Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  5  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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21
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0
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22
52
1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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22
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9.4
168
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20
18
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1.96
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15.1
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20
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1.96
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5.1
336
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20
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1.96
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149
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30
1.95
1409184--1410189
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13.3
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1186
31
20
16
30
1.95
1410386--1410650
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3.6
73
85
7
363
30
21
18
30
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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21
1.15
1493091--1493117
6
4.5
6
100
0
54
66
0
0
33
0.92
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19
2.0
19
100
0
76
36
15
26
21
1.93
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9
2.8
9
100
0
50
84
0
0
16
0.63
1519520--1519693
20
8.9
20
65
12
58
56
2
5
36
1.34
1519595--1519683
19
4.5
19
79
8
79
56
1
4
38
1.27
1519595--1519683
10
9.0
10
67
20
53
56
1
4
38
1.27
1519584--1519692
40
2.7
39
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114
54
1
5
38
1.35
1519549--1519668
30
4.1
30
68
20
83
56
2
4
36
1.32
1525709--1525759
25
2.1
24
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3
66
58
7
1
31
1.37
1533506--1533617
56
2.0
56
98
0
215
30
13
21
34
1.92
1534701--1534768
34
2.0
34
100
0
136
32
11
8
47
1.71
1535277--1535303
13
2.1
13
100
0
54
40
7
22
29
1.81
1538435--1538460
5
5.2
5
100
0
52
61
0
0
38
0.96
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18
2.1
18
95
0
67
28
31
7
31
1.86
1552854--1552935
41
2.0
41
100
0
164
48
24
12
14
1.78
1555376--1555440
29
2.2
29
81
5
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35
6
7
50
1.56
1561856--1561880
7
3.6
7
100
0
50
36
0
0
64
0.94
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17
2.0
17
88
0
50
29
0
8
61
1.26
1562709--1562739
12
2.6
12
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0
53
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0
25
0
0.82
1563649--1563786
39
3.5
39
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9
104
25
21
24
28
1.99
1563888--1563928
18
2.3
18
87
8
57
51
0
19
29
1.47
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1564465--1564502
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1.9
20
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10
51
47
0
10
42
1.38
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14
2.0
14
100
0
56
57
7
0
35
1.26
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46
5.0
46
84
9
278
21
24
15
39
1.92
1566277--1566352
38
2.0
38
100
0
152
21
26
18
34
1.96
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11
4.7
11
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3
0
32
1.12
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29
2.3
29
80
14
77
47
1
2
47
1.25
1570153--1570195
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6
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0
68
37
0
0
62
0.95
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2
18.0
2
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0
63
50
0
2
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1.15
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15
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15
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56
5
0
38
1.22
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15
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3
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0
0
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0.99
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18
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0
60
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0
2
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1.13
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0
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0
0
0
100
0.00
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0
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2
0
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1.08
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18
3.2
18
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20
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5
3
18
1.21
1593081--1593143
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2.1
31
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6
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20
1.24
1593425--1593461
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16
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13
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64
0
0
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0.94
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0
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3
0
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1.12
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2.3
25
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11
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0
5
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1.23
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26
3.2
26
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0
150
33
4
25
36
1.77
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2.0
26
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7
63
37
20
15
26
1.92
1610227--1610512
137
2.1
136
96
0
518
24
19
24
31
1.98
1611806--1611981
46
3.8
46
81
10
232
20
21
29
28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1611802--1611973
93
1.8
93
96
0
317
20
22
30
27
1.98
1614930--1615007
15
5.4
15
77
10
74
10
16
14
58
1.62
1614925--1615007
43
2.0
42
87
2
121
9
15
16
57
1.63
1614921--1615003
28
2.9
28
80
10
87
10
15
16
56
1.66
1617390--1617565
46
3.8
46
81
10
232
20
21
29
28
1.98
1617386--1617557
93
1.8
93
96
0
317
20
22
30
27
1.98
1622132--1622184
26
2.0
26
82
7
63
39
20
13
26
1.89
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136
2.1
136
95
1
509
24
18
25
31
1.98
1627367--1627425
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19.7
3
73
13
50
37
3
0
59
1.14
1627365--1627425
18
3.4
18
82
13
81
39
3
0
57
1.15

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425