Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  411  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
125194892--125194998
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4.1
26
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2
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3.1
137
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24
1.98
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5.2
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0
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36
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5.2
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1.96
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2.7
54
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2
245
17
25
23
33
1.96
125205027--125205131
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0
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125206452--125206509
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2
82
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66
41
0
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5.2
27
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160
18
23
23
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1.80
125225131--125225292
78
2.1
78
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2
281
35
23
6
34
1.80
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14.6
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39
20
8
30
1.83
125226848--125227241
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7.3
54
90
0
556
39
20
8
30
1.83
125226848--125227295
27
16.6
26
77
7
331
39
21
8
30
1.83
125226927--125227349
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15.7
26
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10
131
39
22
8
30
1.84
125227341--125227543
27
7.8
27
81
8
224
36
18
20
24
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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19
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0
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34
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21
1.96
125227395--125227548
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2.1
73
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2
211
35
18
20
25
1.95
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2.0
100
89
0
311
35
18
21
25
1.95
125227820--125227871
27
2.0
26
84
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68
17
26
21
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0
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1.00
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2.5
25
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3.6
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19
19
14
46
1.83
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2.8
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2.7
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0
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19
19
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2.0
20
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4
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54
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1.53
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53
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3
28
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3.0
22
76
20
66
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3
31
1.50
125232618--125232675
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1
31
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125232906--125232947
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1.9
22
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0
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17
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1.93
125235160--125235937
173
4.5
172
82
8
837
37
18
17
26
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
125235210--125235937
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2.8
262
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1.93
125236628--125236711
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3.2
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96
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25
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2.0
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19
19
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22
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22
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1.50
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2.6
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0
3
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1.17
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0
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Size
Copy
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Percent
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Percent
Indels
Score
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G
T
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1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Indels
Score
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0
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0
0.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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1
0
46
1.09

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425