Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  423  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
128565822--128565877
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21
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1
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128597959--128597996
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19
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15
21
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128620320--128620512
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20.1
10
70
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1.23
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2
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1.20
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9
70
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1
3
64
1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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32
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150
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2.0
341
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2
20
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2.0
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5
2
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2.2
22
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20
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0
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1.9
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327
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7
29
1.53
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29
1.9
29
82
7
69
64
3
5
26
1.32
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
128660653--128660685
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6
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2.8
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0
2
22
0.94
128660481--128661390
301
3.1
292
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8
1205
55
6
7
29
1.53
128660888--128661390
154
3.4
151
78
11
565
55
6
7
30
1.53
128661162--128661203
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2.0
22
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76
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10
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1.15
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1.01
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96
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1.74
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125
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28
24
29
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1.97
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126
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1.92
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44
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44
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3
144
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23
13
33
1.93
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3.8
31
95
0
209
26
28
19
25
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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18
3.2
18
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33
3
15
47
1.63
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.51
128834147--128834231
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3.1
28
81
8
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47
5
5
41
1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
128843810--128843837
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2.2
82
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275
21
6
20
52
1.68

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425