Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  374  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
115145187--115145224
14
2.7
14
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0
58
42
10
15
31
1.81
115147608--115147890
18
15.3
18
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12
153
37
15
11
35
1.84
115147599--115147890
36
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35
71
12
176
38
15
10
35
1.83
115147599--115147890
54
5.3
54
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13
198
38
15
10
35
1.83
115147689--115147890
72
2.8
71
79
5
219
38
15
10
35
1.83
115148109--115148142
6
5.5
6
86
6
50
44
17
20
17
1.87
115148107--115148142
12
2.8
13
91
4
56
41
19
22
16
1.90
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2.1
24
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0
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45
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0
0
48
1.00
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93
6
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55
0
0
44
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1.9
20
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1.9
30
96
0
105
31
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7
45
1.73
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13
2.6
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90
4
50
39
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0
52
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0
0
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0.96
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13.7
6
78
13
74
15
2
0
81
0.80
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16
2
0
80
0.82
115167766--115167842
38
2.0
38
87
9
113
16
2
0
80
0.82
115167768--115167858
22
4.4
21
78
17
86
16
4
0
79
0.89
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17
1.9
18
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5
52
23
20
5
50
1.70
115170732--115170764
13
2.6
13
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4
50
39
0
12
48
1.40
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2.0
31
93
0
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11
14
20
53
1.70
115182371--115182464
35
2.7
35
88
0
143
29
8
10
51
1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
115182477--115182510
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2.0
17
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0
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20
2
32
1.67
115187044--115187133
39
2.3
38
84
9
117
51
7
3
37
1.48
115187583--115187613
16
1.9
16
93
0
53
29
3
0
67
1.06
115189738--115189786
24
2.0
24
100
0
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51
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24
12
1.73
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2.0
39
97
2
151
16
15
10
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1.62
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205
7.6
205
92
0
2417
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29
1.97
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4.4
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4
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40
0
0
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6
52
44
0
0
55
0.99
115212605--115212645
21
1.9
22
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5
66
56
4
7
31
1.48
115213057--115213117
31
2.0
31
93
0
104
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11
11
36
1.77
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50
2.8
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2
152
29
15
22
32
1.94
115218848--115218946
37
2.7
37
80
10
114
30
17
25
27
1.97
115221552--115221579
13
2.2
13
100
0
56
28
28
35
7
1.84
115226855--115227062
40
5.2
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5
256
23
21
28
26
1.99
115226851--115227062
80
2.7
80
87
0
300
24
21
27
26
1.99
115234906--115235151
40
6.2
40
89
2
338
23
21
29
26
1.99
115234906--115235151
79
3.1
79
89
2
352
23
21
29
26
1.99
115234906--115235151
119
2.1
119
90
2
388
23
21
29
26
1.99
115236955--115237095
55
2.6
55
79
4
142
29
30
24
16
1.96
115241091--115241117
13
2.1
13
100
0
54
14
33
37
14
1.88
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2.1
36
94
0
130
22
4
33
39
1.73
115261317--115261373
25
2.3
25
90
0
87
45
15
17
21
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
115261480--115261539
25
2.4
25
88
5
86
40
23
23
13
1.90
115261525--115261587
25
2.5
24
75
7
56
34
20
26
17
1.95
115268436--115268495
20
3.0
19
80
9
75
23
8
1
66
1.28
115268438--115268494
30
1.9
30
86
13
82
22
8
1
66
1.29
115269215--115269248
18
1.9
18
88
5
52
23
8
2
64
1.36
115274839--115274902
12
5.1
13
83
16
82
21
1
0
76
0.87
115274839--115274902
18
3.4
18
76
23
69
21
1
0
76
0.87
115274842--115274902
26
2.4
27
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15
85
21
1
0
77
0.86
115276621--115276680
20
3.0
19
80
9
75
23
8
1
66
1.28
115276623--115276679
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1.9
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82
22
8
1
66
1.29
115288300--115288333
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1.9
17
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0
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2
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80
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14
0.95
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16
2.7
16
89
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61
79
6
0
13
0.93
115289443--115289522
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3
13
1.02
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19
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4
79
30
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18
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1.82
115294861--115294891
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2.4
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100
0
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0
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2
16
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115297810--115297847
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58
78
5
0
15
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3
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5
0
15
0.90
115297805--115297848
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54
77
4
2
15
1.04
115301576--115301604
13
2.2
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Period
Size
Copy
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Percent
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Score
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T
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
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1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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2.3
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37
23
12
25
1.91

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425