Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  381  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.4
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0
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0
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28
29
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20
1.98
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3.1
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29
29
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20
1.98
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2.2
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36
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34
1.84
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35
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10
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100
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28
20
22
1.98
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2.0
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0
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7
90
28
7
1
62
1.33
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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50
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204
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2
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2.3
24
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54
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1.66
117234165--117234202
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3.2
12
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0
67
57
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15
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1.62
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2.0
45
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12
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45
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276
30
17
22
29
1.97
117240783--117241274
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5.5
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12
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31
17
21
29
1.96
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3.5
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29
1.96
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2.7
181
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29
1.96
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20
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26
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270
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183
18
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22
35
1.95
117269090--117269229
54
2.6
55
89
2
203
18
23
22
35
1.95
117273176--117273362
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7.2
26
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0
304
34
5
24
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1.78
117274982--117275121
27
5.2
26
82
4
129
17
22
22
36
1.95
117274982--117275121
54
2.6
55
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167
17
22
22
36
1.95
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22
2.5
22
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2
94
45
9
0
45
1.35
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2.2
20
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54
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30
1.28
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41
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32
1.80
117296166--117296264
6
18.8
5
75
19
71
76
1
4
18
0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3
16
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2.6
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48
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39
1.40
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167
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24
15
27
1.96
117305139--117305294
42
3.7
42
78
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149
32
24
16
27
1.96
117307420--117307463
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2.7
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84
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9
24
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29
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22
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0
26
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14
77
4
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22
1
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47
1.61
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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0
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117338213--117338266
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0
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53
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20
17
50
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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117440116--117440250
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2.1
137
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0
529
24
18
24
32
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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79
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2.1
40
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2.5
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53
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0
19
1.45

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425