Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: NW_019167826.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_1, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  36299135

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
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          401   402   

This is table  7  of  402  ( 48166 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1195317--1195361
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2.0
23
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53
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0
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0
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0
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0
0
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20
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1
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4.0
20
70
16
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2
2
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0.99
1216618--1216687
18
3.7
18
79
20
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17
2
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3.0
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6
225
48
4
8
38
1.52
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18
2.4
18
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7
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40
2
2
54
1.25
1217784--1217838
25
2.2
24
78
9
56
56
1
9
32
1.41
1217706--1217934
112
2.0
113
88
6
340
51
5
13
30
1.62
1217755--1217968
58
3.8
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10
202
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1.9
15
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0
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20
20
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1.70
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1.9
30
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10
89
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0
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42
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5
227
23
9
19
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1.80
1230157--1230384
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2.6
85
76
10
219
23
9
20
46
1.80
1230348--1230768
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9.6
44
82
5
453
23
15
20
41
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1230950--1231027
3
25.7
3
80
12
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30
1
1
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1.07
1230965--1231041
21
3.5
22
79
12
68
28
1
2
67
1.12
1231874--1232010
60
2.3
57
82
12
152
51
6
7
34
1.55
1231974--1232214
79
3.2
78
83
12
296
44
7
15
31
1.75
1232199--1232331
55
2.4
57
82
5
155
46
7
11
34
1.68
1232397--1232435
13
2.9
13
88
11
53
20
2
0
76
0.90
1232406--1232457
22
2.4
21
81
12
52
17
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1
76
1.02
1235011--1235049
9
4.3
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12
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10
10
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22
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77
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11
1.00
1236048--1236110
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2.0
32
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30
12
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43
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11
13
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87
3.2
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239
27
11
12
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1.76
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44
2.5
44
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1
139
25
11
16
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1.81
1237797--1237861
26
2.6
27
83
11
84
44
3
7
44
1.48
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2
13.5
2
100
0
54
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0
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1.00
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2.2
23
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61
5
0
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1.19
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59
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57
72
13
224
36
8
4
49
1.55
1249011--1249079
20
3.6
19
73
13
61
78
8
2
10
1.07
1249025--1249078
23
2.3
23
76
20
58
79
9
1
9
1.00
1249129--1249166
19
2.0
20
84
5
51
26
28
34
10
1.90
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114
3.1
114
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1
519
35
15
12
36
1.85
1250917--1250962
21
2.1
22
92
4
76
36
10
8
43
1.71
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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73
88
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15
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1.80
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21
5.9
21
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164
38
14
8
38
1.77
1250859--1251041
73
2.4
74
78
12
210
34
15
9
39
1.80
1250992--1251133
21
6.7
21
81
10
110
38
12
9
40
1.75
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32
2.2
32
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95
5
13
1
79
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131
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17
0
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12
2.4
13
94
5
53
3
13
0
83
0.77
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4.9
20
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16
1
76
1.04
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3.7
31
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21
114
6
17
0
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1.05
