Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: NW_019167826.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_1, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  36299135

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   

This is table  40  of  402  ( 48166 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.4
44
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4
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51
3
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37
1.46
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22
2.3
22
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114
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8030562--8030653
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19
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8030779--8030882
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2.4
43
79
4
113
49
3
9
37
1.54
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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22
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0
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22
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8031686--8031744
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2.7
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10
75
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11
28
1.68
8031703--8031997
22
13.1
22
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11
132
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10
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11
6.9
11
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3
13
40
1.62
8031842--8032000
44
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38
1.62
8031845--8032025
22
8.3
22
73
6
116
45
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38
1.63
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21
4.2
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1.52
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20.4
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4.7
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99
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10
88
6
98
2
0
10
86
0.67
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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13
24
1.91
8039723--8039942
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2.7
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327
38
23
13
24
1.91
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16
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22
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3.2
43
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215
36
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17
24
1.94
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2.0
141
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22
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5
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102
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1.61
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20
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27
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5
3
86
0.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8049596--8049657
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2.3
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3
4
4
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19
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20
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14
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26
1.67
8068349--8068395
20
2.3
20
88
0
67
57
10
6
25
1.56
8068485--8068531
25
1.9
24
91
4
76
48
12
4
34
1.61
8068521--8068551
15
2.0
16
93
6
55
51
12
6
29
1.65
8068551--8068602
12
4.3
12
75
0
59
57
3
1
36
1.28
8068553--8068611
20
3.2
19
78
19
63
57
5
1
35
1.31
8068596--8068730
41
3.3
41
82
9
175
54
8
4
32
1.52
8068579--8068688
20
5.4
20
72
12
89
53
10
3
32
1.52
8068527--8068742
82
2.5
86
81
6
244
54
8
4
32
1.49
8068649--8068799
62
2.5
62
88
1
232
53
8
5
32
1.54
8068476--8068799
41
7.8
39
70
15
142
53
9
4
33
1.54
8069422--8069460
12
3.2
12
85
0
51
69
15
0
15
1.20
8069427--8069463
12
3.1
12
88
0
56
64
13
0
21
1.27
8070099--8070141
17
2.5
17
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0
77
23
39
20
16
1.92
8077814--8077858
16
3.0
16
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9
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33
0
0
66
0.92
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13
1.9
13
100
0
50
52
0
0
48
1.00
8079060--8079121
3
20.7
3
100
0
124
67
0
0
32
0.91
8079412--8079444
2
16.5
2
100
0
66
48
0
0
51
1.00
8081675--8081721
3
15.7
3
100
0
94
31
0
0
68
0.90
8081814--8081845
14
2.4
14
94
5
57
62
6
0
31
1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8085856--8085928
33
2.2
33
80
2
83
31
10
8
49
1.67
8091398--8091463
19
3.0
24
68
21
70
48
10
4
36
1.58
8095684--8095731
21
2.3
21
78
3
53
37
0
6
56
1.25
8096526--8096591
11
5.9
11
75
16
55
15
1
9
74
1.14
8096520--8096559
19
2.1
19
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0
53
10
7
7
75
1.20
8096873--8096915
13
3.2
13
90
3
59
44
0
6
48
1.29
8097319--8097421
51
2.1
51
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3
129
39
13
14
32
1.85
8109134--8109220
40
2.2
40
89
0
129
26
14
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1.87
8109306--8109670
39
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38
75
11
282
27
10
18
43
1.83
8109378--8109670
79
3.7
76
77
7
273
27
9
18
44
1.81
8109345--8109709
39
9.3
39
77
3
239
27
10
19
42
1.84
8109344--8109709
118
3.1
116
82
5
430
27
10
19
42
1.84
8109572--8109732
39
4.1
40
80
4
148
26
12
20
40
1.88
8109660--8109743
40
2.1
39
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2
105
29
14
16
39
1.88
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5.0
6
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0
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0
0
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1.00
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12
2.1
12
100
0
50
52
0
8
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1.31
8110805--8110836
15
2.2
14
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5
55
21
0
9
68
1.17
8111044--8111092
17
3.0
17
77
17
59
71
0
2
26
0.97
8111051--8111092
11
3.9
11
75
6
50
69
0
2
28
1.01
8112161--8112207
26
1.9
23
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12
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46
2
6
44
1.40
8112851--8112907
29
2.0
27
90
6
87
63
5
5
26
1.37
8118554--8118593
15
2.7
15
96
0
71
20
35
30
15
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8118625--8118708
18
4.8
18
71
26
58
19
2
1
77
0.95
8118629--8118708
5
15.2
5
85
14
76
18
2
1
77
0.95
8121988--8122094
54
2.0
54
84
0
142
57
6
12
23
1.57
8121988--8122106
54
2.2
54
83
3
139
59
8
10
21
1.57
8122995--8123022
10
2.8
10
100
0
56
28
10
28
32
1.90
8126179--8126250
7
10.1
7
77
14
51
81
0
9
8
0.86
8126196--8126250
17
3.3
16
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7
74
85
0
5
9
0.74
8126204--8126250
9
5.4
9
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7
71
87
0
2
10
0.63
8127275--8127551
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4.8
57
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12
237
53
9
12
23
1.69
8127279--8127489
112
1.9
112
85
3
291
52
10
13
24
1.71

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402