Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  9  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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1.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Indels
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A
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Entropy
(0-2)
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0
11
88
0.52
2617390--2617430
21
2.0
21
90
0
64
19
29
21
29
1.98
2622610--2622670
31
1.9
33
83
12
83
42
14
4
37
1.68
2629258--2629293
18
2.0
18
89
10
56
5
16
16
61
1.53
2629399--2629439
20
2.0
20
100
0
82
31
14
24
29
1.95
2634713--2634796
42
2.0
42
88
0
123
19
13
47
20
1.82
2641340--2641383
4
11.5
4
80
9
56
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2
2
22
1.07
2641426--2641457
15
2.1
15
94
0
55
65
0
0
34
0.93
2641647--2641699
27
2.0
27
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0
79
60
0
7
32
1.25
2641905--2641966
25
2.5
24
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54
3
9
32
1.49
2641959--2642029
35
2.0
37
86
5
101
59
4
4
32
1.36
2642016--2642054
20
1.9
21
89
5
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46
5
7
41
1.55
2644791--2644815
13
1.9
13
100
0
50
8
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28
0
1.22
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9
2.8
9
100
0
50
68
12
12
8
1.40
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44
2.3
45
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3
127
30
21
13
34
1.92
2655318--2655403
46
1.9
44
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4
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29
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1.94
2658011--2658303
72
4.1
72
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0
408
39
15
19
25
1.91
2664346--2664389
23
1.9
23
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9
63
63
6
9
20
1.46
2666024--2666532
133
3.8
133
90
1
759
26
22
21
30
1.98
2666164--2666504
43
7.7
44
65
15
157
26
22
21
29
1.99
2678200--2678247
22
2.3
20
75
7
51
56
12
4
27
1.54
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2678621--2678664
23
1.9
23
86
9
63
63
6
9
20
1.46
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26
2.2
26
84
9
73
63
0
13
22
1.29
2685500--2685767
72
3.7
72
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3
405
38
16
19
25
1.92
2685500--2685802
72
4.2
72
86
5
380
38
16
19
25
1.92
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2
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0
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0
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17
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0
0
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1.00
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9
9
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2
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3
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2.0
88
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0
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70
1.9
70
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0
225
31
11
20
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2.7
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2
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26
20
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24
1.99
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1.9
42
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30
17
30
22
1.97
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42
4.5
41
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7
139
27
20
28
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1.99
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0
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0
0
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2.1
27
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12
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43
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16
20
1.88
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30
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2
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22
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1.97
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224
2.9
223
87
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905
41
17
16
24
1.89
2720676--2720708
2
17.0
2
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48
0
0
51
1.00
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0
0
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2.2
13
100
0
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10
21
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31
2.6
29
71
19
75
44
2
8
45
1.47
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2744253--2744299
21
2.2
21
80
0
58
36
0
0
63
0.94
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36
2.3
36
79
12
96
58
0
3
37
1.16
2746540--2746571
9
3.4
10
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12
50
65
9
0
25
1.22
2748605--2748639
18
1.9
18
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0
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57
2
2
37
1.29
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22
2.0
23
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26
6
4
63
1.38
2755386--2755423
19
2.1
19
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2
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2.0
21
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2
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1.34
2775381--2775414
14
2.4
14
90
0
50
67
2
11
17
1.34

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425