Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: NW_019167826.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_1, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  36299135

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   

This is table  48  of  402  ( 48166 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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20
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202
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19
29
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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22
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171
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16
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170
2.3
170
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2.1
17
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2
5
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2.9
19
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21
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5
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1.9
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0
51
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
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2.0
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17
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1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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9
51
18
6
0
75
1.01
9407386--9407414
8
3.6
8
100
0
58
20
0
0
79
0.74
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23
2.0
23
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0
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20
4
0
75
0.97
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16
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15
58
15
4
0
80
0.86
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107
2.0
107
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0
369
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10
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13
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14
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9410465--9410519
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25
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9410603--9410676
18
4.1
18
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1.55
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17
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1.65
9410799--9410856
19
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18
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9
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12
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1.58
9410824--9410895
24
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8
2
27
1.39
9410908--9411102
32
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23
120
53
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7
29
1.60
9410973--9411016
22
2.0
22
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8
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22
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21
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1.54
9411012--9411071
23
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14
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1.54
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1.60
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54
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1
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54
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1.57
9411073--9411141
22
3.3
21
80
11
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10
7
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1.63
9411012--9411074
20
3.0
21
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11
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53
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4
31
1.54
9411767--9411802
12
2.9
12
91
4
54
66
11
0
22
1.22
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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0
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0
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26
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0
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0
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0
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0
0
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18
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25
1.84
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166
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1.65
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2.0
21
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22
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0
0
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1.9
72
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0
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1.75
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1.9
140
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2.5
12
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0
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1.82
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34
14
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128
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15
10
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259
2.0
259
98
0
1000
34
14
10
39
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9462567--9463172
128
4.8
126
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20
303
34
14
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39
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9464001--9464119
62
1.9
63
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170
36
8
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43
1.72
9463278--9464408
365
3.1
363
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33
11
12
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9463278--9464593
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1.8
721
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11
11
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240
2.0
239
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8
589
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12
10
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9468109--9468348
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1.9
127
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333
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126
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10
9.4
10
71
9
55
56
3
6
34
1.42

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402