Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  402  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
122845919--122845967
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16
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1.34
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18
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122853001--122853062
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29
2.9
28
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2
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1.25
122878297--122878345
19
2.5
19
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2
59
1.34
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2.0
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119
39
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15
30
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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152
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152
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24
27
1.93
122947452--122947647
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6.5
30
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1
252
26
47
4
21
1.69
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1
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1.26
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24
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31
5
5
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1.46
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20
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5
55
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2
2
62
1.24
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13
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18
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29
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1.9
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2.2
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19
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27
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19
55
36
4
1
56
1.29
122964285--122964404
46
2.6
45
80
10
111
31
5
5
58
1.41
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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22
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5
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1.45
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2.1
26
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1
7
57
1.38
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15
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2
2
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1.24
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0
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0
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29
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122
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1.91
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0
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2
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1.21
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1.28
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1
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0
2
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0
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0
0
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2.4
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15
57
62
0
7
30
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.97
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0
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2.1
22
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1.53
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1
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54
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1
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24
22
35
1.95
123021641--123021806
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2.0
81
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1.97
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1.98
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0
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22
20
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1.97
123039459--123039652
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0
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22
21
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1.98
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20
21
23
34
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
123053621--123053720
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0
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20
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1.9
24
100
0
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26
28
0
45
1.54

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425