Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: NW_019167826.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_1, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  36299135

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   

This is table  44  of  402  ( 48166 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8642331--8642577
127
1.9
127
86
4
347
34
16
16
32
1.91
8642707--8643068
52
7.0
51
81
8
412
32
13
14
38
1.85
8642707--8643071
155
2.4
154
95
0
642
33
13
14
38
1.85
8642799--8643125
154
2.1
154
81
3
363
37
13
13
35
1.84
8642964--8643316
181
2.0
176
85
3
483
40
13
14
32
1.84
8643396--8643455
26
2.3
24
78
15
66
81
10
3
5
0.95
8648084--8648401
159
2.0
159
97
0
600
29
12
20
37
1.89
8652390--8652934
263
2.0
266
84
6
711
42
6
6
44
1.55
8658175--8658244
29
2.3
30
79
13
81
40
8
8
42
1.66
8659761--8659819
12
4.8
12
81
10
66
69
1
1
27
1.07
8659763--8659801
20
2.0
20
85
10
53
69
0
2
28
1.02
8661668--8661741
20
3.8
18
81
13
76
4
12
5
78
1.06
8662133--8662210
10
6.5
11
73
21
52
7
5
8
78
1.09
8662384--8662595
104
2.0
104
84
3
275
33
13
15
37
1.87
8662506--8662663
82
1.9
82
90
0
253
33
15
12
38
1.85
8662501--8662676
82
2.1
82
84
1
244
34
15
11
37
1.85
8662702--8662810
32
3.4
32
81
7
123
22
20
23
33
1.97
8662941--8662998
22
2.6
22
77
2
62
25
18
25
29
1.98
8663223--8663254
11
2.8
11
95
4
55
0
9
6
84
0.78
8671409--8671441
3
11.0
3
100
0
66
66
0
0
33
0.92
8671669--8671743
20
3.9
18
75
18
62
8
10
6
74
1.21
8671694--8671732
17
2.2
17
86
9
51
10
5
5
79
1.04
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8672078--8672103
8
3.2
8
100
0
52
46
0
0
53
1.00
8672109--8672313
104
2.0
105
85
0
277
35
14
13
36
1.85
8672110--8672348
104
2.3
104
80
5
241
35
14
13
36
1.86
8672351--8672476
32
3.9
32
84
2
155
23
16
26
33
1.96
8672477--8672522
23
2.0
23
95
0
83
36
17
19
26
1.94
8672505--8672586
32
2.6
32
90
0
128
40
21
12
25
1.88
8672605--8672656
22
2.4
21
87
9
77
30
23
19
26
1.98
8672619--8672702
23
3.7
23
82
1
89
28
20
25
26
1.99
8672660--8672709
23
2.2
23
81
0
55
36
16
24
24
1.94
8672752--8672820
23
3.0
23
80
0
84
33
21
23
21
1.97
8672847--8672879
12
2.8
12
100
0
66
24
24
0
51
1.48
8673023--8673081
22
2.5
22
81
8
64
1
10
8
79
1.00
8680884--8680927
21
2.0
21
82
13
52
40
13
20
25
1.89
8682794--8682825
15
2.0
17
88
11
50
3
9
6
81
0.97
8682958--8682990
15
2.2
15
94
0
57
0
15
0
84
0.61
8686621--8686657
16
2.2
17
90
4
58
54
0
0
45
1.00
8686634--8686683
20
2.6
19
78
9
57
56
0
2
42
1.11
8686887--8686919
9
3.3
10
91
8
50
54
0
0
45
0.99
8686999--8687045
25
1.9
24
86
4
67
38
0
2
59
1.09
8687005--8687084
12
6.9
11
72
14
54
32
1
5
61
1.26
8690504--8690543
9
4.2
9
87
6
53
2
10
2
85
0.80
8691009--8691204
13
14.2
13
77
12
121
14
2
38
44
1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8691040--8691159
20
5.8
20
78
15
93
14
1
40
44
1.55
8691009--8691190
7
26.4
7
75
16
141
14
1
38
45
1.55
8691181--8691207
14
1.9
14
100
0
54
14
7
33
44
1.73
8693425--8693595
40
4.3
40
79
4
184
29
18
12
39
1.87
8694551--8694599
9
5.8
9
81
13
52
30
2
0
67
1.02
8694737--8694778
22
1.9
22
100
0
84
28
11
28
30
1.92
8694737--8694794
22
2.6
22
88
0
71
29
13
27
29
1.94
8694862--8695267
40
10.0
40
75
4
276
34
13
14
37
1.84
8694863--8695402
40
13.3
41
72
8
247
35
12
14
37
1.84
8694868--8695267
82
4.9
81
77
4
297
35
13
14
37
1.84
8694973--8695328
123
2.9
120
74
8
319
34
12
15
37
1.85
8695760--8695807
19
2.5
20
86
3
62
27
16
12
43
1.84
8697349--8697379
14
2.2
14
94
0
53
0
16
0
83
0.64
8697361--8697482
