Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  1  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
4592--4654
28
2.1
28
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8
81
28
20
20
30
1.98
17566--17648
39
2.1
39
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0
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1.92
20128--20156
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2.4
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0
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0
13
1.39
28441--28475
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2.2
16
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0
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54
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5
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29218--29251
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0
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0
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1.9
16
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0
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6
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0
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2.0
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33913--33988
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18
90
4
104
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25
36
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36084--36233
35
4.3
35
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8
182
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29
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32
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1.9
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14
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3.2
18
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53
19
29
15
35
1.93
36210--36256
23
2.0
23
100
0
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31
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40293--40340
21
2.2
22
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20
16
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40407--40531
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2.9
44
82
8
159
18
18
7
56
1.64
48766--48836
31
2.2
32
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7
92
38
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16
1.93
50033--50063
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1.9
16
93
0
53
19
29
16
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1.93
53768--53799
15
2.1
15
100
0
64
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15
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54665--54820
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2.0
78
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0
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29
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58476--58504
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3
100
0
58
68
0
0
31
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21
1.9
21
89
0
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50
30
7
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1.68
64338--64372
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1.9
18
100
0
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5
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66488--66515
14
2.0
14
100
0
56
50
21
14
14
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
66660--66753
47
2.0
47
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0
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17
19
1.87
92414--92451
20
1.9
20
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10
60
18
2
15
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1.43
107443--107476
17
1.9
18
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5
61
17
14
0
67
1.23
123390--123440
18
2.9
18
88
5
70
39
5
0
54
1.24
125689--125738
20
2.5
20
81
15
66
54
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28
1.62
128266--128302
14
2.6
14
95
0
65
16
5
21
56
1.59
151663--151726
29
2.2
29
83
5
76
57
4
4
32
1.40
152008--152054
19
2.3
20
78
14
51
44
0
2
53
1.12
167482--167538
28
2.0
30
82
6
73
36
3
1
57
1.26
181183--181231
18
2.7
18
83
0
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32
4
30
32
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183788--183835
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2.0
24
100
0
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16
4
41
37
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195697--195737
21
2.0
21
90
0
64
19
29
21
29
1.98
203418--203482
12
5.5
11
78
12
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3
3
29
1.23
203468--203506
17
2.2
18
95
4
71
66
2
0
30
1.05
203456--203507
9
5.6
9
80
13
52
67
1
1
28
1.12
203416--203507
37
2.4
36
76
15
89
64
3
2
30
1.21
210995--211020
10
2.6
10
100
0
52
57
0
0
42
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1.9
21
89
0
62
40
0
2
57
1.12
218640--218701
31
2.0
30
87
9
90
61
1
1
35
1.16
220354--220381
5
5.6
5
100
0
56
21
0
0
78
0.75
222438--222522
28
2.9
29
81
10
75
47
0
3
49
1.18
227472--227505
17
2.0
17
100
0
68
41
29
17
11
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
229165--229196
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2.0
16
93
0
55
31
15
21
31
1.95
238950--238994
19
2.3
19
85
11
56
37
0
6
55
1.26
257890--257932
15
2.9
15
92
0
68
39
16
39
4
1.69
260593--260658
33
2.0
33
96
0
123
43
19
12
24
1.85
263064--263522
246
1.8
251
80
5
554
30
13
17
38
1.88
263611--263673
30
2.1
31
87
3
92
39
1
9
49
1.45
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107
2.0
108
96
0
398
42
9
5
43
1.60
273054--273100
23
2.0
24
91
4
78
23
4
44
27
1.72
273462--273507
9
5.0
9
89
2
56
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15
15
39
1.88
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2492
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14
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1.86
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5.2
12
71
12
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1
0
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1.08
289657--289728
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15
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2
1
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1.21
289650--289730
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2.1
39
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0
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1
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293825--293930
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2.0
53
100
0
212
26
20
28
24
1.99
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10
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1.89
302485--302656
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73
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8
208
33
22
11
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1.89
303965--304089
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1
189
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16
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18
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26
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10
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316018--316253
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30
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13
223
34
50
0
14
1.47
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
316063--316107
22
2.0
22
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0
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21
1.62
316118--316223
54
2.0
54
92
0
176
33
50
0
16
1.51
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0
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0
0
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29
2.0
30
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3
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24
10
0
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1.23
318403--318506
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4.0
26
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0
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24
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2.0
26
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20
15
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28
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28
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7
192
29
14
28
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1.95
322954--323119
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56
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1
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322928--323112
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84
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5
214
29
14
29
26
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323042--323145
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28
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322958--323147
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56
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4
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16
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22
2.1
22
100
0
92
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13
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4
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29
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0
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24
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14
0
76
1.03
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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54
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34
22
24
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1.96
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34
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0
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13
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2.0
25
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0
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1.74
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3.9
12
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5
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4
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1.70
438024--438074
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2.0
25
92
0
84
39
5
17
37
1.74
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
438027--438074
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12
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0
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0
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4
0
47
1.22

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425