Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: NW_019167826.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_1, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  36299135

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   

This is table  4  of  402  ( 48166 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
284611--284737
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159
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285683--285797
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59
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356
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10
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1.9
149
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6
9
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1.65
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181
2.1
181
83
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8
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1.66
291396--291614
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1.8
121
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1
314
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1.8
300
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2
700
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9
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3.9
175
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600
41
9
9
39
1.70
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175
3.9
177
78
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625
41
9
9
40
1.68
293325--298962
181
31.4
180
75
7
2651
40
8
9
40
1.69
293212--298973
362
16.0
361
75
7
4055
40
8
9
40
1.69
296563--296891
169
1.9
169
81
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398
40
9
10
39
1.72
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181
5.8
179
74
8
779
38
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9
42
1.70
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17
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50
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0
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12.1
180
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1543
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7
9
41
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2.9
699
79
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1831
41
7
9
41
1.67
300092--302243
351
6.1
355
76
8
1706
40
7
9
41
1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
302191--302343
75
2.1
74
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3
209
35
7
8
48
1.61
302331--302831
250
2.0
250
79
9
545
42
7
9
39
1.67
302586--303274
180
3.8
178
79
6
682
40
7
9
42
1.67
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181
31.7
181
76
7
4110
40
8
9
41
1.68
304126--304161
16
2.1
17
90
10
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8
5
41
1.58
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361
15.7
361
75
7
4038
40
8
9
41
1.68
309449--310337
182
4.9
180
76
8
772
43
11
8
37
1.70
310316--310352
15
2.5
15
100
0
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5
0
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2.0
67
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1
183
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15
6
41
1.72
310543--311335
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4.4
178
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714
41
9
8
39
1.68
311553--312190
177
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175
77
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613
41
11
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39
1.70
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181
16.5
179
72
11
1454
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9
8
41
1.67
312498--314213
543
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1704
41
8
8
41
1.66
315584--316573
181
5.5
179
78
6
866
42
8
8
40
1.66
319595--319860
145
1.8
147
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1
347
41
15
12
31
1.83
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36
3.3
36
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2
112
55
16
12
15
1.69
320298--320681
73
5.3
71
73
8
231
54
16
14
14
1.71
320347--320687
36
9.4
36
72
9
111
54
16
14
14
1.71
320527--320648
37
3.3
36
83
3
154
62
18
8
10
1.52
320514--320734
73
2.9
73
78
6
192
57
18
11
12
1.64
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80
2.9
80
80
1
255
56
15
13
14
1.68
320754--320925
80
2.2
80
82
6
197
58
14
13
13
1.64
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
320876--320947
36
2.0
36
81
5
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18
12
1.74
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93
2.2
95
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5
241
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14
21
31
1.93
321242--321418
33
5.4
32
70
12
112
35
15
16
32
1.91
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93
2.6
92
75
10
233
31
15
21
31
1.94
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3.6
22
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0
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21
18
32
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19
0
77
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14
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9
50
2
26
0
70
1.01
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178
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10
7
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17
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10
56
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5
0
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10.0
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1212
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8
8
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2.1
18
90
0
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2
13
44
1.57
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1112
40
8
8
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1.67
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58
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9
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181
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9
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16
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6
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1.65
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7
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20
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33
4
9
52
1.54
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41
7.3
40
82
6
201
31
5
10
52
1.59
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
351677--351817
61
2.3
61
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2
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31
4
9
53
1.54
351604--351858
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1
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5
10
52
1.59
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2.8
61
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5
168
31
5
9
53
1.56
351604--351891
143
2.0
141
85
5
384
30
5
10
53
1.58
351637--351899
102
2.6
102
84
4
302
31
5
11
51
1.59
351750--351900
41
3.7
41
89
0
230
31
5
11
50
1.63
351905--351970
32
2.1
32
88
0
96
25
1
13
59
1.44
351951--351998
17
2.6
19
77
16
55
29
6
6
58
1.47
351951--352018
19
3.6
19
75
15
61
30
4
10
54
1.54
358931--358961
8
3.8
8
91
8
53
77
12
9
0
0.99
358950--358978
12
2.3
13
94
5
51
82
6
3
6
0.93
360421--360722
43
7.1
42
84
3
331
26
15
20
37
1.92
360421--360722
82
3.6
84
85
4
351
26
15
20
37
1.92
360442--360722
125
2.2
127
81
3
325
27
16
21
35
1.94
360435--360744
167
1.9
167
81
2
381
29
16
20
34
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360989--361021
12
2.8
12
90
4
50
12
3
9
75
1.14
361641--361679
20
2.0
20
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0
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10
10
48
1.70
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20
3.2
20
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2
87
33
6
12
48
1.65
361958--375571
181
75.7
181
73
8
7043
42
9
7
40
1.65
362054--362471
176
2.4
175
78
9
418
44
7
7
39
1.62
361958--375571
362
37.9
361
75
8
8645
42
9
7
40
1.65
371214--371260
22
2.1
22
100
0
94
55
4
0
40
1.19
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
372223--372258
16
2.1
17
90
10
56
41
0
8
50
1.33
372597--372629
17
2.0
17
88
5
50
33
12
6
48
1.65
372946--372978
18
1.9
17
88
11
50
39
6
6
48
1.53
375912--375937
2
13.0
2
100
0
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0
0
50
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144
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2
405
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17
27
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2
17.0
2
100
0
68
50
0
0
50
1.00
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2.1
16
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0
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0
24
1.48
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2.0
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0
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2.9
21
94
0
102
38
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13
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1.87
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2.1
26
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6
67
38
1
1
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1.20
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18
2.4
17
82
17
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27
0
2
69
1.00
405772--406197
61
7.2
58
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13
379
37
9
3
48
1.54
405772--406197
60
7.2
56
77
13
358
37
9
3
48
1.54
406044--406083
17
2.4
17
95
0
71
55
0
5
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1.22
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10
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10
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14
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3
9
1.10
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41
2.1
40
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12
106
76
12
2
9
1.11
407253--407712
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5.3
87
75
10
375
43
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12
25
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407278--407717
44
10.0
44
78
7
367
43
18
12
25
1.86
411697--411746
25
2.0
25
88
3
75
22
20
16
42
1.89
412551--412590
19
2.1
19
100
0
80
10
32
10
47
1.70
412554--412598
19
2.4
19
92
0
72
11
31
6
51
1.63
419218--419582
60
6.2
58
75
12
271
35
10
5
49
1.60
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
419175--419556
176
2.2
171
79
12
395
35
11
6
46
1.66
419545--419577
16
2.2
15
89
10
50
33
6
0
60
1.21
419632--419702
19
3.6
19
77
21
67
80
9
0
9
0.91
419632--419697
9
6.9
9
81
11
69
81
9
0
9
0.87
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9
6.0
10
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80
6
1
11
0.98
419651--419713
10
6.4
9
81
13
54
80
7
1
9
0.95
420375--420410
12
3.1
12
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8
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27
0
0
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0
0
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2.4
29
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13
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38
0
4
57
1.18
421443--421508
28
2.3
29
85
10
84
37
0
4
57
1.19

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402