
18
2.8
16
77
17
53
53
2
0
44
1.12
1841351--1841446
49
2.0
45
82
11
113
50
1
0
48
1.07
1841359--1841450
24
4.1
21
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17
71
50
0
0
50
1.00
1841454--1841483
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15
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33
0
0
66
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0
0
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10
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0
0
36
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99
1.9
99
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0
349
36
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10
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1.80
1858954--1858980
13
2.1
13
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0
54
51
0
0
48
1.00
1858923--1858992
12
5.8
11
72
22
52
41
0
2
55
1.14
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1859006--1859048
22
2.0
22
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0
59
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4
2
46
1.36
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16
3.6
16
80
2
69
44
0
0
55
0.99
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31
2.8
30
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12
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44
0
1
54
1.07
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16
2.3
16
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0
56
48
0
0
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1.00
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10
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2.1
14
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0
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0
0
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1.00
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2.1
19
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1.80
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2.0
65
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20
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20
2.1
20
100
0
84
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9
4
42
1.58
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2.0
34
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0
0
51
1.00
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0
3
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20
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54
0
0
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1.00
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20
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20
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7
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0
0
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22
2.8
22
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7
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49
0
0
50
1.00
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1
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1.30
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17
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2
2
47
1.25
1900559--1900623
11
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11
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12
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1
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1.26
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43
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42
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13
104
49
0
1
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1.19
1900666--1900720
23
2.4
23
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0
0
45
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2.5
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56
0
0
43
0.99
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27
2.0
27
92
0
88
18
7
26
47
1.75
1917674--1917743
27
2.6
27
86
0
86
21
8
24
45
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1918015--1918070
26
2.4
22
88
11
76
21
10
19
48
1.79
1922818--1922851
2
17.0
2
93
0
59
52
0
0
47
1.00
1922953--1923033
28
2.9
28
77
14
87
50
4
0
44
1.23
1923230--1923302
30
2.5
29
80
4
92
54
6
2
35
1.41
1923249--1923311
30
2.1
31
88
8
94
49
4
1
44
1.33
1923942--1923994
21
2.5
21
84
9
63
56
0
3
39
1.17
1924307--1924348
21
2.0
21
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0
66
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0
0
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0.99
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2.0
13
100
0
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0
0
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19.5
2
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0
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0
2
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1.15
1951417--1951623
81
2.6
81
88
1
299
45
37
10
6
1.65

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402