Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  58  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15910007--15910192
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2.2
85
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0
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16
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50
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15910153--15910213
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16
16
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15911269--15911344
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2.1
37
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1.43
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1.9
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2.2
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0
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14
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18
1.9
18
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20
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93
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18
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112
29
25
16
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4.1
38
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4
207
24
30
19
24
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1.9
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1.99
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2.0
22
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193
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0
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2.0
14
100
0
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28
7
28
35
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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13
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0
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1.92
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31
3.7
31
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2
205
28
26
15
29
1.96
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25
3.1
25
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1
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16
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33
1.95
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27
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1
310
25
21
17
35
1.95
16022063--16022269
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2.6
80
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310
25
21
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35
1.95
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2.3
107
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17
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1.94
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134
1.8
134
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314
27
19
17
35
1.94
16022220--16022456
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203
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10
20
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1.86
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27
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8
21
28
1.82
16022575--16022649
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2.1
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2.0
116
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2.1
15
94
0
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0
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2.0
20
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62
37
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20
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2.1
21
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0
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52
0
0
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1.00
16060820--16060854
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1.9
18
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0
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28
11
34
25
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16062170--16062204
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2.1
17
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1.92
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5.2
39
84
1
227
25
26
22
25
2.00
16068367--16068572
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2.6
81
85
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256
25
26
22
25
2.00
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60
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1.27
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12
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50
17
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1.74
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542
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1686
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17
16
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1.92
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12
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0
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0
0
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23
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2.00
16102144--16102300
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210
25
23
26
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2.00
16102229--16102315
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22
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1
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34
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20
27
1.95
16118744--16118803
26
2.4
25
78
13
70
26
11
5
56
1.55
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16119013--16119049
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2.1
18
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5
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8
0
59
1.27
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16
2.7
16
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13
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31
2
2
63
1.19
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16
2.1
17
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5
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23
11
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55
1.63
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2.0
47
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0
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25
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10
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21
28
28
1.98
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0
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21
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1.99
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15
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0
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16127677--16127764
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30
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202
21
21
28
28
1.99
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21
28
28
1.99
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20
25
1.98
16145401--16145775
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5
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24
20
25
1.98
16146074--16146121
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2.3
21
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0
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2
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0
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1.31
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1.84
16150457--16150616
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0
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1.84
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26
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0
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6
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36
1.81
16156234--16156393
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3.1
52
95
0
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6
23
36
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2.7
457
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1
2288
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11
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2.0
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0
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1.78
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39
2.0
38
85
7
102
40
23
5
30
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16167105--16167241
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2.0
150
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11
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0
4
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0
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0
0
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0.76
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2
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2
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4
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1.45
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0
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0
1.00
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0
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0
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1.39
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2.3
33
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10
5
18
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1.42
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2.0
35
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0
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18
1.79
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17
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1.95
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0
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1.94
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19
17
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0
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13
1.45
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9.6
73
88
3
1000
31
16
21
30
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16200623--16201323
146
4.8
144
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16
21
30
1.95
16200622--16201323
293
2.4
290
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4
1014
31
16
21
30
1.95
16202174--16202249
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2
3
1.16
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2.1
21
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0
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2
2
1.07
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1
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2
3
1.13
16202173--16202251
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2
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1.13
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23
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0
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2.0
52
96
0
194
37
24
7
30
1.83

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425