Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  121  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
35906245--35906306
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2.5
25
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0
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117
20
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30
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1.98
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3.0
30
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101
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15
16
10
1.65
35933040--35933119
15
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92
58
13
17
10
1.62
35933051--35933128
15
5.2
15
78
9
79
56
15
16
11
1.67
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93
1.8
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317
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22
20
1.98
35936064--35936239
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3.8
46
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10
232
28
29
21
20
1.98
35941155--35941257
29
3.6
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77
5
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30
30
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25
2.4
25
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0
100
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25
5
16
1.64
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
35960339--35960398
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29
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0
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35967236--35967285
27
1.9
26
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10
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1.60
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1.83
35971210--35971447
27
8.8
27
89
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323
30
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7
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18.3
27
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2.6
28
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28
2.9
27
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88
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1.87
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2.4
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23
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1.84
35971605--35972041
27
16.3
27
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18
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1.95
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130
17
17
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1.80
35972519--35972586
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2.7
25
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62
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17
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258
20
28
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1.94
35986588--35986751
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2.3
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100
0
328
18
28
17
35
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
35986588--35986785
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3.5
28
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32
25
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1.94
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29
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31
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1.97
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29
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180
25
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1.97
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1.95
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28
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21
1.99
36058479--36058650
93
1.8
93
93
0
299
27
29
22
21
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3.0
30
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8
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16
10
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15
5.4
15
80
7
92
58
13
17
10
1.62
36060979--36061056
15
5.2
15
78
9
79
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11
1.67
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1.8
93
96
0
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30
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20
1.98
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28
29
21
20
1.98
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5.5
29
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4
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26
16
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25
1.97
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26
2.1
26
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0
90
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5
20
31
1.75
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1.9
13
100
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1.8
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2
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1.98
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29
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1.98
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29
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1.98
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0
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20
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22
1.98
36091562--36091685
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28
19
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22
1.98
36091563--36091778
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2.3
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4
258
27
19
30
22
1.98
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4.1
40
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26
20
26
1.99
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3.7
40
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9
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26
26
21
25
1.99
36105580--36105895
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28
21
28
22
1.99
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27
20
29
22
1.99
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367
2.0
367
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0
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25
30
1.91
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7
192
28
16
30
24
1.96
36124535--36124655
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2.9
42
80
7
154
31
15
24
28
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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23
1.98
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39
3.9
39
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0
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31
20
23
1.98
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37
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0
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20
23
1.98
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48
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0
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2.0
22
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2.0
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0
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1.99
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80
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22
25
23
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1.99
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1.97
36177550--36177819
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17
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1.97
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48
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28
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1
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22
23
29
25
1.99
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2.2
120
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22
23
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25
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12
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1.93
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27
2.9
27
87
5
72
30
15
22
32
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
36204455--36204572
31
3.5
35
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22
22
16
38
1.93
36204478--36204572
31
3.1
31
96
0
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21
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40
1.91
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24
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22
22
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1.99
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48
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207
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22
22
28
1.99
36204763--36204906
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2.0
72
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4
220
26
22
22
29
1.99
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20
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0
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25
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1.81
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54
2.6
54
83
4
181
31
7
20
39
1.82

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425