Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  379  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
116526794--116526841
25
1.9
25
86
0
69
25
16
25
33
1.96
116542581--116542764
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24
26
24
24
2.00
116550481--116550624
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2.9
49
85
4
200
27
27
20
25
1.99
116552753--116552816
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4.4
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13
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14
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1.54
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2.6
49
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3
166
29
29
17
23
1.97
116558728--116558837
6
17.8
6
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15
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10
20
20
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19
3.7
19
71
26
70
45
9
23
21
1.81
116558740--116558837
25
3.7
25
77
15
106
45
11
21
21
1.82
116558740--116558815
31
2.5
31
91
0
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44
10
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22
1.83
116558740--116558837
31
3.4
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16
105
45
11
21
21
1.82
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27
2.7
27
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6
105
36
18
22
21
1.95
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22
2.8
23
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7
74
30
22
25
20
1.98
116559659--116559748
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3.3
27
82
0
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22
17
22
37
1.94
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2.5
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1
257
30
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21
38
1.86
116559847--116559999
81
1.9
81
94
0
270
30
9
20
39
1.84
116559792--116559999
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7.7
27
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2
231
28
9
22
38
1.86
116561677--116561711
18
1.9
18
88
0
52
57
8
28
5
1.52
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4.4
40
81
7
200
24
22
27
26
2.00
116565639--116565815
80
2.2
79
86
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241
24
22
27
26
2.00
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29
2.0
29
100
0
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27
1.99
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2.0
48
100
0
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45
22
4
27
1.70
116595236--116595395
39
4.1
39
91
0
266
21
23
30
25
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
116598692--116598817
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2.3
56
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1
200
46
4
15
34
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116599278--116599354
26
3.0
26
80
0
82
27
18
19
35
1.95
116606430--116606489
27
2.3
26
85
2
75
35
20
23
21
1.96
116606534--116606587
27
2.0
27
82
10
67
33
20
25
20
1.97
116616457--116616666
40
5.2
40
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2
305
25
24
28
21
1.99
116624592--116624801
40
5.2
40
87
2
305
25
24
28
21
1.99
116626137--116626170
16
2.1
16
94
0
59
11
8
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32
1.71
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25
2.0
25
100
0
98
32
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18
20
1.96
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2.1
13
100
0
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29
22
29
18
1.97
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3.7
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11
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30
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1.98
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2
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2
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0
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0
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0
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0
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63
0
36
0
0.95
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49
2.7
49
82
8
155
21
28
20
28
1.98
116662329--116662451
47
2.7
46
81
9
146
28
29
17
25
1.97
116662376--116662544
47
3.6
47
74
8
128
27
30
15
26
1.96
116662282--116662544
94
2.8
92
74
7
246
26
28
17
27
1.98
116664664--116664699
2
18.0
2
88
0
54
44
0
2
52
1.15
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2.7
26
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11
84
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29
15
23
1.95
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2
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2
93
0
59
47
0
0
52
1.00
116682347--116682397
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2.0
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100
0
102
35
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15
25
1.94
116684689--116684719
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2.4
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100
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54
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0
29
1.42
116687191--116687266
34
2.2
34
95
0
134
28
26
11
32
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
116694147--116694183
11
3.4
11
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0
65
0
18
21
59
1.38
116697295--116697370
29
2.6
30
85
4
109
22
25
9
43
1.82
116697352--116697426
30
2.5
30
78
6
89
24
22
13
40
1.90
116699564--116699650
29
3.0
29
81
3
104
28
29
11
29
1.92
116700024--116700087
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4.9
13
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0
92
32
7
21
37
1.83
116701849--116701881
16
2.1
16
94
0
57
18
3
27
51
1.60
116709746--116709870
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20.3
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16
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48
13
18
19
1.80
116709767--116709870
31
3.4
31
70
5
93
48
13
19
19
1.81
116709755--116709861
37
2.9
37
80
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126
48
13
19
18
1.80
116709803--116709870
25
2.7
25
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0
91
48
13
19
19
1.81
116709990--116710095
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4.0
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1
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2.2
18
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48
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22
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0
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29
1.99
116724623--116724674
27
1.9
27
88
7
79
36
9
11
42
1.74
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.83
116724713--116724893
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2.2
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1.82
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26
20
23
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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54
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228
23
22
28
25
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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1.99
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194
26
21
26
25
2.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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