Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   

This is table  415  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
126082063--126082160
36
2.7
36
73
20
103
39
13
10
36
1.78
126082468--126082579
45
2.5
45
89
1
172
22
30
14
33
1.93
126082653--126083367
205
3.5
205
94
0
1207
28
22
18
30
1.97
126083354--126083446
44
2.1
44
91
0
150
25
29
15
30
1.95
126083377--126083833
44
10.4
44
72
10
335
27
25
17
29
1.98
126083390--126083833
132
3.4
132
92
0
728
26
25
17
30
1.97
126084687--126084753
7
9.7
7
77
19
70
2
11
0
85
0.72
126084687--126084753
8
8.6
8
82
9
61
2
11
0
85
0.72
126084687--126084753
22
3.2
22
78
14
79
2
11
0
85
0.72
126091470--126091537
19
3.7
19
88
7
113
36
16
11
35
1.85
126091968--126092081
30
3.9
31
70
17
82
64
1
5
28
1.26
126092122--126092178
21
2.8
21
75
17
57
66
0
5
28
1.13
126092150--126092280
12
10.7
12
70
19
76
58
4
1
35
1.28
126092150--126092286
26
5.5
25
73
19
87
58
4
1
35
1.27
126092222--126092311
26
3.3
28
80
16
77
60
3
2
34
1.26
126092341--126092399
3
19.7
3
73
13
50
59
0
3
37
1.14
126092341--126092401
18
3.4
17
82
8
77
57
0
3
39
1.15
126094275--126094325
20
2.5
20
87
0
75
45
11
19
23
1.83
126095245--126095353
26
4.2
26
96
1
184
33
5
23
36
1.78
126096828--126096880
26
2.0
26
85
7
72
37
22
15
24
1.92
126102218--126102327
26
4.2
26
92
0
175
33
5
23
37
1.78
126104054--126104101
21
2.3
21
85
7
62
12
2
52
33
1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
126104108--126104392
136
2.1
136
97
0
543
24
18
24
31
1.98
126109881--126109967
3
28.0
3
73
15
61
57
1
9
32
1.38
126109878--126109949
14
4.8
16
77
19
68
58
1
9
30
1.39
126109881--126109967
15
6.5
13
75
21
74
57
1
9
32
1.38
126110117--126110168
3
17.0
3
92
4
86
67
1
0
30
1.02
126110600--126110650
3
17.0
3
100
0
102
66
0
0
33
0.92
126116717--126116749
11
3.0
11
95
0
57
39
6
0
54
1.25
126119837--126119875
18
2.2
18
85
0
51
38
10
2
48
1.51
126119905--126119938
2
17.0
2
93
0
59
50
2
0
47
1.16
126120982--126121502
131
4.0
131
87
3
647
25
18
19
35
1.95
126122158--126122405
118
2.1
118
92
2
408
43
11
7
37
1.68
126122421--126122449
2
14.5
2
100
0
58
48
0
0
51
1.00
126123129--126123173
13
3.3
14
77
22
51
60
0
4
35
1.17
126123229--126123262
17
2.0
17
88
11
52
70
0
29
0
0.87
126125151--126125203
20
2.7
20
90
0
79
18
35
32
13
1.90
126125381--126125471
44
2.1
44
89
0
137
19
17
34
28
1.95
126128354--126128409
27
2.0
28
93
3
96
51
5
0
42
1.24
126130394--126130433
19
2.0
22
85
14
59
32
47
2
17
1.61
126130495--126130661
27
6.2
27
92
3
239
34
22
25
17
1.96
126130495--126130663
54
3.1
54
92
1
268
34
23
24
17
1.96
126132283--126132392
26
4.2
26
97
0
184
36
24
5
33
1.79
126133631--126133919
3
95.7
3
70
12
137
30
7
2
59
1.37
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
126133751--126133915
20
8.7
20
70
16
86
30
7
2
59
1.39
126133834--126133922
17
4.9
17
74
9
70
30
8
1
59
1.35
126133949--126133981
17
1.9
17
88
11
50
24
12
3
60
1.46
126134053--126134123
28
2.4
30
81
11
83
32
4
2
60
1.30
126134091--126134140
18
2.8
18
74
14
50
32
8
4
56
1.47
126134165--126134210
23
2.0
23
87
8
67
32
8
0
58
1.28
126136034--126136104
31
2.4
31
79
9
85
45
1
11
42
1.48
126146752--126146778
13
2.1
13
100
0
54
22
22
7
48
1.75
126153027--126153057
11
2.8
11
100
0
62
29
32
19
19
1.96
126155847--126156000
77
2.0
77
96
0
281
22
19
17
40
1.91
126157789--126157813
12
2.1
12
100
0
50
84
0
0
16
0.63
126157830--126157900
28
2.4
30
81
9
85
47
1
0
50
1.09
126159671--126159704
2
17.0
2
100
0
68
50
0
0
50
1.00
126166510--126166544
6
5.8
6
100
0
70
68
0
0
31
0.90
126171455--126171488
16
2.2
16
89
5
52
50
0
2
47
1.16
126179654--126179688
18
