Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  424  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
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Copy
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Consensus
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Score
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1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
A
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7
31
1.78
129090331--129090450
18
6.6
18
69
18
70
64
2
5
27
1.30
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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1.33
129090607--129090678
37
1.9
37
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5
92
30
2
5
61
1.33
129090616--129090688
37
2.0
36
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5
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4
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1
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0
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27
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2.0
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0
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5
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1.48
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2.0
27
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1
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1.30
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1.54
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22
1.39
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0
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0
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36
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27
1.93
129153728--129154271
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73
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20
28
1.91
129153728--129154271
220
2.5
218
80
6
564
37
14
20
28
1.91
129154109--129154227
38
3.2
38
79
7
118
40
10
19
29
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
129154625--129154711
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45
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0
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1.81
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22
19
15
1.89
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20
19
1.89
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1.72
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141
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2.3
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0
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22
32
1.91
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43
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11
265
29
18
21
29
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
129230694--129231082
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1.98
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1.8
316
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29
1.97
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134
1.8
134
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354
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19
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30
1.97
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0
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1.90
129268831--129269002
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23
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1.90
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12
4.7
11
76
9
54
24
1
9
64
1.34

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425