Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  413  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
125732278--125732320
22
2.0
22
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9
52
23
2
0
74
0.93
125732327--125732367
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0
0
43
0.99
125732812--125733028
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5
247
29
17
14
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1.90
125735549--125735578
14
2.1
14
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0
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0
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0
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50
0
0
50
1.00
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17
2.0
17
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38
0
20
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14
3.0
13
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17
55
57
0
2
40
1.12
125748536--125748580
21
2.1
21
84
8
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55
0
8
35
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0
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0
16
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0.64
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2.4
13
94
0
53
83
0
16
0
0.64
125758707--125759080
188
2.0
188
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1
570
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20
19
25
1.96
125761329--125761682
47
7.6
46
71
13
208
22
29
21
27
1.99
125761335--125761682
94
3.7
92
77
8
298
22
29
20
27
1.99
125768047--125768125
8
9.4
8
75
14
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64
1
1
32
1.09
125768060--125768125
17
3.8
17
80
7
87
65
1
1
31
1.11
125768056--125768129
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2.1
36
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0
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2
35
1.19
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3.2
64
62
20
151
29
26
18
26
1.98
125778121--125778407
137
2.1
137
98
0
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31
25
19
24
1.98
125778655--125778707
26
2.0
26
82
7
63
26
15
20
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1.92
125780193--125780302
26
4.2
26
95
0
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33
1.79
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2.0
13
100
0
52
38
0
7
53
1.30
125789539--125789620
42
2.0
42
85
0
110
30
25
14
29
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
125789572--125789677
56
1.9
55
92
5
178
33
28
12
26
1.92
125789777--125789925
31
4.8
31
91
0
235
25
26
20
27
1.99
125791903--125791933
16
1.9
16
100
0
62
25
25
3
45
1.69
125797260--125797324
31
2.1
31
97
0
121
12
30
12
44
1.79
125802133--125802242
58
1.9
58
92
0
184
27
17
6
49
1.71
125802646--125802722
9
8.0
9
71
22
50
12
2
3
80
0.95
125802636--125802685
25
2.0
24
84
11
64
6
10
2
82
0.92
125802697--125802737
12
3.4
12
83
16
50
26
0
0
73
0.84
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5.0
46
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1
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39
14
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21
1.91
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46
4.0
46
90
1
258
40
14
23
21
1.91
125811471--125811548
34
2.2
36
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9
115
41
1
0
57
1.07
125811505--125811575
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3.4
20
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11
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45
0
0
54
0.99
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21
4.9
20
73
19
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40
1
0
58
1.05
125812201--125812228
2
14.0
2
100
0
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50
0
0
50
1.00
125811924--125812600
222
3.1
216
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9
980
40
10
6
43
1.63
125812630--125812686
27
2.1
27
83
6
71
22
26
22
28
1.99
125813589--125813639
26
2.0
26
88
7
77
62
9
0
27
1.26
125813605--125813684
31
2.4
34
81
16
112
60
5
0
35
1.19
125813635--125813680
10
4.5
10
75
24
51
63
0
0
36
0.95
125813714--125813779
21
3.3
21
80
16
77
53
0
0
46
1.00
125813852--125813895
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2.6
18
85
7
65
77
6
0
15
0.97
125824097--125824138
6
6.8
6
97
2
75
50
16
0
33
1.46
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
125830369--125830586
3
73.0
3
72
12
119
63
2
8
25
1.35
125830492--125830586
31
3.1
30
91
5
147
68
2
2
27
1.12
125832074--125832805
44
16.7
44
74
10
541
27
24
16
30
1.97
125832025--125832862
132
6.4
132
92
0
1358
27
24
17
31
1.97
125832917--125833252
68
5.0
68
91
0
503
27
22
24
25
2.00
125832917--125833252
135
2.5
136
90
1
505
27
22
24
25
2.00
125833367--125833491
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2.0
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89
7
195
36
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17
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1.88
125840351--125840607
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3
77
10
215
63
1
7
27
1.30
125842081--125842862
44
17.8
44
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606
27
24
16
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1.97
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6.3
132
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1306
27
24
16
31
1.97
125843194--125843246
21
2.5
22
75
9
56
11
11
16
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1.59
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2.1
27
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15
66
32
1
15
50
1.55
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20
2.1
21
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54
2
0
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2.4
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19
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0
0
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0
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0
0
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1
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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Period
Size
Copy
Number
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Percent
Indels
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24
37
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
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26
27
15
29
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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