Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  391  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
120067466--120067574
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1.9
58
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5
150
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22
16
27
1.96
120071974--120072034
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2.7
23
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3
49
1.40
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15
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12
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2
0
25
0.98
120073686--120073728
22
2.0
22
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52
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2
0
25
0.97
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2.0
32
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8
78
48
3
0
48
1.17
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2.6
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81
13
69
64
0
1
33
1.04
120103206--120103252
21
2.3
20
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13
60
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2.1
30
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5
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34
7
0
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2.1
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20
2.0
20
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37
1.60
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24
2.4
27
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3
0
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1.14
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20
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0
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0
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0
9
0
0.46
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0
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2.0
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8
26
1.60
120131692--120131759
24
2.8
24
76
10
75
47
19
16
17
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.5
24
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2
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15
16
1.81
120143572--120143603
2
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2
100
0
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0
0
50
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2.0
22
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2
8
44
1.47
120148143--120148168
2
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2
100
0
52
50
0
0
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2
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0
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0
0
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2.6
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100
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19
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8
0
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120179023--120179140
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2.7
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7
0
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101
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1
64
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19
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16
71
24
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0
67
1.16
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20
99
27
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0
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1.19
120181134--120181171
20
2.0
20
89
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60
39
2
13
44
1.57
120181342--120181395
19
2.8
19
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15
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61
1
1
35
1.18
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6.3
6
87
0
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18
13
15
52
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120182308--120182342
12
2.9
12
100
0
70
17
8
17
57
1.64
120185931--120186065
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77
13
163
28
18
20
32
1.96
120185933--120186101
44
3.7
44
78
10
162
28
21
18
30
1.97
120186076--120186421
134
2.6
134
94
0
586
23
23
22
30
1.99
120186394--120186590
43
4.6
43
80
7
229
22
20
22
34
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
120186435--120186783
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4.0
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87
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393
20
22
21
35
1.96
120186435--120186755
173
1.9
172
82
4
414
20
23
21
34
1.97
120194832--120194873
19
2.2
20
86
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59
47
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19
26
1.74
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39
5.6
39
91
2
323
37
22
26
13
1.91
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9
9.6
9
88
2
100
47
21
5
25
1.73
120206843--120206928
18
4.8
18
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2
111
47
20
5
25
1.72
120206844--120206928
35
2.4
35
84
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107
47
21
5
25
1.73
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6.5
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17
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4
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55
0
0
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64
8
2
26
1.32
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20
2.0
20
94
5
69
60
7
0
31
1.25
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
22
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0
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1.46
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2
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2
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2
0
48
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0
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1.00
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0
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0
1.00
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2
5
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1.32
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3
0
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1.16
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1
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172
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1.96
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20
1.96
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2.3
18
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8
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10
33
12
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
21
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0
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1.75
120293958--120294060
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2.0
51
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1.72
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1.16
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18
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29
5
3
61
1.35
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
120334155--120334200
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1.12
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1.12
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53
0
0
46
1.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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