Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  149  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
45357569--45357594
9
2.9
9
100
0
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11
0
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1.18
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2.3
27
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0
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1
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37
1.9
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0
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1.96
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2.2
48
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0
176
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27
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1.80
45366976--45367056
37
2.2
37
93
0
135
24
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22
20
1.98
45367215--45367340
48
2.6
48
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0
180
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28
2.8
28
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90
26
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20
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1.98
45372890--45373110
43
5.2
43
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1
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30
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12
1.92
45372890--45373110
85
2.6
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1
408
30
32
23
12
1.92
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2.2
48
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0
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27
5
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1.80
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2.0
25
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39
2.0
39
94
0
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11
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40
4.6
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28
23
2.00
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3.0
28
86
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118
27
29
15
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1.96
45393530--45393575
24
2.0
23
87
12
67
10
21
17
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1.77
45393532--45393582
16
3.2
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10
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19
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1.75
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5.5
8
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0
52
11
22
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1.80
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16
2.0
16
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0
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40
4.2
40
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27
23
25
2.00
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4.2
40
80
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169
23
27
23
25
2.00
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0
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32
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29
1.94
45417719--45417882
29
5.7
29
93
0
265
32
15
21
29
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
30
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10
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32
1.82
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24
2.6
24
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7
81
33
27
16
22
1.95
45432021--45432081
30
2.0
30
87
0
86
29
24
8
37
1.84
45438736--45438924
29
6.5
29
85
3
238
26
16
30
25
1.97
45446850--45447036
29
6.5
29
83
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220
27
16
30
25
1.97
45446850--45446970
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2.1
57
95
3
217
30
15
27
26
1.96
45452240--45452280
21
2.1
19
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55
63
0
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34
1.08
45452526--45452828
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0
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1.25
45452559--45452696
11
11.6
11
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61
0
3
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1.18
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16
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15
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14
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63
0
3
32
1.10
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3.5
36
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104
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0
3
33
1.20
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24.1
7
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20
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1
5
34
1.28
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12
156
60
0
3
34
1.19
45452549--45452710
58
2.7
58
72
15
145
62
0
3
33
1.17
45452629--45452713
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38
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1
2
34
1.16
45452552--45452780
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59
59
0
5
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1.26
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2.0
15
100
0
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20
26
6
46
1.75
45457164--45457391
51
4.4
50
73
12
144
35
5
30
27
1.80
45457207--45457356
52
2.9
51
81
10
164
35
6
28
29
1.83
45459536--45459623
44
2.0
44
95
0
158
30
22
4
42
1.74
45465622--45465656
9
3.9
9
100
0
70
68
11
0
20
1.20
45467265--45467325
27
2.3
27
88
0
86
1
18
3
77
0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
45467286--45467344
6
9.3
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75
17
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5
15
0
79
0.89
45467290--45467344
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2.8
20
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23
62
5
14
0
80
0.89
45469916--45469992
39
2.0
39
97
0
145
44
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11
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1.79
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385
2.0
384
97
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1452
37
15
18
28
1.91
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20
2.0
20
100
0
82
24
24
4
46
1.72
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29
4.0
29
81
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28
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15
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1.96
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58
1.9
58
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1
163
27
27
16
28
1.97
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18
1.9
18
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20
38
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1.93
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2.0
30
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10
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1.82
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22
2.00
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23
27
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2.00
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2.0
40
100
0
158
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1.73
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2.0
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31
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1.85
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15
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1.41
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1
1
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33
1
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0
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0
0
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52
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3
1
31
1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
5
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0
4
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0
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0
4
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0
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0
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0
0.54
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21
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1.98
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19
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22
1.99
45531658--45531904
117
2.1
120
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358
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29
22
1.99
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19
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10
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16
24
18
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.83
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1.84
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1.86
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2.0
136
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0
315
28
29
21
21
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
45597906--45598081
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28
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21
1.98
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1.98
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1.98
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4.6
40
85
7
149
23
21
32
22
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425