Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  11  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
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1.35
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Percent
Indels
Score
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22
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31
1.46
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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3.4
12
82
17
55
28
0
0
71
0.87
3206523--3206570
25
2.0
24
84
12
62
52
4
2
41
1.32
3207953--3207999
23
2.1
22
84
11
60
59
21
2
17
1.47
3209327--3209365
15
2.7
15
84
4
53
69
5
0
25
1.09
3210718--3210745
13
2.2
13
100
0
56
42
21
0
35
1.53
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21
2.6
22
77
20
59
44
3
0
51
1.18
3211835--3211889
26
2.1
26
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30
1
5
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1.29
3213405--3213493
42
2.1
42
85
0
115
28
30
20
21
1.98
3215677--3215729
26
2.0
26
100
0
106
60
7
0
32
1.25
3216634--3216683
24
2.1
24
100
0
100
28
20
18
34
1.95
3217885--3218051
85
2.0
86
83
8
216
35
17
17
29
1.93
3219768--3219838
32
2.2
32
82
0
88
26
15
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40
1.89
3221314--3221347
16
2.1
16
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0
59
35
29
11
23
1.90
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6
7.8
6
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0
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4
34
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1.77
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44
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0
176
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11
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23
2.0
23
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45
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23
2.2
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40
14
8
38
1.75
3238708--3238776
20
3.5
20
77
13
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39
1
1
57
1.16
3240137--3240161
12
2.1
12
100
0
50
16
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20
40
1.91
3240139--3240245
45
2.4
45
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3
162
20
20
19
39
1.93
3240229--3240263
18
1.9
18
94
0
61
17
28
17
37
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3242752--3242797
23
2.0
23
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12
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45
10
6
36
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23
2.2
22
82
10
57
40
14
8
38
1.75
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20
2.8
20
82
15
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42
1
1
54
1.21
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25
1.9
26
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4
64
38
2
0
59
1.09
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2.4
45
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3
160
20
20
19
38
1.93
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18
1.9
18
94
0
61
17
28
17
37
1.92
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23
2.0
23
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45
10
6
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1.65
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44
0
0
55
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2.0
22
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0
0
50
1.00
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2
2
56
1.24
3265549--3265588
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2.2
18
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8
55
37
2
2
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1.26
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16
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0
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11
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9
0
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0.83
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27
2.0
27
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0
70
49
5
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1.65
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0
0
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1.00
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54
0
0
45
0.99
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17
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17
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52
0
0
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1.00
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53
0
0
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1.00
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2.1
16
100
0
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0
24
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1.53
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2.2
26
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69
61
0
3
34
1.13
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23
1.9
23
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17
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0
4
34
1.16
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15
2.2
15
100
0
66
66
0
21
12
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3282422--3282505
43
1.9
44
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2
125
22
20
32
25
1.98
3282801--3283059
38
6.8
38
87
3
358
21
22
24
30
1.99
3282789--3283057
116
2.3
115
90
2
407
22
22
25
30
1.99
3283054--3283185
45
3.0
45
80
7
139
26
20
26
26
1.99
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19
2.5
19
80
10
60
68
2
0
29
1.02
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133
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10
4
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3.0
30
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0
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0
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0
0.73
3352220--3352253
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2.6
13
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17
52
79
0
20
0
0.73

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425