Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: NW_019167826.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_1, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  36299135

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   

This is table  25  of  402  ( 48166 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5680138--5680356
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0
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5688554--5688629
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18
1
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1.16
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2.0
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0
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0
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0
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2
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0
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19
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2
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2.0
22
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31
0
2
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62
2.3
63
83
3
198
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4
7
38
1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5705776--5705837
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23
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7
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6
1
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1.25
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1.9
61
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3
173
46
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10
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3
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3
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0
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16
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0
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2.0
22
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2
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15
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0
0
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9.8
49
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570
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13
23
35
1.92
5726361--5726841
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3.3
147
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2
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13
22
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1.92
5727112--5727171
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2.3
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3
28
0
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5729151--5729180
2
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2
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51
50
3
0
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11
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13
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1.50
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2.9
32
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41
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2
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5731963--5732005
13
3.1
15
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12
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37
41
20
0
1.53
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2.4
18
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2
2
31
1.19
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19
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21
55
67
0
5
27
1.12
5732621--5732671
19
2.9
17
76
18
52
68
0
3
27
1.07
5732241--5732808
213
2.7
210
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5
770
43
8
15
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1.77
5732831--5732880
21
2.3
23
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60
0
0
40
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0
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0
8
0
0.40
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30.9
47
87
9
2105
25
13
26
34
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5753402--5753437
18
2.1
17
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5
63
63
5
5
25
1.38
5753413--5753508
47
2.1
44
84
7
122
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9
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1.55
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52
0
0
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1.00
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56
30
2
0
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1.03
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26
1
10
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1.37
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1.9
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10
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1.37
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1.9
131
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7
4
45
1.52
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0
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0
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173
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20
6
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1.77
5760679--5760913
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124
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19
5
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0
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113
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11
19
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5770251--5770404
42
3.5
42
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13
184
25
12
19
42
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5770199--5770410
48
4.7
47
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18
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237
1.8
237
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2
625
26
12
18
42
1.85
5770304--5771351
147
7.1
147
83
3
1217
24
13
20
41
1.88
5769912--5770700
384
2.1
378
82
4
933
25
12
19
42
1.86
5770827--5770879
24
2.2
24
82
3
61
15
13
24
47
1.81
5770304--5771325
441
2.3
443
85
2
1408
25
13
19
41
1.87
5771176--5771297
48
2.8
41
73
21
111
22
11
22
44
1.84
5771176--5771274
48
2.1
48
85
11
132
23
12
21
43
1.86
5771397--5771861
100
4.8
95
76
10
395
28
12
20
39
1.88
5771392--5771950
147
3.8
147
83
3
651
29
12
19
38
1.88
5771449--5771861
47
8.5
47
78
6
385
28
12
20
39
1.88
5772583--5772646
10
5.8
12
71
14
50
78
12
1
7
1.03
5772586--5772646
32
1.9
32
96
0
113
78
11
1
8
1.02
5772578--5772648
20
3.5
20
75
12
72
78
12
1
7
1.00
5774314--5774350
10
4.0
10
83
16
53
40
0
0
59
0.97
5781581--5783850
878
2.6
873
82
4
2658
34
8
18
38
1.82
5795310--5795356
25
1.9
24
82
4
58
27
4
0
68
1.08
5795301--5795381
32
2.5
33
82
13
96
24
2
2
70
1.12
5795550--5795600
21
2.6
19
87
9
75
64
1
7
25
1.31
5798824--5798865
21
2.0
21
95
0
75
35
21
9
33
1.86
5801864--5801905
22
2.0
22
90
4
68
47
9
14
28
1.75
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5810439--5810582
57
2.5
57
79
0
171
22
15
20
42
1.89
5811472--5811496
11
2.3
11
100
0
50
24
0
0
76
0.80
5811764--5811802
18
2.2
18
90
0
60
17
7
17
56
1.64
5811722--5811829
45
2.4
46
83
7
141
23
7
19
50
1.73
5811820--5811854
14
2.4
15
90
4
54
17
14
20
48
1.81
5814277--5814511
85
2.8
84
80
7
251
42
20
14
23
1.88
5814786--5814848
31
2.0
31
81
6
74
42
19
6
31
1.76
5816563--5816600
2
19.0
2
100
0
76
50
0
0
50
1.00
5819959--5820095
58
2.5
55
78
11
152
32
15
8
43
1.77
5820619--5820681
31
2.0
31
90
0
99
34
7
17
39
1.79
5822370--5822450
33
2.5
33
83
2
92
8
12
48
30
1.71
5822499--5822755
131
2.0
131
82
3
311
11
16
46
25
1.81
5822819--5822874
23
2.4
23
90
0
85
12
10
46
30
1.76
5823327--5823380
24
2.2
25
77
9
58
51
3
1
42
1.30
5826700--5826807
18
6.0
18
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17
100
48
12
5
34
1.64
5826700--5826782
16
4.9
17
76
16
75
45
12
6
36
1.66
5826700--5826807
20
6.0
19
73
19
90
48
12
5
34
1.64
5827063--5827256
53
3.9
53
73
16
180
57
10
6
25
1.56
5827140--5827224
21
4.0
21
78
4
91
63
8
2
25
1.34
5827126--5827227
41
2.5
41
87
1
134
61
9
2
25
1.41
5827154--5827236
41
2.0
41
90
0
130
62
9
3
24
1.42
5827220--5827258
20
2.0
20
84
0
51
58
10
5
25
1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5827204--5827318
30
3.8
30
89
3
160
56
10
5
27
1.54
5827204--5827318
60
1.9
61
89
5
180
56
10
5
27
1.54
5827337--5827394
23
2.5
22
74
20
55
56
8
0
34
1.30
5827372--5827440
21
3.2
21
74
8
66
57
8
2
30
1.43
5827952--5827992
18
2.2
19
86
4
57
43
0
17
39
1.49
5828410--5828730
43
7.5
43
87
4
414
39
18
11
30
1.86
5828393--5828730
85
3.9
86
84
6
400
39
18
12
30
1.87
5828410--5828730
128
2.5
128
86
4
432
39
18
11
30
1.86
5830173--5830255
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2.0
41
85
0
112
53
10
6
30
1.60
5830207--5830313
56
1.9
55
88
1
160
56
8
6
28
1.54

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402