Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  2  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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40
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0
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27
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2.3
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4
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2
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1.13
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2.5
19
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27
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11.2
132
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38
46
0
15
1.46
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35
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146
37
47
0
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1.45
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2.3
18
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4
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2
2
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1.13
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2.0
49
100
0
198
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20
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2
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2
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0
0
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1.00
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1
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2
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29
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30
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11
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1.9
18
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5
52
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0
5
58
1.22
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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4.2
42
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29
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2.0
85
84
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221
29
28
17
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1.97
501540--501582
22
1.9
23
85
4
61
37
0
4
58
1.19
501041--501617
302
1.9
302
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0
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11
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20
1.50
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25
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24
1.99
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2.2
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230
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25
20
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1.99
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23
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2.3
71
100
0
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18
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258
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17
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1.95
544527--544690
71
2.3
71
100
0
328
18
28
17
35
1.94
544527--544724
71
2.8
70
91
3
258
20
28
17
33
1.95
546993--547132
46
2.9
47
79
14
151
23
18
30
27
1.98
548941--549025
40
2.0
41
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6
136
23
20
27
29
1.99
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21
28
28
1.98
550538--550709
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1.8
93
89
0
272
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21
29
27
1.99
551577--551605
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2.1
14
100
0
58
34
20
0
44
1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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17
13
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3.0
30
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1.66
556133--556308
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12
225
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21
28
28
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4.6
35
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192
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24
10
31
1.90
561254--561424
74
2.4
73
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217
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23
11
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1.90
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3.4
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0
207
22
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28
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1.9
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2.1
22
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19.7
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0
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2.0
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5
31
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20
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1.10
586214--586267
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24
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11
57
28
8
0
63
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
607766--607819
22
2.4
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31
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86
23
10
10
56
1.62
616649--616683
18
1.9
18
88
0
52
71
5
5
17
1.25
619660--619693
17
2.0
17
88
0
50
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0
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31
2.3
31
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621305--621386
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0
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7
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0
58
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13
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1.84
635023--635106
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43
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2
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0
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0
0
50
1.00
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0
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0
0
48
1.00
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32
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27
1.74
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45
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23
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0
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29
2.0
30
89
3
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29
6
17
46
1.74
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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30
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10
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31
2.3
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14
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10
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1.74
682325--682425
28
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28
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26
29
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0
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0
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28
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18
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0
0
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0
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12
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2.3
39
84
11
126
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6
1
38
1.35
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
719937--720138
90
2.3
85
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233
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20
8
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1.84
720234--720320
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9.1
9
70
20
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1.15
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2
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1.20
720521--720622
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2.4
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6
136
36
22
15
26
1.94

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425