Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: NW_019167826.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_1, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  36299135

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   

This is table  34  of  402  ( 48166 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7074096--7074138
17
2.6
17
85
10
54
20
23
2
53
1.57
7076008--7076254
46
5.4
46
75
12
156
36
8
14
40
1.77
7076114--7076253
22
6.2
23
68
11
74
35
5
14
44
1.69
7076279--7076332
22
2.4
23
78
12
58
44
1
5
48
1.37
7076433--7076469
16
2.3
16
95
0
65
37
5
13
43
1.67
7076537--7076724
18
10.3
18
75
7
137
32
7
13
46
1.72
7077025--7077090
6
11.0
6
74
6
62
27
3
7
62
1.37
7077025--7077094
30
2.3
31
82
7
99
27
2
7
62
1.35
7077959--7078406
227
2.0
227
91
0
736
40
8
9
40
1.70
7094541--7094581
21
2.0
21
90
0
64
43
12
7
36
1.70
7094641--7094668
14
2.0
14
100
0
56
42
7
7
42
1.59
7094790--7094895
18
5.9
18
79
8
74
52
9
9
28
1.64
7094809--7094859
8
6.0
8
75
20
50
47
11
13
27
1.78
7094756--7094990
54
4.3
55
80
6
205
53
12
8
25
1.65
7094830--7094992
18
9.1
18
73
5
87
52
13
7
26
1.66
7094760--7094992
36
6.5
37
73
7
158
53
12
8
26
1.66
7094853--7095022
54
3.1
53
72
13
132
52
12
7
27
1.65
7094942--7095059
37
3.2
36
72
15
100
50
11
10
28
1.70
7095050--7095100
18
2.9
18
79
5
59
49
17
11
21
1.79
7095275--7095330
21
2.7
21
94
5
96
48
19
3
28
1.66
7096370--7096409
21
2.0
21
85
9
57
15
17
0
67
1.23
7099743--7099855
55
2.1
55
94
0
199
27
7
17
46
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7100848--7100903
17
3.3
17
75
9
53
71
0
3
25
1.02
7100851--7100897
24
2.0
24
83
8
60
68
0
4
27
1.08
7102909--7102942
16
2.1
16
100
0
68
11
23
8
55
1.63
7103280--7103324
23
2.0
23
86
0
63
82
8
4
4
0.94
7103695--7103752
22
2.6
24
73
15
61
43
8
5
43
1.57
7110150--7110181
2
16.0
2
93
0
55
46
0
3
50
1.17
7112118--7112181
22
2.9
22
77
11
67
31
3
0
65
1.08
7112123--7112155
17
1.9
17
100
0
66
33
0
0
66
0.92
7112139--7112196
28
2.1
28
93
0
98
31
5
0
63
1.16
7113161--7113218
23
2.5
23
80
0
71
22
6
0
70
1.10
7115569--7115627
22
2.7
22
94
2
102
35
8
5
50
1.55
7119705--7119738
13
2.5
13
95
4
59
70
0
0
29
0.87
7122972--7123010
21
1.9
21
89
5
62
2
12
0
84
0.72
7122975--7123004
14
2.2
13
94
5
51
0
10
0
90
0.47
7125196--7125237
2
21.5
2
95
4
77
50
0
0
50
1.00
7126938--7126988
21
2.4
21
100
0
102
37
17
19
25
1.94
7128121--7128214
27
3.5
27
92
0
152
41
3
7
47
1.47
7128769--7128817
20
2.4
20
86
3
62
18
8
4
69
1.30
7128871--7128902
2
16.5
2
93
6
57
50
0
0
50
1.00
7129971--7130004
18
1.9
17
88
5
50
20
5
0
73
1.04
7130313--7130358
3
15.3
3
100
0
92
32
0
0
67
0.91
7131609--7131636
7
4.0
7
100
0
56
28
0
0
71
0.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7134221--7134266
21
2.2
21
84
0
56
43
17
15
23
1.87
7136009--7136059
24
2.1
24
96
0
93
21
0
49
29
1.50
7140778--7140804
12
2.2
12
100
0
54
7
0
0
92
0.38
7141679--7141758
9
8.3
9
74
9
52
63
7
3
25
1.37
7141666--7141743
41
1.9
41
84
10
106
67
7
6
17
1.36
7141679--7142070
10
39.9
10
67
17
92
56
6
2
34
1.40
7141711--7141773
29
2.2
29
79
0
72
65
7
1
25
1.29
7141681--7141801
50
2.4
50
82
6
147
62
8
2
26
1.36
7141903--7142069
9
17.1
9
70
16
84
56
4
2
35
1.33
7141967--7142039
19
3.8
18
80
10
74
63
1
1
34
1.12
7141964--7142066
29
3.6
28
79
7
86
59
2
2
34
1.27
7142128--7142164
16
2.3
16
90
0
56
35
2
2
59
1.26
7142181--7142218
18
2.1
18
90
0
58
50
2
0
47
1.15
7142282--7142320
21
1.9
20
85
15
53
43
2
