Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  283  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
87698815--87698840
9
2.9
9
100
0
52
11
0
23
65
1.25
87704787--87704908
43
2.9
43
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3
131
25
18
26
30
1.98
87705020--87705086
33
2.0
33
97
0
125
40
7
23
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1.82
87706705--87706793
27
3.3
27
71
4
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34
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1.87
87706775--87706860
27
3.2
26
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14
93
37
17
18
26
1.93
87707507--87707555
19
2.6
19
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0
80
18
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1.84
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24
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20
83
20
22
11
45
1.83
87711315--87711360
22
2.1
22
100
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1.66
87715912--87716256
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14
179
24
29
18
27
1.98
87715904--87716211
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2.2
139
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367
24
29
19
26
1.98
87727038--87727287
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6.2
40
91
1
385
22
28
24
25
1.99
87733468--87733599
40
3.3
40
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250
22
29
22
25
1.99
87741522--87741733
40
5.2
40
86
4
291
22
28
24
25
1.99
87741522--87741733
82
2.6
82
89
3
304
22
28
24
25
1.99
87748289--87748470
39
4.6
39
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194
25
26
21
25
1.99
87756307--87756492
40
4.7
40
86
5
227
26
26
21
25
1.99
87756274--87756492
80
2.7
82
79
12
242
25
26
21
26
1.99
87761059--87761207
31
4.8
31
89
0
235
27
18
26
26
1.98
87761229--87761438
47
4.6
47
79
11
195
29
15
27
28
1.96
87761229--87761439
42
4.6
47
80
11
197
29
15
27
27
1.96
87761277--87761447
91
1.8
93
87
7
258
29
14
26
28
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
87761355--87761465
42
2.6
42
87
2
161
31
13
26
28
1.94
87761368--87761482
42
2.7
42
85
4
115
32
15
25
26
1.96
87763662--87763758
48
2.0
48
95
0
176
35
8
26
29
1.86
87774243--87774350
44
2.4
44
87
3
144
29
23
13
33
1.93
87776330--87776443
28
4.1
28
84
0
156
29
30
12
27
1.93
87776334--87776443
56
2.0
56
90
3
177
29
30
12
27
1.93
87777761--87777834
31
2.4
31
88
0
103
21
35
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16
1.94
87778094--87778130
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0
2
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0.92
87778094--87778130
15
2.6
14
91
8
65
21
0
2
75
0.92
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14
2.1
14
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0
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10
6
10
73
1.25
87780550--87780675
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2.6
48
93
0
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14
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32
1.94
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15
2.9
15
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0
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20
1.64
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79
5
145
24
24
26
24
2.00
87810970--87811154
79
2.3
82
82
7
220
24
24
27
24
2.00
87810970--87811187
79
2.7
79
78
6
174
24
23
27
24
2.00
87813372--87813480
45
2.3
46
86
7
141
33
11
28
27
1.91
87816339--87816389
25
2.1
24
82
10
59
35
5
5
52
1.50
87821125--87821197
6
11.8
6
73
16
60
47
13
19
19
1.82
87821125--87821197
31
2.4
31
90
0
110
47
13
19
19
1.82
87821317--87821393
28
2.8
27
82
7
84
36
20
22
20
1.95
87821551--87821609
22
2.7
22
81
0
64
32
22
25
20
1.98
87821975--87822151
54
3.3
53
83
1
228
24
19
18
37
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
87821975--87822151
81
2.2
81
88
2
257
24
19
18
37
1.94
87821988--87822148
27
6.0
27
88
1
207
24
19
18
37
1.93
87822190--87822423
27
8.7
27
87
0
288
31
8
20
38
1.84
87822133--87822437
27
11.3
27
81
2
265
32
8
21
37
1.84
87822133--87822428
81
3.7
80
81
0
304
32
8
20
37
1.84
87822416--87822888
27
17.5
27
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0
649
39
9
22
28
1.85
87822414--87822888
135
3.5
135
92
0
736
39
9
22
28
1.85
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2.0
26
100
0
106
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2.1
16
94
0
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30
12
30
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1.92
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3.6
26
79
10
103
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26
27
1.96
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2.5
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0
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17
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1.98
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20
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0
0
50
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0
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31
22
8
37
1.84
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25
2.4
27
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10
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1
7
53
1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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18
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0
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17
13
48
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.94
87907464--87907623
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25
20
27
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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25
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19
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28
20
0
51
1.48

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425