6
19.8
6
74
18
58
2
18
0
77
0.92
8697407--8697489
10
7.7
10
74
15
76
0
15
1
83
0.72
8697356--8697489
31
4.2
31
72
14
94
2
18
0
78
0.90
8697406--8697489
40
2.1
39
82
8
98
0
16
1
82
0.74
8700307--8700395
37
2.4
37
80
1
106
35
10
19
34
1.85
8701372--8701526
25
6.2
25
87
1
211
50
9
12
27
1.70
8701554--8701646
8
11.0
8
79
13
80
12
5
2
79
0.99
8701554--8701654
9
11.8
9
81
9
88
12
6
1
78
1.04
8702645--8702737
7
13.7
7
80
10
104
17
0
36
46
1.48
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8702641--8702736
13
7.2
12
75
16
84
17
0
36
45
1.49
8702644--8702737
20
4.6
21
82
7
115
18
0
36
45
1.49
8702802--8702834
14
2.4
14
94
0
57
12
9
30
48
1.71
8713627--8713874
123
2.0
123
92
0
415
28
9
15
46
1.77
8714355--8714389
16
2.2
16
94
0
61
31
11
14
42
1.81
8714768--8714809
21
2.0
21
85
4
57
42
9
14
33
1.78
8716987--8717015
14
2.1
14
100
0
58
41
6
13
37
1.72
8717101--8717149
25
2.0
25
87
0
71
38
0
10
51
1.36
8730946--8731001
24
2.2
27
78
15
66
50
0
0
50
1.00
8730945--8731004
26
2.3
26
88
5
86
48
0
0
51
1.00
8730981--8731060
27
3.3
24
69
19
67
47
1
1
50
1.17
8730994--8731071
25
3.1
25
74
18
72
52
1
1
44
1.17
8736297--8736335
9
4.4
9
81
18
55
7
2
7
82
0.94
8736297--8736337
17
2.4
17
84
11
57
9
2
7
80
0.99
8736406--8736450
19
2.2
20
84
7
65
35
8
24
31
1.86
8740829--8740890
9
7.0
8
79
13
52
17
1
4
75
1.05
8740830--8740896
18
3.7
18
80
11
66
19
1
4
74
1.07
8741482--8741527
17
2.6
19
76
13
53
56
6
0
36
1.25
8745913--8746110
41
4.9
41
74
4
152
34
18
12
34
1.88
8746955--8746994
20
1.9
22
90
10
66
30
12
20
37
1.89
8747047--8747108
20
3.0
20
75
13
63
27
16
19
37
1.93
8748074--8748264
32
5.8
33
71
7
100
29
12
18
39
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8748113--8748196
33
2.5
35
84
3
100
32
11
16
39
1.85
8749570--8749610
12
3.4
12
82
0
55
24
2
7
65
1.30
8750180--8750214
3
11.7
3
100
0
70
65
0
0
34
0.93
8750379--8750431
15
3.5
15
79
10
63
62
1
3
32
1.24
8750576--8750613
10
4.0
10
83
13
53
39
0
0
60
0.97
8760682--8760706
2
12.5
2
100
0
50
52
0
0
48
1.00
8764131--8764196
35
1.9
33
82
14
80
48
1
7
42
1.40
8766660--8766721
30
2.1
29
88
5
90
27
1
3
67
1.15
8766968--8767031
28
2.3
27
79
12
67
25
4
3
67
1.25
8766968--8767030
25
2.5
26
80
12
69
25
4
3
66
1.26
8767162--8767209
3
16.0
3
100
0
96
66
0
0
33
0.92
8767163--8767263
6
16.3
6
79
17
55
72
3
0
22
1.08
8768194--8768250
13
4.3
13
80
12
71
31
0
0
68
0.90
8770748--8770790
6
7.0
6
91
2
68
0
20
30
48
1.50
8777553--8777612
28
2.1
28
87
6
86
66
1
6
25
1.25
8778348--8778427
24
3.1
24
80
20
90
60
2
2
35
1.24
8781056--8781093
19
2.0
20
84
5
51
57
0
0
42
0.98
8781173--8781203
2
15.5
2
100
0
62
51
0
0
48
1.00
8781218--8781247
14
2.1
14
93
0
51
23
23
0
53
1.46
8782063--8782096
16
2.1
16
89
10
52
47
11
5
35
1.65
8782714--8782792
20
4.1
20
74
9
65
13
1
41
43
1.53
8783078--8783168
44
2.1
43
83
6
112
47
13
3
36
1.59
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8783920--8784166
132
1.9
131
90
2
397
46
8
12
32
1.72
8784790--8784841
27
1.9
27
96
0
95
38
19
7
34
1.80
8797922--8797974
3
17.7
3
100
0
106
32
0
0
67
0.91
8799840--8799881
3
14.0
3
100
0
84
66
0
0
33
0.92
8800339--8800384
24
1.9
24
82
8
58
54
13
2
30
1.50
8800569--8800814
105
2.4
104
85
2
332
34
10
16
38
1.83
8800637--8801067
232
1.9
232
84
2
580
33
11
16
38
1.85
8800734--8800980
127
1.9
127
86
3
354
34
12
16
36
1.86
8800863--8801175
105
3.0
103
85
3
394
32
12
16
38
1.86
8801344--8801393
23
2.2
22
82
3
55
26
24
24
26
2.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402