Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr08 129432109 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129432109

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  29  of  425  ( 50925 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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21
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1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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T
Entropy
(0-2)
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19
1.68
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17
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20
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2.0
42
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54
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19
1.70
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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189
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1.37
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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1.31
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8
3.1
8
100
0
50
28
0
0
72
0.86
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3
8.7
3
100
0
52
69
0
30
0
0.89
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14
2.9
14
86
6
50
41
0
4
53
1.21
7488755--7488894
27
5.2
28
87
5
166
34
22
25
18
1.96
7489310--7489346
8
4.6
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93
0
65
2
24
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26
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22
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10
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27
3
0
69
1.04
7492037--7492073
15
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15
95
4
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27
0
0
72
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22
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10
10
5
75
1.19
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18
1.9
18
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54
28
0
11
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1.32
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15
2.7
15
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15
27
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16
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16
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0
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29
0
19
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22
2.2
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3.0
19
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0
5
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1.23
7504443--7504506
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0
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0
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2
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2
100
0
54
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0
0
48
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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21
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0
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2
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1.49
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19
2.1
18
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0
7
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0
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2
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2
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0
0
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1.00
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40
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21
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2
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0
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0
3
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1.19
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6
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23
1.33
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16
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21
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0
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0
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0
0
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0
0
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3.9
205
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29
1.97
7523047--7523836
411
1.9
408
88
2
1183
29
22
18
29
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22
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6
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23
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7535657--7535896
3
80.3
3
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14
95
57
2
7
32
1.41
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7535896--7535927
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2.0
16
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0
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21
1.71
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59
62
0
6
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1.21
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0
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0
0
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63
0
0
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2.0
30
100
0
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18
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2
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4.3
11
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6
0
48
1.28

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425