Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: NW_019167826.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_1, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  36299135

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
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          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   

This is table  28  of  402  ( 48166 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6164957--6165000
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2.1
22
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2.0
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11
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36
0
15
48
1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.4
31
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2
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6240684--6240769
31
2.8
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0
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0
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4
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1
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16
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2.3
24
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58
33
28
30
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13
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32
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6
81
27
0
3
69
1.04
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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15
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0
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1
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19
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0
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19
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123
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14
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95
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36
23
13
27
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6322351--6322796
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1.92
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48
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462
35
23
13
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9
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0
50
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0
92
0.40
6333163--6333228
19
3.6
18
89
6
96
51
0
1
46
1.10
6334603--6334657
10
5.6
10
81
10
51
23
1
0
74
0.91
6334612--6334668
20
2.8
20
82
10
55
28
3
0
68
1.06
6342228--6342257
2
15.0
2
100
0
60
50
0
0
50
1.00
6370455--6370588
67
2.0
67
95
0
241
44
10
16
29
1.81
6373753--6373826
29
2.6
29
80
4
80
45
1
2
50
1.24
6376474--6376906
216
2.0
216
94
0
758
25
6
23
44
1.77
6376918--6376956
17
2.3
17
86
0
51
15
0
23
61
1.33
6377415--6377465
20
2.6
20
87
9
70
15
7
1
74
1.13
6377626--6377713
21
3.8
22
70
21
65
30
5
11
52
1.60
6377656--6377713
21
2.6
22
81
8
73
29
6
13
50
1.68
6377864--6377899
17
2.2
17
90
5
56
58
0
0
41
0.98
6377876--6377964
38
2.4
38
86
5
119
49
8
6
34
1.61
6379664--6379727
34
1.9
33
83
3
83
35
9
12
42
1.75
6380462--6380510
20
2.5
20
100
0
98
28
26
24
20
1.99
6384757--6384807
16
3.2
16
97
0
93
31
15
11
41
1.83
6387501--6387555
17
3.2
18
80
10
62
27
0
0
72
0.85
6388270--6388346
20
3.6
21
69
26
54
44
1
0
54
1.08
6388646--6388678
11
3.1
11
86
8
50
36
0
3
60
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6388914--6388952
16
2.4
15
84
16
51
10
10
0
79
0.94
6392492--6392533
21
2.0
21
81
9
50
54
14
4
26
1.59
6392653--6392704
25
2.1
25
96
0
95
28
5
11
53
1.60
6393974--6394025
13
4.2
13
75
7
54
53
1
0
44
1.11
6394365--6394449
41
2.1
41
100
0
170
36
9
15
38
1.80
6394994--6395064
36
2.0
36
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2
108
53
1
8
36
1.40
6395047--6395088
15
2.9
14
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22
50
76
0
7
16
1.00
6396034--6396085
22
2.4
22
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12
63
69
7
1
21
1.24
6396831--6397289
118
4.0
117
78
11
442
49
6
7
36
1.58
6409101--6409192
35
2.6
35
82
1
103
32
9
4
53
1.54
6411558--6411770
104
2.0
104
97
0
399
27
7
11
53
1.63
6413136--6413197
3
20.7
3
100
0
124
66
0
0
33
0.92
6413723--6413757
9
4.1
9
85
14
56
88
0
0
11
0.51
6413727--6413759
8
4.1
8
85
14
50
87
0
0
12
0.53
6418480--6418508
15
1.9
15
100
0
58
75
0
13
10
1.04
6418878--6418946
10
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11
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20
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79
0
15
4
0.88
6418878--6418946
26
2.7
25
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20
72
79
0
15
4
0.88
6418886--6418950
16
4.1
16
74
16
55
78
0
15
6
0.94
6420085--6420230
21
6.5
21
71
16
105
39
8
14
36
1.77
6420083--6420211
46
2.8
46
91
4
215
39
10
13
36
1.79
6420150--6420281
69
1.9
70
85
1
185
37
7
14
40
1.74
6420241--6420307
22
2.9
23
77
6
73
37
8
13
40
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6420208--6420307
47
2.1
47
81
7
114
35
8
15
42
1.76
6420082--6420327
115
2.2
112
82
5
289
38
10
14
36
1.80
6420727--6420875
41
3.7
41
84
2
203
25
14
17
42
1.86
6420727--6420887
81
2.0
81
86
2
225
24
13
19
41
1.88
6420911--6421152
43
5.7
42
74
13
208
25
11
14
47
1.78
6420902--6421153
84
3.0
86
84
3
330
25
11
15
47
1.79
6420726--6421178
84
5.5
82
75
11
301
24
12
16
45
1.82
6421787--6421821
13
2.8
13
95
4
63
85
0
0
14
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12
70
13
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0
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0.81
6431140--6431423
43
6.6
42
82
7
290
23
13
19
43
1.86

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
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          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402