1.9
18
88
0
52
40
0
5
54
1.24
126180036--126180083
20
2.5
19
80
12
55
58
2
0
39
1.10
126180221--126180300
31
2.6
31
83
0
97
32
17
8
41
1.80
126185538--126185568
2
15.5
2
100
0
62
48
0
0
51
1.00
126189745--126189772
6
4.7
6
100
0
56
14
0
0
85
0.59
126190546--126190614
24
2.8
24
78
8
59
62
0
1
36
1.04
126190544--126190614
26
2.8
26
74
10
74
61
0
1
36
1.05
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
126192912--126192959
2
24.0
2
86
0
69
50
0
47
2
1.12
126196010--126196061
21
2.5
20
79
17
61
30
1
1
65
1.14
126196041--126196122
37
2.2
37
82
10
96
36
3
1
58
1.24
126196089--126196134
19
2.4
19
85
7
67
36
4
0
58
1.18
126196070--126196134
19
3.4
18
78
19
62
38
3
0
58
1.14
126208774--126208822
19
2.6
19
80
0
53
46
6
8
38
1.58
126209955--126209983
15
2.0
15
93
6
51
62
0
3
34
1.12
126210129--126210158
2
15.0
2
100
0
60
50
0
0
50
1.00
126210218--126210278
27
2.3
28
86
8
83
42
1
1
54
1.20
126211184--126211224
3
13.7
3
100
0
82
34
0
0
65
0.93
126213986--126214019
8
4.1
8
85
7
50
32
0
2
64
1.08
126214368--126214417
21
2.3
22
80
13
59
46
2
0
52
1.12
126214734--126214769
18
1.9
18
88
5
54
19
11
0
69
1.18
126216722--126216748
2
13.5
2
100
0
54
51
0
0
48
1.00
126220722--126220784
31
2.0
31
93
0
108
39
15
12
31
1.85
126220860--126220889
14
2.1
14
93
0
51
40
10
6
43
1.64
126228236--126228260
2
12.5
2
100
0
50
48
0
0
52
1.00
126228438--126228487
26
1.9
26
100
0
100
40
0
18
42
1.50
126233327--126233433
42
2.5
42
87
3
153
28
28
14
28
1.95
126233391--126233516
49
2.6
48
85
3
166
30
28
15
26
1.96
126233585--126233733
31
4.8
31
92
0
244
26
28
19
26
1.99
126233709--126233837
50
2.5
51
86
2
179
25
23
15
35
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
126240838--126240904
35
1.9
35
82
11
84
37
2
2
56
1.30
126249072--126249102
15
2.1
15
100
0
62
25
29
19
25
1.99
126252645--126252709
30
2.2
29
83
8
78
49
12
7
30
1.68
126261996--126262025
15
2.0
15
93
0
51
33
3
30
33
1.74
126273802--126273863
32
1.9
32
96
0
115
45
9
12
32
1.75
126274623--126274659
15
2.4
16
86
13
60
32
0
0
67
0.91
126280839--126280887
22
2.4
19
75
18
53
65
0
12
22
1.26
126282090--126282138
25
2.2
20
82
17
53
63
2
4
30
1.24
126291309--126291349
18
2.4
17
88
8
64
14
0
2
82
0.76
126294096--126294158
30
2.1
30
96
0
117
38
7
11
42
1.70
126295975--126296006
3
11.0
3
93
6
57
68
0
0
31
0.90
126304245--126304512
45
6.2
44
92
3
350
34
6
3
55
1.41
126304245--126304512
85
3.1
87
88
4
355
34
6
3
55
1.41
126304381--126304498
19
5.2
24
61
30
62
34
4
1
59
1.27
126304272--126304512
88
2.8
90
88
6
311
34
5
2
56
1.38
126306002--126306142
70
2.0
70
94
0
246
41
15
14
29
1.86
126306641--126306695
9
5.6
10
77
14
53
63
1
1
32
1.15
126306877--126306950
35
2.1
36
94
2
132
48
8
24
18
1.75
126307091--126307136
24
1.9
24
90
0
74
60
0
13
26
1.32
126308154--126308223
25
2.8
25
91
8
124
50
18
7
24
1.72
126310579--126310718
69
2.0
70
92
1
237
38
16
15
29
1.90
126311269--126311293
8
3.1
8
100
0
50
24
0
0
76
0.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
126313433--126313833
46
8.6
46
82
8
479
38
13
25
22
1.91
126314131--126314163
17
2.0
17
94
5
59
48
0
15
36
1.45
126316245--126316325
26
3.1
26
75
15
78
55
3
6
34
1.42
126316693--126316731
2
20.5
2
84
10
55
56
0
0
43
0.99
126316693--126316731
15
2.7
15
92
4
62
56
0
0
43
0.99
126316907--126316936
2
15.0
2
92
0
51
46
0
0
53
1.00
126318294--126318334
20
2.1
19
86
4
55
65
0
0
34
0.93
126318431--126318494
20
3.3
19
72
12
58
67
3
1
28
1.15
126318430--126318489
18
3.0
20
76
16
61
68
3
0
28
1.05
126318849--126318894
24
1.9
24
90
0
74
60
0
13
26
1.32

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425