Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  410  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
125021748--125021846
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2.2
44
91
7
164
28
24
16
31
1.96
125021853--125022053
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3.0
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2
249
27
19
23
28
1.99
125022154--125022469
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7.5
41
65
10
145
21
24
20
33
1.97
125022099--125022478
85
4.5
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89
2
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24
20
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1.98
125022285--125022428
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3.3
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7
143
17
27
21
34
1.96
125022543--125022671
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2.0
66
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0
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36
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2.4
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0
14
0
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15
2.4
14
85
4
52
0
14
0
85
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2.5
20
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2
10
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125024369--125024410
16
2.5
17
85
14
52
2
9
4
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0.88
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0
70
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0
0
48
1.00
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16
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10
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5
5
20
1.33
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3
79
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146
60
1
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1.31
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18
7.8
18
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198
37
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10
37
1.81
125029460--125029601
35
3.9
36
88
8
200
37
14
10
37
1.81
125029460--125029601
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241
37
14
10
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207
4.5
207
93
0
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23
17
29
1.97
125029999--125030918
413
2.2
413
91
0
1491
29
23
17
29
1.97
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2.4
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83
11
250
22
22
24
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1.99
125032174--125032266
1
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0
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0
11
0
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139
0
12
0
87
0.54
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1.9
13
100
0
50
0
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0
92
0.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
125037981--125038139
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8.8
18
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5
207
38
14
10
37
1.80
125037981--125038131
35
4.2
35
93
2
248
38
13
10
37
1.80
125038532--125038619
3
29.3
3
78
13
92
60
2
5
31
1.33
125041400--125041442
21
2.0
21
91
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25
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0
0
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1.00
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4.8
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4
51
63
0
0
36
0.95
125046371--125046403
12
2.6
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0
0
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0.97
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51
59
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27
6
1.46
125050512--125050567
28
2.0
27
83
10
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33
25
5
35
1.79
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22
2.0
22
81
9
52
13
27
20
37
1.91
125053302--125053352
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2.0
26
92
0
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21
21
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1.99
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0
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0
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1
72
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12
4
4
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1.01
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2.5
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5
55
83
0
9
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2.0
24
100
0
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34
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125068111--125068213
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3.3
33
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17
137
28
0
7
63
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27
1.9
27
100
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104
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0
11
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27
2.7
27
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78
23
0
8
68
1.17
125073259--125073309
14
3.5
14
72
27
52
45
45
0
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1.36
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3
30.0
3
100
0
180
33
0
0
66
0.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
125087593--125087813
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2
343
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16
22
31
1.96
125087797--125087830
16
2.1
16
88
0
50
17
5
5
70
1.28
125087743--125088043
89
3.4
88
78
5
279
29
15
20
34
1.93
125087973--125088006
13
2.6
13
85
0
50
17
8
5
67
1.37
125089878--125089938
11
5.3
11
76
9
50
39
3
4
52
1.39
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22.5
2
95
0
81
48
2
0
48
1.13
125090419--125090489
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2.3
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78
2
81
45
2
19
32
1.65
125092408--125092540
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23
1.91
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2.0
27
100
0
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22
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2.0
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3.5
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1.93
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2.0
119
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1.94
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2.2
20
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1.13
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23
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0
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22
27
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1.91
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21
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2
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1
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Indices
Period
Size
Copy
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Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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G
T
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Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Score
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0
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0.67
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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(0-2)
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0
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0
0
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0
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53
1.12

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425