Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: NW_019167826.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_1, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  36299135

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   

This is table  31  of  402  ( 48166 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6671373--6671521
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2.3
65
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13
202
35
1
3
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1.22
6683358--6683436
38
2.1
38
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20
3
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1.64
6683408--6683521
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2.0
56
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212
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21
2
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1.63
6683426--6683513
27
3.2
27
63
12
70
29
19
2
48
1.61
6684252--6684528
56
4.9
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73
4
195
25
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14
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1.92
6684908--6685058
3
52.3
3
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149
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1
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1.23
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18
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1.9
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19
2
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1.10
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11
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11
100
0
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26
0
50
1.50
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15
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5
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1.83
6698042--6698082
21
1.9
22
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5
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2
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1.26
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12
60
15
0
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12.0
4
80
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19
0
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0.96
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14
4.8
14
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21
61
16
0
5
77
0.95
6699090--6699151
27
2.4
26
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12
92
16
0
6
77
0.97
6700597--6700630
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2.8
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8
59
91
8
0
0
0.43
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18
2.4
18
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63
86
11
0
2
0.66
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10
5.4
10
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19
53
75
1
1
21
0.98
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22
2.0
22
95
0
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52
4
11
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1.57
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3
20.3
3
100
0
122
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0
0
32
0.91
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49
8.5
49
75
9
316
31
13
16
38
1.87
6714329--6714743
146
2.8
144
82
7
494
31
13
16
38
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6715184--6715224
22
1.9
21
85
5
55
75
7
9
7
1.18
6715169--6715235
22
2.9
21
70
23
53
80
7
7
4
1.01
6717185--6717239
3
18.3
3
100
0
110
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0
0
32
0.91
6721697--6721725
14
2.0
15
93
6
51
75
0
10
13
1.04
6723592--6723638
23
2.0
23
84
8
60
21
21
17
40
1.91
6724020--6724111
15
6.1
15
71
0
67
35
30
17
16
1.92
6724034--6724144
45
2.5
45
85
2
161
38
29
15
16
1.89
6724100--6724160
30
2.0
31
93
3
106
42
27
9
19
1.83
6724049--6724233
74
2.5
75
91
2
284
38
27
14
20
1.91
6724252--6724293
21
2.0
22
85
4
59
23
4
4
66
1.30
6724284--6724310
14
1.9
14
100
0
54
14
0
11
74
1.08
6725349--6725395
4
12.0
4
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20
55
21
0
2
76
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6725339--6725393
28
2.0
28
92
7
94
18
0
5
76
0.97
6725350--6725395
24
1.9
24
91
8
76
21
0
2
76
0.90
6728005--6728049
23
2.0
23
82
8
56
48
2
4
44
1.35
6729644--6729669
3
8.7
3
100
0
52
69
0
0
30
0.89
6730957--6731015
25
2.4
25
82
0
64
64
0
1
33
1.04
6730999--6731058
26
2.3
27
83
11
72
55
0
5
40
1.22
6731143--6731272
9
13.9
9
67
20
63
48
4
3
43
1.39
6731143--6731184
18
2.3
18
95
0
75
52
0
0
47
1.00
6731143--6731217
10
7.8
10
74
16
70
49
1
2
46
1.24
6731144--6731192
18
2.7
18
87
3
71
53
2
0
44
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6731491--6731554
19
3.4
18
75
10
56
25
0
6
68
1.12
6731508--6731554
19
2.4
20
85
3
60
25
0
4
70
1.05
6732253--6732531
71
3.9
70
76
7
240
41
3
14
40
1.62
6732635--6732676
23
1.9
23
85
9
61
47
4
0
47
1.23
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30
3.4
30
81
5
96
57
2
3
37
1.26
6733249--6733337
30
3.0
30
72
16
78
56
1
2
40
1.19
6738126--6738170
24
1.9
24
90
4
74
44
6
0
48
1.29
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21
2.0
22
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61
67
2
4
25
1.22
6743149--6743188
2
20.0
2
84
0
53
55
2
0
42
1.13
6743442--6743479
20
1.9
20
88
0
58
23
7
5
63
1.42
6744661--6744704
17
2.6
17
81
0
61
47
0
2
50
1.13
6746815--6747079
22
12.3
22
71
9
107
49
