Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  14  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3840986--3841039
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26
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1.20
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6
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1.38
3848919--3848972
25
2.2
26
86
6
76
64
0
7
27
1.20
3848926--3848991
25
2.6
26
83
9
75
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1
3
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2.0
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20
2.2
20
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0
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1.69
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312
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2.9
24
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1
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35
4
2
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1.35
3851143--3851201
25
2.5
24
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10
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8
6
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3851159--3851207
25
2.0
25
91
0
80
34
8
6
51
1.57
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16
3.1
15
90
6
69
31
2
2
64
1.16
3851361--3851412
8
6.5
8
82
8
61
30
1
1
65
1.14
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5.0
73
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2
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28
17
20
33
1.95
3864454--3864817
147
2.5
145
90
3
561
28
17
20
33
1.95
3864801--3864828
13
2.2
13
100
0
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14
14
7
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1.48
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239
3.9
237
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8
1274
28
17
21
33
1.95
3864837--3865060
73
3.0
73
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1
331
27
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3865040--3865068
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2.1
14
100
0
58
13
13
6
65
1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3864911--3865227
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1.9
167
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1
501
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17
21
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1.96
3865079--3865578
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6.5
73
77
12
484
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16
22
32
1.96
3865299--3865465
91
1.8
89
84
7
228
28
16
19
35
1.93
3865153--3865626
240
2.0
238
93
2
808
27
17
21
34
1.95
3865373--3865615
76
3.2
75
83
6
312
28
16
20
34
1.94
3864835--3865578
315
2.4
315
94
2
1282
28
16
21
32
1.95
3865592--3865633
14
2.9
15
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59
14
14
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1.48
3865595--3865644
14
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20
12
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1.43
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1.67
3866392--3866565
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2.9
60
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3
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1.9
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2.3
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25
2.0
25
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34
10
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15
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2
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1.16
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30
1
1
65
1.14
3872978--3873050
31
2.3
30
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9
83
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1
0
43
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2.2
36
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39
1
2
56
1.21
3893192--3893251
32
1.9
31
87
12
88
31
3
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63
1.20
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16
3.2
16
75
24
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53
0
0
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28
2.9
28
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22
88
48
1
0
50
1.08
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15
3.5
15
73
17
60
50
1
0
47
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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15
2.2
15
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21
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51
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18
2.0
18
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0
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98
2.0
98
99
0
387
22
15
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2.4
24
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8
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68
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0
28
1.05
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21
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22
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0
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1.12
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89
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7
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0
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0
0
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2.1
35
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9
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1.78
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173
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2.2
20
87
4
61
46
6
18
27
1.75
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3966118--3966214
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2.0
48
88
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142
55
2
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36
1.36
3966060--3966216
24
6.5
24
71
15
99
57
3
8
31
1.44
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2
14.5
2
100
0
58
51
0
0
48
1.00
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29
3.6
29
88
2
118
25
31
16
27
1.97
3978417--3978487
34
2.1
34
100
0
142
11
35
11
42
1.77
3979127--3979198
29
2.5
29
82
6
92
29
25
8
37
1.85
3982674--3982717
11
3.7
13
77
22
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31
4
18
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3982680--3982724
22
2.0
22
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15
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22
2.0
22
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0
72
33
2
15
48
1.57
3994452--3994500
15
3.3
15
91
0
80
24
22
12
40
1.88
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17
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17
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0
51
33
0
0
66
0.92
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28
2.2
28
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5
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57
1
0
40
1.08
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23
2.0
23
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0
76
40
10
14
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4021289--4021317
12
2.3
13
94
5
51
86
13
0
0
0.58
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7
3.7
7
100
0
52
84
0
0
15
0.62
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1.85
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24
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1.89
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27
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28
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25
0
23
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1.49
4053147--4053180
16
2.2
15
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5
50
41
0
0
58
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20
2.5
20
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3
68
65
5
17
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1.44
4059810--4059877
33
2.1
33
100
0
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57
16
5
20
1.60
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20
2.0
20
85
10
53
58
5
2
33
1.33
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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9
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14
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0
1
26
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30
2.0
30
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6
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0
1
30
0.99
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38
2.2
38
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111
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1
1
30
1.05
4068999--4069084
39
2.2
37
87
6
118
67
1
1
30
1.05
4069001--4069070
20
3.7
18
75
9
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68
1
1
28
1.06
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9
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9
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2
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1
1
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0
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1
2
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17
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0
3
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2
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0
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0
0
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2.0
25
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5
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1.74
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12
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12
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5
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39
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1.70
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25
2.0
25
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17
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1.74
4091231--4091278
12
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12
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0
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57
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2.0
36
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0
137
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2
18.0
2
94
5
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0
0
51
48
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
4123594--4123648
27
2.0
27
100
0
110
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14
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1.91
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2
14.5
2
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0
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0
0
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2
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2
100
0
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48
0
51
0
1.00
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11
100
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1
1
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1.16
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2.2
21
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0
0
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0.91
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0
0
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0.93
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0
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0
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1.61
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0
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0
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2.0
29
83
6
75
51
15
11
21
1.74

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425