Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  51  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13734405--13734548
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0
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4.2
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88
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23
111
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1.9
43
89
0
128
26
24
15
32
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.98
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0
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30
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0
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32
0
2
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1.05
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0
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2.0
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20
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50
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25
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19
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29
1.98
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1.9
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30
4
1
63
1.23
13835122--13835220
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5.2
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23
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35
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1.30
13836991--13837043
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2.0
26
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2
118
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33
29
1.95
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18
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1.97
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46
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29
18
28
1.98
13841975--13842239
93
2.8
93
77
10
256
22
29
19
28
1.98
13843491--13843525
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18
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2.1
15
100
0
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0
6
43
1.27
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13849426--13849557
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5.2
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200
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1.79
13849441--13849557
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191
36
27
5
30
1.79
13856562--13856618
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1.9
30
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1.84
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9
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Period
Size
Copy
Number
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50
1.79

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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