4
10
35
1.58
6746824--6746933
44
2.5
44
80
0
121
50
6
10
33
1.61
6746824--6746959
44
3.1
43
76
4
119
47
5
10
36
1.62
6747061--6747121
22
2.8
22
74
0
59
50
6
6
36
1.54
6747159--6747233
22
3.4
22
74
9
71
50
2
12
34
1.53
6747197--6747273
40
1.9
40
82
12
95
59
3
6
29
1.40
6747163--6747286
22
5.8
22
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14
53
51
3
10
34
1.52
6747370--6747459
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2.0
45
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112
44
12
5
37
1.65
6748672--6748756
36
2.3
38
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4
102
30
4
12
51
1.60
6748689--6748742
17
3.1
17
81
7
56
27
3
12
55
1.54
6748696--6748802
21
5.2
20
73
15
83
32
5
9
52
1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6748672--6748756
17
4.6
17
68
16
53
30
4
12
51
1.60
6748780--6749115
24
14.2
24
66
19
136
32
3
9
54
1.50
6748786--6748900
57
2.0
56
88
1
167
33
6
9
51
1.59
6748858--6749155
42
6.8
42
73
15
158
32
2
10
55
1.46
6748926--6749131
66
3.0
67
81
10
265
31
1
10
56
1.44
6748950--6749131
70
2.6
70
83
10
223
31
1
9
56
1.42
6749079--6749148
18
3.6
18
70
20
59
30
2
12
54
1.53
6748848--6749128
24
12.3
24
71
17
188
32
2
9
55
1.45
6748853--6749132
112
2.5
111
81
9
320
32
2
9
56
1.44
6755883--6755973
46
2.0
46
84
0
119
29
9
16
43
1.80
6755874--6756066
86
2.2
85
82
6
226
29
9
17
44
1.80
6755923--6756102
43
4.3
42
76
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168
26
9
20
44
1.81
6755918--6756077
86
1.8
88
89
6
254
26
10
18
45
1.81
6756428--6756470
18
2.5
18
88
7
63
27
0
6
65
1.18
6757061--6757150
16
5.3
18
71
20
63
31
8
10
50
1.67
6757071--6757135
32
2.0
33
87
3
96
30
9
7
52
1.61
6757061--6757178
17
6.8
17
74
10
87
30
8
11
50
1.67
6757072--6757150
32
2.5
32
79
8
81
31
7
8
51
1.61
6757161--6757515
24
15.8
24
71
19
223
31
3
10
54
1.53
6757222--6757276
22
2.7
20
86
10
83
36
3
9
50
1.51
6757168--6757476
21
13.9
22
68
17
144
32
4
10
53
1.54
6757233--6757366
71
1.9
69
86
6
189
32
5
8
52
1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6757317--6757491
42
4.1
42
79
14
180
32
3
9
55
1.48
6757359--6757501
23
6.3
22
72
18
62
32
2
9
55
1.45
6757359--6757519
70
2.4
64
82
12
173
30
2
10
56
1.46
6757199--6757502
47
6.8
44
71
19
179
31
4
9
53
1.53
6757495--6757535
18
2.3
18
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0
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24
2
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1.53
6757509--6757547
18
2.2
18
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9
53
30
5
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48
1.66
6757161--6757554
155
2.5
154
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440
31
4
11
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1.55
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31
2.1
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29
2
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52
1.57
6758059--6758500
22
20.1
22
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12
140
48
5
9
36
1.58
6758067--6758100
11
3.1
11
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52
0
8
38
1.33
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23
2.2
23
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0
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58
6
0
36
1.23
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22
12.0
21
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13
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5
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36
1.54
6758165--6758303
65
2.2
64
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11
160
48
6
9
35
1.61
6758059--6758319
43
6.0
43
73
12
156
50
5
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36
1.54
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1.66
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22
4.5
22
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2
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43
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66
2.0
66
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8
160
42
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1.77
6758577--6758679
44
2.3
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120
43
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1.75
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21
4.5
21
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47
10
8
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21
3.5
21
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42
2.1
42
82
0
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3.3
11
92
3
56
40
2
0
56
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6760622--6760661
11
3.5
11
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53
35
2
0
62
1.09
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24
2.9
24
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2
22
1.24
6761985--6762015
2
16.0
2
93
6
55
51
0
0
48
1.00
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2.3
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5
29
0
1.17
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7
27.7
6
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17
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45
32
1
20
1.59
6774116--6774292
13
13.8
12
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1
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1.59
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1.59
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21
2.8
18
81
15
61
83
1
15
0
0.74

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402