Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: NW_019167826.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_1, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  36299135

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          401   402   

This is table  51  of  402  ( 48166 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9791686--9791732
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24
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2.2
19
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0
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19
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2.1
21
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65
2
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1.05
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22
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103
32
17
5
44
1.71
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9843647--9843696
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10
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2.2
25
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3
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1.12
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2.0
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1.24
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2
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1.15
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25
3
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1.25
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38
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2
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1.22
9871561--9871634
20
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20
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64
25
2
2
68
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105
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1.79
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2.0
42
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161
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14
15
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2.3
12
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0
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0
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0
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2.6
22
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17
68
49
0
5
45
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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6.2
6
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0
0
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0
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0
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59
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22
1.38
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23
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2
20
1.08
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2.4
18
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2
21
1.16
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0
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1
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0.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9910721--9910771
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34
1.75
9913493--9913688
95
2.1
95
98
0
374
38
18
13
29
1.89
9916340--9916378
18
2.2
18
86
9
53
76
2
0
20
0.90
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19
2.0
20
90
9
64
76
0
7
15
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15
2.1
15
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0
53
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9
0
29
1.28
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15
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15
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0
34
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0
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0
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1.46
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27
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26
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11
1
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1.49
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26
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9918508--9918556
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26
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22
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0
70
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4
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9922684--9922708
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0
50
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0
0
12
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44
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2
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26
16
17
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1.90
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2.5
23
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19
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5
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0
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2.0
138
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338
43
15
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1.76
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160
5.3
160
75
7
718
32
10
13
43
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9944106--9944936
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316
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758
32
10
13
43
1.79
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302
4.0
302
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0
1883
41
14
16
27
1.87
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108
2.0
108
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0
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107
1.9
107
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307
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18
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2.0
22
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0
2
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0.92
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3
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27
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2
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1
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2.0
24
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2
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2.4
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8
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10
1
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13
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18
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36
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1.9
183
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1.91
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2.3
29
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0
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46
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0
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1.50
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0
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1.10
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5
13.0
5
75
9
60
75
1
4
18
1.06
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10001727--10001790
28
2.2
31
86
13
91
75
1
4
18
1.06
10001754--10001797
23
1.9
22
86
9
61
75
6
2
15
1.12
10002210--10002249
21
1.9
21
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0
62
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32
0
10
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22.7
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26
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1.9
30
85
0
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1
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28
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2.4
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22
20
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1.97
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1.99
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25
2.0
24
84
12
62
33
20
16
29
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402