Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: NW_019167826.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_1, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  36299135

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   

This is table  252  of  402  ( 48166 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
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(0-2)
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1.32
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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(0-2)
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19
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6
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1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
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10
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180
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9
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1.44
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0
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0
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9
11
38
1.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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11
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1.73
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182
2.7
180
79
4
543
41
8
10
39
1.70
24818730--24819492
182
4.2
178
79
5
744
41
9
8
40
1.67
24819639--24819676
16
2.3
17
95
4
69
39
0
5
55
1.23
24821744--24821778
16
2.1
18
89
10
56
45
5
2
45
1.41
24822249--24822290
18
2.3
18
80
8
50
54
0
2
42
1.13
24822315--24822373
19
3.2
19
77
18
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50
0
3
45
1.18
24822337--24822406
30
2.3
30
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50
0
2
47
1.16
24822476--24822532
5
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20
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0
0
56
0.99
24822468--24822532
14
5.1
14
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22
63
43
0
0
56
0.99
24822476--24822539
24
2.7
24
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22
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45
0
0
54
0.99
24824011--24824063
26
2.0
26
92
7
90
26
20
26
26
1.99
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329
1.9
329
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0
762
21
29
26
22
1.99
24824708--24824768
26
2.3
26
94
0
104
29
19
22
27
1.98
24825184--24825526
158
2.2
158
81
4
379
25
30
25
18
1.98
24826210--24826655
159
2.8
158
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5
371
23
28
28
19
1.99
24826686--24826738
26
2.0
26
92
0
88
24
20
26
28
1.99
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26
2.0
26
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26
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25
26
1.99
24826501--24827449
367
2.6
367
82
4
1137
22
29
26
21
1.99
24827976--24828028
26
2.0
26
92
0
88
24
18
28
28
1.98
24828343--24828395
26
2.0
26
85
0
70
28
18
24
28
1.98
24828504--24828558
25
2.2
25
86
0
74
21
14
5
58
1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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26
2.0
26
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7
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29
11
25
33
1.91
24829142--24829194
26
2.0
26
88
0
79
26
16
28
28
1.97
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26
2.0
26
89
7
81
28
20
24
26
1.99
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26
2.0
26
85
7
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26
18
24
30
1.98
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26
2.1
26
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0
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20
27
24
1.99
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159
2.5
159
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4
360
25
27
27
19
1.99
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26
2.0
26
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0
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1.98
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2.0
26
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1.97
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356
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347
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28
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1.99
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2.0
26
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1.99
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2.0
26
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26
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1.97
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710
2.5
707
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7
1863
23
28
26
21
1.99
24832746--24834506
355
5.0
354
78
5
1685
23
28
26
21
1.99
24834538--24834588
26
2.0
26
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25
1.99
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184
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185
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552
23
26
28
20
1.99
24836124--24836176
26
2.0
26
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28
20
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1.99
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2.9
367
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2
1191
23
27
26
21
1.99
24836492--24836544
26
2.0
26
85
0
70
26
16
26
30
1.97
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254
1.9
253
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1
632
25
25
27
20
1.99
24837889--24838744
368
2.3
368
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862
23
26
27
22
2.00
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2.0
26
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0
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20
28
26
1.99
24839391--24839770
159
2.4
159
78
5
417
23
28
27
20
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24839868--24839920
26
2.0
26
88
0
79
24
20
26
28
1.99
24840236--24840288
26
2.0
26
85
7
72
30
18
24
26
1.98
24840867--24840899
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3.0
11
95
0
57
18
33
27
21
1.96
24840994--24841496
158
3.2
158
78
3
501
23
30
28
18
1.98
24841470--24841522
26
2.0
26
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0
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1.99
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358
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4
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23
30
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19
1.98
24841165--24842208
355
2.9
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1100
23
29
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1.98
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1.97
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26
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26
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1.98
24844221--24844273
26
2.0
26
88
0
79
26
18
26
28
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402