Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: NW_019167826.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_1, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  36299135

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   

This is table  248  of  402  ( 48166 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24543945--24543997
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26
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1.98
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1.98
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28
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1.98
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21
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2.0
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18
26
1.98
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2.6
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1.98
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26
2.0
26
85
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72
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26
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2.0
26
92
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28
28
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2.0
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72
28
24
18
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1.98
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2.2
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1.98
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2.0
26
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27
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24
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2.1
606
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1
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29
22
1.99
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2.0
26
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72
28
28
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24
1.98
24555147--24555199
26
2.0
26
89
7
81
26
24
20
28
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
26
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0
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28
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1.98
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1.8
206
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27
25
1.99
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158
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27
29
23
1.98
24558218--24558270
26
2.0
26
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7
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28
28
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1.98
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2.0
26
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1.99
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2.0
26
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17
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1.96
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26
2.2
26
90
0
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26
25
21
26
1.99
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29
22
1.98
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26
2.0
26
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29
22
1.98
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2.0
82
100
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29
1.97
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2.0
26
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24
1.98
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2.0
26
92
0
88
26
24
20
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1.99
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367
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27
23
1.99
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2.0
26
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0
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24
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1.98
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2.0
425
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1.99
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4.0
26
96
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28
29
18
23
1.98
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27
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23
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2.0
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28
18
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1.98
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11
100
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25
28
23
1.99
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2.0
26
88
0
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28
26
17
26
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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26
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24
1.98
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2.0
26
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72
26
22
18
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1.97
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2.0
26
88
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28
26
16
28
1.97
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3.2
157
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492
19
26
30
24
1.98
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159
3.7
159
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19
26
28
25
1.99
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4.2
156
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400
20
26
28
24
1.99
24573180--24573889
316
2.2
317
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26
28
23
1.99
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2.0
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21
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1.95
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2.0
26
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22
20
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1.98
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2.0
26
96
0
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27
27
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26
22
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2.0
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28
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42
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36
22
17
24
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24581243--24581291
9
5.4
9
81
16
57
12
14
0
73
1.10
24581243--24581286
18
2.4
18
88
0
70
11
11
0
77
1.00
24581249--24581291
8
5.0
8
81
13
50
11
11
0
76
1.02
24588517--24588548
15
2.1
16
94
5
57
56
6
18
18
1.62
24591711--24592166
60
7.7
59
85
7
595
34
12
9
44
1.74
24591711--24592165
118
3.8
119
87
6
631
34
12
9
43
1.74
24591711--24592166
177
2.6
176
87
5
645
34
12
9
44
1.74
24592193--24592289
17
5.9
16
71
14
63
74
2
7
16
1.14
24592180--24592237
30
2.0
29
83
10
73
72
1
10
15
1.19
24592191--24592289
5
19.2
5
70
15
60
74
2
7
16
1.12
24592191--24592289
11
9.6
10
71
16
60
74
2
7
16
1.12
24592298--24592356
4
14.8
4
76
13
59
76
3
1
18
1.02
24592298--24592335
19
2.0
19
90
10
60
78
2
2
15
0.97
24592315--24592351
13
2.9
13
96
4
67
78
5
0
16
0.93
24593017--24593041
13
1.9
13
100
0
50
0
12
24
64
1.27
24593245--24593358
21
5.2
22
73
14
85
69
4
3
22
1.22
24593332--24593402
31
2.4
31
79
11
85
64
4
7
23
1.36
24593423--24593448
11
2.4
11
100
0
52
65
7
0
26
1.20
24593462--24593496
6
5.8
6
87
12
54
82
2
0
14
0.77
24593669--24594170
158
3.2
156
75
7
478
20
27
28
23
1.99
24594146--24594196
26
2.0
26
92
7
86
27
25
15
31
1.96
24594852--24594904
26
2.0
26
92
0
88
28
28
18
24
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24595207--24595259
26
2.0
26
88
0
79
28
30
16
24
1.97
24596707--24596761
26
2.1
26
89
0
83
27
27
18
27
1.98
24597210--24597262
26
2.0
26
89
7
81
28
20
20
30
1.98
24597907--24597959
26
2.0
26
89
7
81
28
22
18
30
1.98
24597864--24598617
342
2.2
343
85
3
1011
19
26
30
23
1.98
24598276--24598777
158
3.2
158
76
10
467
19
28
29
22
1.98
24600966--24601637
355
1.9
355
87
1
999
20
28
29
21
1.98
24601426--24601920
158
3.1
157
79
3
535
18
27
30
23
1.98
24601896--24601946
26
2.0
26
88
7
77
29
25
13
31
1.94
24602971--24603023
26
2.0
26
96
0
97
26
28
20
24
1.99
24603471--24603523
26
2.0
26
89
7
81
32
22
15
30
1.94
24604189--24604244
26
2.2
26
90
0
85
32
26
16
25
1.96
24604704--24604754
26
2.0
26
92
7
86
27
23
19
29
1.98
24606051--24606103
26
2.0
26
89
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24
26
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28
1.99
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2.0
26
92
0
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28
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24
1.99
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26
2.0
26
92
0
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26
26
22
24
2.00
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158
2.2
158
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3
413
20
25
29
24
1.99
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317
1.9
317
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1
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17
27
30
25
1.97
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26
2.0
26
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0
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30
24
20
24
1.99
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26
2.0
26
89
7
81
26
22
20
30
1.98
24610218--24610285
26
2.6
26
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0
127
29
20
19
30
1.97
24611744--24611775
17
1.9
17
93
6
57
31
6
3
59
1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24611719--24612417
59
11.7
58
83
9
861
34
12
7
45
1.71
24611719--24612418
119
5.8
119
90
4
1083
34
12
7
45
1.71
24612432--24612491
29
2.1
27
84
6
75
73
1
8
16
1.16
24612442--24612514
17
4.4
16
72
5
65
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2
6
13
1.09
24612450--24612518
11
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11
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20
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1
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14
1.06
24612548--24612594
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4
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2
19
0.99
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12
13
1
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1.19
24615135--24615187
18
3.1
18
87
12
76
11
11
1
75
1.13

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402