Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: NW_019167826.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_1, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  36299135

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   

This is table  37  of  402  ( 48166 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7497054--7497078
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0
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2.0
26
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2.0
24
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28
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24
10
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2.2
25
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0
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10
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1
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1.59
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11
2.6
12
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53
10
0
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1.9
33
86
0
90
47
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1.55
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22
3.5
22
75
17
82
43
8
9
38
1.67
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7539620--7539657
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2.1
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10
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41
2.4
42
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8
132
46
10
7
37
1.65
7541456--7541590
21
6.2
23
79
10
124
54
8
5
31
1.54
7541662--7541721
15
4.3
14
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14
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5
0
20
0.99
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17
3.2
19
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15
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57
20
0
22
1.41
7542160--7542220
17
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17
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59
19
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21
1.39
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23
2.3
23
100
0
104
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26
3
17
1.62
7542202--7542270
23
3.0
23
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2
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28
2
14
1.55
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11
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2.2
12
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0
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0
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35
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10
35
1.80
7545450--7545501
22
2.5
20
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61
15
5
1
76
1.05
7545649--7545732
22
3.7
22
73
17
91
52
8
32
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1.59
7547954--7548305
118
3.0
116
87
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485
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13
33
1.72
7547954--7548305
60
6.0
60
78
10
345
45
7
13
33
1.72
7547954--7548305
119
3.0
118
90
5
507
45
7
13
33
1.72
7552766--7553187
42
10.1
41
88
4
596
23
16
22
36
1.94
7553212--7553446
120
1.9
123
88
5
361
42
11
16
29
1.84
7553207--7553476
120
2.2
122
84
5
357
47
11
15
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1.79
7553631--7553661
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2.1
15
93
0
53
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0
77
0.90
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3.7
22
69
12
71
54
5
30
8
1.54
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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47
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2
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1.44
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173
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8
12
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1.73
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3.2
32
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44
9
13
32
1.75
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117
4.8
116
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5
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45
8
12
33
1.73
7556145--7556715
235
2.4
237
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45
8
12
33
1.72
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2.0
23
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13
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61
7
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1.42
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2.9
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18
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8
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23
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1.51
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2.0
106
100
0
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13
3
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10.8
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53
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5
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1.20
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2.0
20
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13
8
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15
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15
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2
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10
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18
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29
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98
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3
257
26
21
16
36
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7601288--7601318
2
15.5
2
93
0
53
54
0
45
0
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22
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0
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9
9
44
1.69
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95
1.8
95
87
2
247
26
15
15
42
1.87
7608964--7609030
33
2.0
33
97
0
125
50
19
5
23
1.69
7616577--7616623
17
2.8
17
81
9
53
59
17
0
23
1.37
7622617--7622646
9
3.2
9
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4
51
63
0
0
36
0.95
7622619--7622648
10
3.1
10
95
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63
0
0
36
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7622616--7622662
19
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20
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0
0
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26
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86
60
3
1
35
1.23
7624838--7624871
15
2.3
15
95
5
61
20
0
0
79
0.73
7637642--7637692
9
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8
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5
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7637643--7637700
24
2.3
24
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0
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12
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79
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7638844--7638902
21
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38
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1.68
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17
6.8
17
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3
72
31
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12
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1.81
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43
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10
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19
1.90
7648547--7648665
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35
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1.88
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4.2
65
80
6
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41
10
13
34
1.78
7652815--7652994
66
2.7
66
90
4
240
45
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1.75
7652725--7653136
63
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40
8
14
36
1.78
7652696--7653088
191
2.1
189
80
8
422
40
10
14
35
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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21
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9
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75
2
0
21
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7653476--7653517
21
2.0
21
86
9
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2
0
23
0.94
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127
1.8
129
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39
10
11
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123
3.3
126
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13
317
39
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13
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1.79
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2.0
125
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1.79
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7660719--7661441
321
2.2
320
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0
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0
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19
1.68
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19
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19
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2
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24
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38
1.74
7668623--7668750
49
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156
39
8
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4
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0
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21
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2
1
25
1.05
7673029--7673100
26
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26
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70
1
1
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1.03
7675106--7675148
21
2.0
21
100
0
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18
9
9
1.51
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28
1.9
28
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0
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14
1.60
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36
3.0
36
81
0
133
60
14
12
12
1.59
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7675705--7675748
22
2.0
23
86
4
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56
11
22
9
1.62
7677009--7677062
26
2.1
26
82
0
63
57
16
3
22
1.55
7677053--7677087
14
2.4
15
90
4
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45
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11
1.76
7677067--7677154
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14
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48
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7681199--7681241
3
14.3
3
80
0
50
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0
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23
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3
1
34
1.21
7690674--7690739
16
4.3
15
79
11
71
60
3
1
34
1.21

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402