Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  330  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102513273--102513331
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2.1
28
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0
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20
28
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28
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25
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15
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10
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0
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28
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16
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23
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2.0
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7.0
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15
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0
1
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1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
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81
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37
1.54
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2.5
23
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102562488--102562541
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16
14
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1.89
102581202--102581261
24
2.5
24
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21
23
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1.99
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24
2.4
23
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1
25
0
72
0.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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0
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2.0
462
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2.0
164
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1.91
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16
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2.7
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1
157
28
18
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28
1.98
102612065--102612102
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42
1.9
42
84
0
108
29
19
25
24
1.99
102675870--102675927
27
2.1
28
81
9
66
17
6
8
67
1.39
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102678523--102678849
33
9.8
32
69
12
131
28
23
16
31
1.96
102678515--102678848
101
3.3
101
90
1
537
28
23
16
31
1.96
102690368--102690477
54
2.0
54
89
0
166
16
14
41
27
1.87
102690375--102690533
54
2.9
54
78
5
144
18
16
37
27
1.92
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43
3.4
43
81
6
192
33
24
14
28
1.94
102712040--102712208
47
3.6
47
81
8
168
24
31
16
27
1.96
102712085--102712211
46
2.7
47
82
4
159
24
31
16
27
1.96
102713980--102714096
33
3.6
33
83
3
139
28
27
14
29
1.95
102714108--102714220
33
3.4
33
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0
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7
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1.80
102714907--102714949
20
2.0
22
86
8
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27
23
0
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1.51
102726825--102726972
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6
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33
24
13
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1.93
102728141--102728210
16
4.1
17
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14
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58
7
2
31
1.40
102734942--102735067
40
3.2
39
78
6
130
22
25
23
28
1.99
102734881--102735067
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2.3
80
78
12
204
23
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23
26
2.00
102737218--102737257
2
20.0
2
100
0
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0
0
50
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2.0
14
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0
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7
28
1.84
102738269--102738508
119
2.0
119
96
0
444
25
20
16
37
1.93
102738530--102738631
37
2.7
37
92
4
161
69
6
7
15
1.34
102738546--102738629
19
4.6
19
76
12
70
71
5
7
15
1.28
102739042--102739081
14
2.9
14
82
14
55
52
12
0
35
1.39
102740140--102740182
23
1.9
22
85
4
59
34
53
2
9
1.46
102740158--102740260
40
2.6
40
83
4
129
37
38
9
13
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102747876--102748041
35
4.6
35
82
8
172
31
10
24
33
1.90
102747876--102748046
75
2.4
75
85
7
221
31
11
23
33
1.90
102754675--102754818
72
2.0
72
95
0
261
48
15
6
28
1.71
102762200--102762233
17
2.0
17
100
0
68
41
17
23
17
1.90
102776392--102776558
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3.8
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10
231
28
29
20
20
1.98
102776449--102776514
20
3.3
20
69
12
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27
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19
21
1.97
102776399--102776560
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1.9
85
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0
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28
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20
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3.0
30
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10
1.62
102778946--102779023
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15
16
11
1.67
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1.8
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2
274
28
29
20
22
1.98
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10
183
29
28
20
22
1.98
102781820--102781963
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3.1
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21
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29
27
19
22
1.98
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22
2.5
22
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0
103
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10
1.62
102786535--102786568
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1.9
17
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1.43
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0
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0
0
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0
0
18
0.70
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14
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267
22
28
20
28
1.98
102800572--102800622
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4.7
11
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64
1
0
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1.05
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0
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1.21
102805858--102805893
2
18.0
2
94
0
63
50
2
0
47
1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102808044--102808068
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1.9
13
100
0
50
40
0
0
60
0.97
102811815--102811850
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2.0
18
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25
0
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1.54
102815349--102815445
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2
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0
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0
0
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1.00
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1.59
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2.0
28
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0
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1
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2
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102830687--102830774
13
7.4
12
67
24
53
56
2
1
39
1.19

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425