Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: NW_019167826.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_1, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  36299135

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   

This is table  43  of  402  ( 48166 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
(0-2)
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37
1.63
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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78
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8522529--8522570
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19
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98
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655
36
21
12
28
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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19
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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10
50
1.53
8592798--8592870
12
5.6
13
72
19
55
36
4
8
50
1.51
8592896--8592932
14
2.5
15
91
4
58
37
5
2
54
1.38
8592818--8592948
17
8.1
16
67
25
55
35
4
6
53
1.48
8593180--8593204
12
2.1
12
100
0
50
32
16
8
44
1.76
8593741--8593831
19
4.9
18
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16
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17
2
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1.15
8593783--8593834
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24
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10
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19
1
3
75
1.06
8597111--8597153
17
2.6
16
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20
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16
6
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1.46
8597228--8597296
21
3.0
21
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10
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20
4
4
71
1.21
8598018--8598085
32
2.1
32
86
0
91
52
13
17
16
1.74
8599234--8599278
10
4.7
9
81
13
54
13
4
0
82
0.82
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21
2.0
20
85
4
55
21
14
0
63
1.30
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11
4.2
12
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19
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38
4
0
57
1.18
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11
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40
0
0
60
0.97
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24
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9
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1.28
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19
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20
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62
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1.46
8610693--8610751
19
3.0
20
68
7
59
20
8
23
47
1.77
8610777--8610815
19
2.1
19
90
0
60
30
17
15
35
1.91
8610967--8611004
3
12.7
3
94
0
67
28
0
2
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1.03
8611322--8611346
13
1.9
13
100
0
50
68
0
16
16
1.22
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8612535--8612578
18
2.4
18
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7
63
36
0
2
61
1.09
8612573--8612619
20
2.3
20
92
3
76
10
2
10
76
1.10
8613856--8613893
20
1.9
19
89
5
58
78
5
10
5
1.06
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33
8.7
33
71
6
116
35
16
17
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1.92
8614215--8614302
32
2.7
33
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15
17
30
1.91
8614111--8614331
65
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64
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7
203
34
16
17
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1.92
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1.88
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1.83
8614282--8614440
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2.3
68
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2
176
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12
16
36
1.86
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21
2.3
22
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6
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27
23
23
25
2.00
8614862--8615158
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6.5
46
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13
166
30
12
15
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1.83
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2.8
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14
125
28
12
16
42
1.84
8615206--8615356
46
3.3
45
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15
130
29
10
17
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1.83
8615238--8615396
46
3.5
44
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5
147
32
13
16
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0
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7
0
0.73
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3.0
741
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0
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13
34
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2.0
13
100
0
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7
0
0.77
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100
0
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0
0
0.53
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2
100
0
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0
0
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1.00
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1.77
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2.2
31
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0
127
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20
4
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1.73
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23
2.7
23
80
7
63
50
24
0
25
1.50
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8633566--8633611
24
1.9
24
100
0
92
13
21
10
54
1.69
8636549--8636589
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2.2
19
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4
57
60
9
0
29
1.28
8637292--8637358
8
8.1
8
79
12
64
79
0
14
5
0.92
8637292--8637356
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2.6
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4
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80
0
13
6
0.90
8637303--8637344
12
3.3
12
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50
80
0
14
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0.86
8637293--8637358
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4.1
16
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0
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130
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19
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50
94
0
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1.89
8642127--8642452
105
3.1
104
82
4
365
36
14
15
34
1.88

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402