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17
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18
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5
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40
8
5
45
1.58
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59
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10
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8
5
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1.54
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7
3
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1.49
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3.5
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16
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40
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4
47
1.52
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15
1.9
16
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53
50
0
3
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1.18
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41
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12
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15
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1256600--1256677
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24
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74
7
2
15
1.15
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2.9
28
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90
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0
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28
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28
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7
67
36
7
3
52
1.47
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1272563--1272600
19
2.0
19
94
0
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23
31
23
21
1.98
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27
20
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14
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14
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5
53
48
0
2
48
1.12
1292452--1292492
5
8.2
5
97
0
73
41
19
21
17
1.90
1293781--1293805
9
2.8
9
100
0
50
0
0
8
92
0.40
1301496--1301553
6
10.2
6
75
17
52
13
3
67
15
1.36
1301496--1301538
21
2.0
21
82
8
52
16
4
65
13
1.43
1301573--1301628
21
2.7
21
80
5
60
16
0
73
10
1.10
1301579--1301628
15
3.5
15
73
15
52
18
0
72
10
1.12
1302271--1302308
2
19.0
2
94
0
67
47
0
2
50
1.15
1303354--1303498
63
2.3
63
82
5
163
35
5
11
47
1.63
1306952--1306997
20
2.2
21
88
3
67
50
0
2
47
1.13
1307902--1307934
3
11.0
3
100
0
66
33
0
0
66
0.92
1312087--1312136
18
2.8
19
75
22
54
24
0
4
72
1.02
1312377--1312413
19
1.9
19
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10
58
70
0
0
29
0.88
1312377--1312421
18
2.4
19
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7
56
71
0
0
28
0.87
1312562--1312599
14
2.7
14
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26
2
13
1.49
1312708--1312747
14
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15
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7
55
52
32
2
12
1.52
1312562--1312753
29
6.6
28
74
8
113
48
31
2
17
1.59
1314630--1314666
12
3.1
12
88
0
56
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0
16
0
0.64
1314628--1314666
17
2.4
16
87
8
53
84
0
15
0
0.62
1316106--1316197
4
23.0
4
82
4
114
25
25
2
47
1.63
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1316103--1316211
24
4.5
24
86
4
148
26
22
3
46
1.68
1318010--1318058
25
2.0
25
83
0
62
22
22
4
51
1.65
1318148--1318187
17
2.5
15
88
12
53
82
7
10
0
0.84
1318636--1318689
5
10.6
5
78
4
54
79
0
16
3
0.87
1319726--1319769
23
2.0
23
82
13
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36
18
20
25
1.95
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33
3.2
32
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6
140
25
21
18
34
1.96
1320031--1320117
32
2.7
32
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1
120
26
21
17
34
1.95
1320321--1320352
15
2.1
15
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0
55
21
25
12
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1.88
1320715--1320781
22
3.1
22
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10
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31
14
16
37
1.89
1320973--1321023
22
2.3
23
83
10
70
25
13
19
41
1.88
1321116--1321272
71
2.3
69
81
7
176
21
23
8
47
1.77
1321241--1321389
35
4.2
36
70
15
105
23
21
7
47
1.75
1321224--1321514
106
2.8
105
86
4
383
22
16
8
52
1.70
1321551--1322175
35
18.1
35
67
11
157
19
23
10
46
1.80
1321207--1321690
104
4.6
105
78
4
437
22
20
8
48
1.77
1321589--1321753
68
2.4
67
84
4
197
23
21
9
46
1.80
1321422--1322197
277
2.8
275
84
5
921
20
22
10
46
1.80
1321658--1321923
105
2.6
105
80
3
297
19
23
10
46
1.81
1321761--1322163
172
2.3
171
79
8
435
18
24
10
46
1.81
1322026--1322175
34
4.3
33
72
15
101
18
24
10
48
1.78
1321531--1322122
33
17.2
34
67
13
135
20
23
10
45
1.81
1322070--1322132
33
1.9
33
83
6
83
20
23
9
46
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1321986--1322487
105
4.8
104
78
9
451
20
21
9
47
1.79
1322318--1322488
36
4.9
35
69
13
111
20
19
10
49
1.77
1323948--1323999
22
2.5
20
81
12
59
19
0
26
53
1.45
1323987--1324036
14
3.6
14
75
17
50
12
0
40
48
1.40
1323976--1324048
28
2.5
28
80
8
76
17
1
34
46
1.57
1324124--1324179
23
2.5
22
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2
67
17
0
26
55
1.43
1324054--1324168
56
2.1
55
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6
133
19
0
28
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1.53
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28
3.4
27
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12
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2
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1.63
1324144--1324309
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169
21
1
27
49
1.59
1324153--1324266
30
3.8
30
76
5
106
19
2
26
51
1.59

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          401   402