7
46
1.46
7142275--7142322
20
2.4
19
80
16
53
45
4
6
43
1.48
7142395--7142452
19
3.1
18
76
11
55
31
3
0
65
1.09
7142395--7142482
20
4.4
19
77
8
61
28
4
1
65
1.19
7142433--7142581
20
7.2
20
72
13
115
31
2
5
60
1.33
7142474--7142521
19
2.5
18
77
12
51
37
0
8
54
1.31
7142535--7142597
20
3.1
20
77
4
54
28
1
1
68
1.08
7142612--7142654
17
2.4
18
81
14
54
32
0
6
60
1.23
7142726--7142916
19
9.9
19
72
12
86
35
2
6
55
1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7142718--7142885
10
17.3
9
69
16
54
35
1
5
57
1.31
7142806--7142919
10
11.8
9
79
10
75
35
2
6
55
1.39
7142811--7142879
21
3.4
20
78
13
79
36
1
5
56
1.32
7142942--7143004
28
2.2
28
86
5
92
38
0
3
58
1.14
7148488--7148750
67
3.9
66
79
6
255
24
11
6
57
1.57
7149396--7149440
2
22.5
2
90
0
72
44
0
4
51
1.21
7150886--7150921
5
7.0
5
96
3
63
58
0
0
41
0.98
7158424--7158470
21
2.1
23
85
14
64
36
4
4
55
1.39
7159044--7159396
59
5.9
60
88
7
492
33
15
7
44
1.73
7159044--7159396
119
3.0
117
88
6
516
33
15
7
44
1.73
7159406--7159491
6
13.8
6
69
19
52
77
1
5
15
1.01
7159408--7159479
19
3.8
19
73
26
64
77
1
5
15
1.01
7159405--7159485
31
2.5
33
81
18
100
77
1
6
14
1.02
7159403--7159455
16
3.3
15
79
10
61
81
0
3
15
0.83
7160465--7160527
3
20.7
3
87
9
92
65
0
1
33
1.03
7160794--7160837
19
2.4
19
92
3
72
4
0
6
88
0.62
7160812--7160842
11
2.8
11
90
0
53
6
0
3
90
0.55
7160847--7161213
42
9.0
42
88
8
562
37
21
17
22
1.94
7160847--7161213
82
4.5
80
90
7
544
37
21
17
22
1.94
7162381--7162410
10
3.0
10
95
0
51
3
6
0
90
0.56
7166376--7166952
59
9.8
57
83
9
651
33
14
7
44
1.73
7166365--7166954
119
5.0
117
86
8
759
33
13
7
45
1.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7166365--7166953
178
3.3
176
89
5
895
33
13
7
44
1.72
7166980--7167064
6
13.7
6
68
19
50
76
1
7
15
1.06
7166980--7167028
16
3.1
15
80
11
53
77
0
6
16
0.96
7166999--7167044
20
2.2
21
84
3
58
76
2
6
15
1.09
7168019--7168075
3
18.7
3
89
10
89
66
0
0
33
0.92
7168009--7168075
28
2.3
29
87
12
102
65
0
0
34
0.93
7168008--7168110
42
2.6
38
74
22
86
63
2
0
33
1.10
7168193--7168242
21
2.4
21
96
0
91
24
28
22
26
1.99
7177524--7177553
14
2.1
14
93
0
51
30
0
20
50
1.49
7177544--7177572
14
2.0
15
93
6
51
34
0
24
41
1.55
7177919--7177964
24
1.9
24
86
8
67
26
2
23
47
1.63
7181690--7181756
30
2.2
30
94
0
116
40
5
4
49
1.48
7184192--7184228
13
2.8
13
100
0
74
18
0
24
56
1.41
7187091--7187497
59
6.8
58
83
10
493
34
13
7
44
1.72
7187091--7187507
118
3.5
118
84
8
549
33
12
7
45
1.71
7187091--7187497
184
2.3
176
86
8
565
34
13
7
44
1.72
7188027--7188097
31
2.3
31
85
0
88
26
22
25
25
2.00
7188532--7188571
15
2.5
17
77
22
50
75
2
5
17
1.10
7188575--7188676
35
2.9
34
72
17
93
61
6
0
30
1.28
7188563--7188679
35
3.3
33
71
16
92
62
5
0
30
1.25
7190397--7190435
20
2.0
20
100
0
78
61
2
5
30
1.31
7200985--7201044
30
2.0
30
100
0
120
26
3
56
13
1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7202572--7202616
23
1.9
23
86
4
63
57
4
0
37
1.19
7206432--7206483
26
2.0
26
82
14
63
53
0
9
36
1.34
7211727--7211764
2
19.0
2
88
0
58
50
0
0
50
1.00
7211915--7211947
2
17.5
2
87
12
52
0
48
0
51
1.00
7213541--7213567
11
2.5
11
100
0
54
40
0
0
59
0.98
7213555--7213602
15
3.3
14
80
8
60
41
0
0
58
0.98
7222779--7222819
8
5.4
8
88
5
59
39
0
0
60
0.96
7222779--7222821
15
2.8
16
89
6
63
41
0
0
58
0.98
7222803--7222846
21
2.0
23
83
12
58
50
0
0
50
1.00
7222779--7222842
15
4.3
15
76
7
60
43
0
0
56
0.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402