Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: NW_019167826.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_1, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  36299135

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
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          401   402   

This is table  103  of  402  ( 48166 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14014530--14014582
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1.98
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2.0
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2.2
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31
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23
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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2.0
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1.99
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2.0
26
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20.8
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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(0-2)
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10
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158
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408
24
30
26
18
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14042619--14042674
26
2.2
26
86
0
76
26
21
23
28
1.99
14043319--14043371
26
2.0
26
89
7
81
28
18
24
28
1.98
14043346--14043687
158
2.2
158
78
5
343
22
28
28
20
1.98
14043662--14043713
26
2.0
26
88
7
79
26
19
28
25
1.98
14043502--14044012
196
2.7
185
79
9
503
23
27
28
20
1.99
14043857--14043909
26
2.0
26
82
7
63
32
18
20
28
1.97
14043648--14044012
196
1.9
196
84
4
504
23
27
27
21
1.99
14045012--14045514
159
3.2
158
79
5
514
23
30
27
19
1.98
14045488--14045540
26
2.0
26
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26
20
26
26
1.99
14046480--14046531
26
2.0
26
85
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70
30
13
26
28
1.94
14046505--14047007
159
3.2
157
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446
22
26
28
23
1.99
14046981--14047033
26
2.0
26
92
0
88
24
15
28
32
1.95
14048569--14048619
26
2.0
26
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1.95
14048753--14048805
26
2.0
26
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0
97
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20
28
26
1.99
14049096--14049146
26
2.0
26
96
0
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25
15
27
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1.96
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539
1.8
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1213
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28
27
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1.99
14049055--14049445
196
2.0
194
81
4
455
23
27
26
23
2.00
14049327--14049817
159
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158
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29
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20
1.99
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26
2.0
26
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28
20
24
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1.99
14050000--14050369
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2.0
185
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2
476
23
28
27
21
1.99
14050184--14050603
159
2.6
159
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3
427
24
27
27
19
1.99
14049260--14050990
869
2.0
867
81
3
2012
22
29
27
20
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14050660--14050712
26
2.0
26
85
0
70
30
20
24
24
1.99
14051018--14051382
158
2.3
157
79
5
403
21
30
26
21
1.98
14051356--14051408
26
2.0
26
92
0
88
24
22
26
26
2.00
14052580--14052632
26
2.0
26
92
0
88
26
20
26
26
1.99
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26
2.0
26
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7
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30
18
22
28
1.98
14054534--14054977
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2.8
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425
23
28
28
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1.98
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2.0
26
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20
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1.99
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22
20
28
1.99
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3.3
158
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25
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1.98
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26
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1.97
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21
1.99
14060209--14061027
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5.2
155
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534
23
29
27
19
1.98
14060208--14061027
317
2.6
312
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4
1027
23
29
27
19
1.98
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2.0
26
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1.98
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27
27
18
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1.98
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26
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26
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26
22
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30
1.98
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22
4.2
22
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20
112
16
17
38
27
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26
2.0
26
96
0
95
26
28
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25
1.98
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26
2.0
26
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7
79
28
25
17
28
1.97
14064657--14064708
25
2.0
26
85
3
70
28
26
17
26
1.97
14071237--14071289
26
2.0
26
88
0
79
28
26
18
26
1.98
14071580--14071632
26
2.0
26
88
0
79
26
28
20
24
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14070831--14071949
343
3.3
341
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4
1334
19
28
29
22
1.98
14071605--14072097
157
3.1
156
76
8
462
18
27
30
23
1.98
14072731--14073140
159
2.6
160
80
6
469
18
30
28
21
1.97
14073499--14073548
26
1.9
26
84
8
66
24
28
20
28
1.99
14073842--14073894
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2.0
26
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0
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18
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1.98
14073486--14074211
343
2.1
342
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884
20
27
29
22
1.98
14073953--14074370
159
2.6
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446
17
29
29
23
1.97
14073868--14074371
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444
20
27
29
22
1.98
14075051--14075129
26
3.0
26
92
0
131
29
26
17
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1.98
14075103--14075775
159
4.2
158
76
8
450
19
27
30
21
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402