Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: NW_019167826.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_1, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  36299135

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   

This is table  42  of  402  ( 48166 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8280036--8280077
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21
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1.9
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0
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28
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186
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265
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20
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2.0
21
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16
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0
21
0.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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20
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0
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2.5
26
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3
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13
3.1
15
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2.3
19
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20
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2.1
27
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1.84
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59
3.4
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7
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1.71
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4.0
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10
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9
6
46
1.64
8336352--8336394
22
2.0
22
90
0
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46
2
6
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1.43
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1.9
14
100
0
54
77
0
0
22
0.76
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3.1
17
81
10
63
75
1
1
21
1.00
8336383--8336440
21
3.0
20
73
14
59
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1
3
22
1.09
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4.4
89
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422
42
18
12
25
1.86
8337506--8337877
44
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45
83
3
396
43
19
12
25
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8337548--8337878
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1
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12
24
1.84
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2.2
20
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9
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8349346--8349620
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2.3
118
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7
373
37
11
6
44
1.67
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72
2.3
72
85
3
215
23
23
20
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1.98
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2.1
19
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25
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1.78
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2.5
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0
0
50
1.00
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0
50
1.00
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2
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1
0
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2.1
22
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4
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28
2
2
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1.14
8358111--8358147
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5.3
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0
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8367398--8367469
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43
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12
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1.74
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2.2
13
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0
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25
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53
1.46
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8367578--8367718
70
2.0
71
94
1
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42
9
11
36
1.73
8367517--8367778
130
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132
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2
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9
12
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193
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193
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9
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30
1.80
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11
2.3
11
100
0
50
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0
8
0
0.40
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1.9
38
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5
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41
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12
33
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36
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4
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2
2
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10
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22
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18
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1
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1
0.87
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Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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11
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20
10
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4.2
147
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5
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10
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2.0
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2.0
69
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1.87
8459725--8460808
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12
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1.87
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26
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8461852--8461909
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2.3
24
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11
0
11
77
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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1.9
17
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2.0
86
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203
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2.0
23
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0
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10
0
76
1.03

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402