Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  392  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
120360324--120360368
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2.1
21
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0
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0
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0
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0
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94
0
63
0
2
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1.15
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11
5.9
11
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1.38
120386528--120386591
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2.0
32
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9
85
23
12
1
62
1.38
120387014--120387057
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1.9
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0
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0
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57
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0
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2.0
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0
2
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1.13
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3.3
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2
56
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2.2
20
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2
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18
2.1
18
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5
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40
0
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21
2.4
21
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3
59
36
1
3
57
1.28
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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25
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120403737--120403791
25
2.1
27
83
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69
16
10
5
67
1.39
120403771--120403831
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2.6
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24
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0
73
0.92
120403780--120403831
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2.5
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15
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25
0
0
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41
0
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1
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1.10
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33
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2
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0
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36
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59
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2.9
23
82
8
68
39
0
4
56
1.19
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2.3
23
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0
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2.0
34
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8
82
80
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3
15
0.91
120404475--120404508
11
3.1
11
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0
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120404496--120404562
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58
1
0
40
1.07
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2.1
19
90
0
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2
17
1.01
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2.5
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58
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1
38
1.20
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79
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9
1.00
120405212--120405265
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3
11
5
1.02
120405615--120405657
22
1.9
22
85
4
59
53
4
0
41
1.21
120406916--120406959
20
2.1
21
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20
25
1.74
120407754--120407794
2
20.5
2
100
0
82
51
0
0
48
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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5
35
1.37
120408071--120408169
24
4.0
24
76
12
103
56
3
6
34
1.39
120409921--120410327
44
9.3
44
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12
286
17
23
23
35
1.95
120409873--120410482
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7.0
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89
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809
19
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22
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19
2.2
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86
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0
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0
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1.00
120422599--120422695
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5
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0
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9
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Indices
Period
Size
Copy
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Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
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C
G
T
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(0-2)
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Period
Size
Copy
Number
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7
43
1.68
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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40
1
13
44
1.51

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425