Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: NW_019167826.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_1, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  36299135

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   

This is table  8  of  402  ( 48166 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1324185--1324309
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0
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2.1
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2.0
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0
0
68
0.90
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1
2
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10.7
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0
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9
0
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2
303
23
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42
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1362317--1362608
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3.4
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2
307
22
14
19
42
1.88
1362320--1362608
130
2.2
131
86
1
384
23
13
19
43
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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2
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1362889--1362921
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2.1
16
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3
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20
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1363864--1364038
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2.9
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119
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27
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0
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1.31
1376620--1376658
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17
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46
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48
1.24
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2.0
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2
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11
31
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1384105--1384229
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1.9
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1
216
32
15
19
33
1.92
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2.1
22
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58
48
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4
46
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52
32
0
0
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2.0
21
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2
2
33
1.21
1389889--1389933
23
2.0
23
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17
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0
0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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16
2.0
17
94
5
59
18
12
6
63
1.48
1487193--1487227
5
6.6
5
87
12
52
57
0
0
42
0.99
1487193--1487227
16
2.2
16
90
10
54
57
0
0
42
0.99
1488294--1488320
2
13.5
2
100
0
54
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0
48
0
1.00
1492636--1492665
2
15.0
2
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0
51
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0
0
46
1.00
1494604--1494637
16
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16
94
0
59
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14
2
14
1.34
1494609--1494663
16
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16
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5
58
72
16
3
7
1.21
1495268--1495307
18
2.2
18
90
0
62
17
0
5
77
0.94
1495269--1495309
22
1.9
21
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17
0
4
78
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1495335--1495364
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0
0
13
0.57
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25
1.9
25
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47
2
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41
1.45
1495529--1495555
8
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100
0
54
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0
0
22
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1.54
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17
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0.90
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25
1.95
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19
2.1
19
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0
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30
20
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15
1.94
1497831--1498118
156
1.8
156
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0
531
28
15
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23
1.95
1497997--1498341
116
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114
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30
15
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1.95
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107
2.0
107
97
0
401
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15
30
23
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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0
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0
0
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2.0
24
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2.0
17
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0
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0
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0
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0
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1.59
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17
2.5
17
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0
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76
0
2
21
0.90
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2.0
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2.1
19
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0
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1.93
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156
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0
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1.95
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2.0
116
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0
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22
1.94
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0
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0
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1.44
1542959--1543032
36
2.1
36
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0
130
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4
50
1.44
1546109--1546192
38
2.2
38
84
0
105
46
8
21
23
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1550857--1550892
18
1.9
19
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5
56
30
0
0
69
0.89
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27
1.9
28
88
3
81
60
0
3
35
1.15
1552599--1552652
24
2.2
24
90
0
81
29
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18
1.72
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26
2.3
27
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5
0
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1.17
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2
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0
0
50
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1.50
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11
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52
0
0
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0
1
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0
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0
0
60
0.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402