Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: NW_019167826.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_1, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  36299135

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
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          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   

This is table  30  of  402  ( 48166 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6572906--6573015
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19
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2.0
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2.0
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108
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18
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1.57
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20
2.1
20
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0
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1.02
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0
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2.1
60
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186
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3
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1.29
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1.9
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2
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2
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18
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50
3
0
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1.17
6613217--6613315
50
2.0
50
92
2
164
43
5
2
49
1.36
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6615864--6615919
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20
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10
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44
5
0
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1.25
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16
2.1
17
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57
2
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31
1.44
6618544--6618707
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2.0
83
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12
25
27
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13
1.9
13
100
0
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3.2
19
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11
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0
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17
2.5
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7
55
70
0
0
29
0.87
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2.3
23
83
12
72
72
0
1
25
0.95
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15
1.9
15
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10
3
0
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2
0
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30
1.52
6626537--6626570
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3.7
9
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4
50
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2
2
5
0.70
6626535--6626570
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2.1
18
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56
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2
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6626843--6626877
9
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2.0
36
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5
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57
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2
39
1.13
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7.1
29
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13
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50
3
2
43
1.31
6628965--6628993
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2.6
11
100
0
58
55
0
6
37
1.27
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6.1
18
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8
98
49
3
1
45
1.30
6628959--6629101
74
1.9
74
80
8
164
48
3
2
44
1.34
6629048--6629157
29
3.8
29
74
9
91
52
2
2
41
1.30
6629120--6629204
36
2.4
35
82
7
100
48
2
1
48
1.22
6629396--6629506
31
3.7
31
70
13
88
52
2
2
42
1.30
6629472--6629542
10
7.4
10
75
9
67
47
0
1
50
1.09
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6629499--6629559
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2.9
21
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7
70
45
0
1
52
1.10
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124
2.0
124
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21
1.67
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0
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0
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3.0
21
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85
43
1
25
29
1.64
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17
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2
56
1.34
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44.3
3
76
18
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34
3
3
59
1.30
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13
4.8
13
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14
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38
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4
55
1.30
6635628--6635750
20
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20
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11
105
34
3
3
59
1.30
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1.9
19
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0
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38
0
0
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10
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32
2
0
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1.07
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12
57
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6
6
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20
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12
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1.47
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14
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16
121
19
1
29
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1.59
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13
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1.68
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1.8
116
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17
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1.68
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20
1
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100
0
58
31
0
0
68
0.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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5
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31
0
0
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2.0
17
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0
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29
0
0
70
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0
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31
0
0
68
0.90
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16
2.5
17
85
10
54
77
2
0
20
0.88
6645191--6645491
37
8.2
37
75
3
196
49
17
16
15
1.79
6645197--6645492
73
4.1
72
74
6
231
49
17
16
16
1.80
6645183--6645467
110
2.6
109
81
2
318
49
18
16
15
1.79
6645489--6645553
22
3.0
22
84
8
87
29
12
23
35
1.91
6645886--6645951
22
3.0
22
75
16
73
27
15
24
33
1.95
6645438--6646692
526
2.4
527
81
3
1398
39
15
19
25
1.91
6645435--6646696
132
9.6
132
78
4
942
39
15
19
25
1.91
6647122--6647215
41
2.3
41
85
3
118
34
11
23
30
1.91
6648652--6648722
28
2.4
30
88
4
101
5
8
7
78
1.07
6648688--6648730
19
2.3
18
84
11
59
6
4
4
83
0.89
6655356--6655404
7
6.7
7
77
9
53
20
0
24
55
1.44
6655365--6655411
22
2.1
22
92
0
76
21
0
25
53
1.46
6655349--6655404
15
3.8
15
80
2
69
21
0
23
55
1.44
6655447--6655570
44
2.9
43
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142
20
2
31
45
1.64
6655399--6655618
14
15.4
14
68
15
87
19
2
30
47
1.64
6655747--6655799
3
17.7
3
100
0
106
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0
0
67
0.91
6657751--6658052
121
2.5
121
80
1
336
19
22
13
44
1.85
6658720--6658849
5
26.4
5
74
16
87
34
3
3
57
1.35
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6658701--6658795
33
2.7
35
80
15
92
33
7
3
55
1.43
6658742--6658902
3
57.3
3
69
20
82
32
4
3
59
1.35
6658705--6658813
25
4.4
26
85
10
79
33
5
3
56
1.40
6658675--6658893
8
26.5
8
69
18
112
32
5
4
57
1.40
6658750--6658857
14
8.4
13
77
20
104
34
2
4
58
1.33
6658750--6658889
25
5.5
25
85
9
176
33
5
4
57
1.40
6658744--6658906
25
6.4
25
80
12
122
32
4
3
59
1.34
6659250--6659293
20
2.2
21
88
8
65
18
6
29
45
1.75
6659719--6659830
6
18.8
6
73
16
67
17
0
2
78
0.92
6659719--6659808
11
8.5
10
72
23
69
15
1
2
81
0.86
6659722--6659829
7
14.7
7
75
18
69
17
0
2
78
0.92
6659734--6659801
8
8.4
8
77
9
75
16
0
2
80
0.82
6659734--6659815
24
3.5
23
81
15
96
18
0
2
79
0.84
6659734--6659829
8
12.5
8
79
17
64
18
0
3
78
0.89
6662656--6662928
29
9.0
30
67
18
115
50
2
2
44
1.26
6662725--6662926
58
3.3
58
78
12
178
49
2
1
46
1.26
6662868--6663070
18
11.3
18
69
17
93
53
2
0
43
1.20
6662939--6663066
29
4.4
29
78
2
150
53
2
0
42
1.19
6662954--6663011
11
5.5
11
74
17
52
56
1
1
39
1.19
6662953--6663117
57
2.9
54
79
10
172
54
1
2
41
1.24
6663142--6663213
29
2.5
28
82
4
81
55
2
1
40
1.23
6663096--6663336
68
3.5
66
80
8
250
51
2
3
41
1.34
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6663136--6663335
71
2.9
68
83
5
233
52
3
3
41
1.36
6663355--6663442
21
4.3
20
77
9
90
46
1
2
50
1.21
6663393--6663443
10
5.3
10
76
6
52
49
0
0
50
1.00
6663393--6663442
19
2.6
19
87
12
68
50
0
0
50
1.00
6666100--6666135
18
1.9
19
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56
25
8
5
61
1.46
6666705--6666800
50
1.9
50
89
0
147
23
22
22
30
1.99
6668820--6668860
20
2.0
20
95
0
73
39
12
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100
0
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0
0
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0.94
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3
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141
35
0
2
62
1.08
6671358--6671533
5
33.8
5
79
10
117
35
1
4
59
1.25

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402