Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  47  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12595087--12595132
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23
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0
0
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26
26
1.95
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134
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1
481
32
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25
25
1.96
12607363--12607676
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7.0
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26
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62
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2.1
23
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60
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52
1.40
12615157--12615200
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15
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25
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2.9
15
93
0
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22
18
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23
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1.98
12615336--12615398
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4.3
15
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11
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22
22
25
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1.99
12615336--12615398
29
2.1
30
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83
22
22
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1.99
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34
81
0
300
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17
17
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10
78
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2.5
43
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31
25
16
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12618385--12618419
10
3.4
10
92
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61
8
11
2
77
1.10
12620049--12620210
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6.2
26
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33
6
24
35
1.80
12620049--12620210
78
2.1
78
95
0
288
33
6
24
35
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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26
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24
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12623453--12623486
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2.2
16
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5
52
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0
0
29
0.87
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2.6
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17
11
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62
1.52
12623827--12623893
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21
78
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0
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24
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2.1
38
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0
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15
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12641160--12641210
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24
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30
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28
28
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27
1.95
12646805--12646861
11
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10
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1
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1.00
12646794--12646861
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17
2
1.04
12646805--12646861
5
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5
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55
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1.00
12646805--12646861
16
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60
77
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1.00
12646909--12646939
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100
0
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100
0
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2
18
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20
2.0
20
85
0
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2
7
29
1.36
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12654207--12654269
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34
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11
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2.2
26
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103
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25
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0
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0
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0
0
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0
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100
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10
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2.8
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10
50
47
28
0
23
1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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26
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0
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1
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17
2.1
18
89
5
56
61
2
0
36
1.11
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3
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3
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0
2
31
1.04
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1.9
13
100
0
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4
24
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43
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4
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16
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30
1.96
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6
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0
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0
0
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162
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0
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26
1.98
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1.98
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93
0
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20
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1.98
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15
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0
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1.84
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28
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1.84
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25
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1.96
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35
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0
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19
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1.88
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11
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1.89
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29
22
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26
1.99
12732293--12732439
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3.1
47
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224
29
22
21
26
1.99
12732293--12732439
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2.1
71
94
0
258
29
22
21
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12732650--12732713
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1.98
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1.98
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1.97
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137
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58
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0
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0
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0
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2.6
26
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0
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25
22
19
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12793805--12793910
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53
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0
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20
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2.0
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0
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1.9
56
98
0
209
30
9
22
37
1.86

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425